More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1452 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_1452  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 355 aa  716    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.678727  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3612  MscS Mechanosensitive ion channel  51.88 
 
 		 374 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649067 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4689  MscS Mechanosensitive ion channel  51.88 
 
 		 374 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_003296  RS00392  hypothetical protein  51.01 
 
 		 377 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.65965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20120  Mechanosensitive ion channel family protein  47.26 
 
 		 418 aa  319  5e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  47.1 
 
 		 362 aa  318  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0172  MscS mechanosensitive ion channel  46.09 
 
 		 375 aa  313  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2171  MscS mechanosensitive ion channel  48.34 
 
 		 374 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1352  MscS mechanosensitive ion channel  48.35 
 
 		 376 aa  306  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.308859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1366  MscS Mechanosensitive ion channel  47.27 
 
 		 377 aa  305  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0389612  hitchhiker  0.000813003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1381  MscS Mechanosensitive ion channel  47.27 
 
 		 377 aa  305  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.524748 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1920  MscS Mechanosensitive ion channel  47.27 
 
 		 377 aa  305  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000103017  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2101  MscS Mechanosensitive ion channel  47.42 
 
 		 377 aa  305  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188968 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1350  MscS Mechanosensitive ion channel  47.27 
 
 		 377 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000205244  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3360  hypothetical protein  44.7 
 
 		 374 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4007  MscS mechanosensitive ion channel  44.83 
 
 		 376 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0987654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2398  MscS mechanosensitive ion channel  44.7 
 
 		 374 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3649  mechanosensitive ion channel family protein  40.62 
 
 		 374 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3357  MscS Mechanosensitive ion channel  44.54 
 
 		 376 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1822  MscS mechanosensitive ion channel  40.34 
 
 		 374 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00396347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4608  MscS mechanosensitive ion channel  47.78 
 
 		 386 aa  281  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.247282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0905  MscS Mechanosensitive ion channel  44.41 
 
 		 373 aa  277  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2152  MscS mechanosensitive ion channel  41.79 
 
 		 377 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4932  MscS Mechanosensitive ion channel  36.52 
 
 		 400 aa  259  6e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4427  MscS Mechanosensitive ion channel  47.74 
 
 		 349 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0238849  normal  0.125106 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0707  MscS Mechanosensitive ion channel  46.08 
 
 		 344 aa  196  5.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07431  small mechanosensitive ion channel  33.23 
 
 		 343 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.1802 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1849  small mechanosensitive ion channel  35.86 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.00611524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06981  small mechanosensitive ion channel  39.29 
 
 		 338 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.247932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07011  small mechanosensitive ion channel  39.17 
 
 		 343 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184839  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0075  small-conductance mechanosensitive channel  39.29 
 
 		 338 aa  179  7e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.221122  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0635  small mechanosensitive ion channel  38.71 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.352398  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0803  small mechanosensitive ion channel  35.89 
 
 		 342 aa  172  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4819  MscS mechanosensitive ion channel  37.19 
 
 		 392 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06911  small mechanosensitive ion channel  39.17 
 
 		 343 aa  166  8e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412375  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06621  small mechanosensitive ion channel  39.17 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.16712  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2160  MscS mechanosensitive ion channel  32.29 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0650836  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  27.39 
 
 		 380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  26.06 
 
 		 381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  32.8 
 
 		 352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1409  MscS mechanosensitive ion channel  32.8 
 
 		 351 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5290  MscS mechanosensitive ion channel  34.69 
 
 		 371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.716182  normal  0.882551 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  32.4 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4500  MscS Mechanosensitive ion channel  34.21 
 
 		 662 aa  126  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  26.48 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1267  MscS mechanosensitive ion channel  32.8 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0042  MscS Mechanosensitive ion channel  33.51 
 
 		 375 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634821  normal  0.103785 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  30.45 
 
 		 467 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  28.53 
 
 		 624 aa  117  3e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  31.17 
 
 		 286 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  31.17 
 
 		 286 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  31.17 
 
 		 286 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  31.17 
 
 		 286 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  30.74 
 
 		 286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  28.14 
 
 		 369 aa  112  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  25.57 
 
 		 433 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  26.89 
 
 		 431 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4048  MscS mechanosensitive ion channel  30.88 
 
 		 569 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138882  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  27.71 
 
 		 433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  28.41 
 
 		 286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  28.41 
 
 		 286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  28.41 
 
 		 286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  28.41 
 
 		 286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  28.41 
 
 		 286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  28.41 
 
 		 286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  28.41 
 
 		 286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  28.41 
 
 		 286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0883  MscS mechanosensitive ion channel  26.03 
 
 		 380 aa  110  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  28.41 
 
 		 291 aa  110  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  29.08 
 
 		 633 aa  109  8.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 362 aa  109  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4194  MscS mechanosensitive ion channel  29.29 
 
 		 562 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0910  MscS mechanosensitive ion channel  23.78 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505459  normal  0.0192096 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  31.44 
 
 		 354 aa  107  4e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  29.38 
 
 		 426 aa  106  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  29.07 
 
 		 284 aa  106  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  27.85 
 
 		 384 aa  105  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2594  MscS mechanosensitive ion channel  25.85 
 
 		 388 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0922  MscS mechanosensitive ion channel  32.04 
 
 		 456 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837868 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  28.75 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0942  MscS Mechanosensitive ion channel  28.65 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000347454  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3942  MscS mechanosensitive ion channel  27.19 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.639966 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  27.53 
 
 		 682 aa  101  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1500  MscS mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 614 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  28.44 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0641  hypothetical protein  29.35 
 
 		 543 aa  100  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  28.07 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  26.64 
 
 		 274 aa  100  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  26.52 
 
 		 283 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  26.43 
 
 		 275 aa  100  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1462  small-conductance mechanosensitive channel protein  28.3 
 
 		 373 aa  98.6  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1154  hypothetical protein  29.56 
 
 		 363 aa  98.6  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0298455  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  27.27 
 
 		 288 aa  98.2  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  27.8 
 
 		 563 aa  98.2  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  27.23 
 
 		 288 aa  97.4  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  29.77 
 
 		 292 aa  97.4  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4873  MscS Mechanosensitive ion channel  23.97 
 
 		 567 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0247  mechanosensitive ion channel family protein  31.35 
 
 		 378 aa  97.4  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0253  mechanosensitive ion channel family protein  30.81 
 
 		 378 aa  96.3  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  28.57 
 
 		 288 aa  95.9  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>