More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0075 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_06981  small mechanosensitive ion channel  97.93 
 
 		 338 aa  673    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.247932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0075  small-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 338 aa  687    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.221122  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07431  small mechanosensitive ion channel  65.68 
 
 		 343 aa  481  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.1802 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06621  small mechanosensitive ion channel  54.93 
 
 		 343 aa  339  4e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.16712  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0635  small mechanosensitive ion channel  56.33 
 
 		 343 aa  339  5e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.352398  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06911  small mechanosensitive ion channel  54.93 
 
 		 343 aa  326  3e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412375  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07011  small mechanosensitive ion channel  55.16 
 
 		 343 aa  322  8e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184839  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1849  small mechanosensitive ion channel  44.69 
 
 		 340 aa  314  1.9999999999999998e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.00611524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0803  small mechanosensitive ion channel  44.31 
 
 		 342 aa  296  4e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4932  MscS Mechanosensitive ion channel  32.65 
 
 		 400 aa  196  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0905  MscS Mechanosensitive ion channel  34.06 
 
 		 373 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4427  MscS Mechanosensitive ion channel  31.27 
 
 		 349 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0238849  normal  0.125106 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1452  MscS mechanosensitive ion channel  39.29 
 
 		 355 aa  179  9e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.678727  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  38.24 
 
 		 362 aa  172  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4689  MscS Mechanosensitive ion channel  33.69 
 
 		 374 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3612  MscS Mechanosensitive ion channel  33.69 
 
 		 374 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649067 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0172  MscS mechanosensitive ion channel  39.22 
 
 		 375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3649  mechanosensitive ion channel family protein  34.85 
 
 		 374 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1822  MscS mechanosensitive ion channel  37.32 
 
 		 374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00396347  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00392  hypothetical protein  39.32 
 
 		 377 aa  164  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.65965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2152  MscS mechanosensitive ion channel  39.89 
 
 		 377 aa  160  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1352  MscS mechanosensitive ion channel  36.32 
 
 		 376 aa  160  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.308859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0707  MscS Mechanosensitive ion channel  37.02 
 
 		 344 aa  156  6e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3360  hypothetical protein  36.1 
 
 		 374 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2398  MscS mechanosensitive ion channel  36.1 
 
 		 374 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2171  MscS mechanosensitive ion channel  35.61 
 
 		 374 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20120  Mechanosensitive ion channel family protein  33.5 
 
 		 418 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4007  MscS mechanosensitive ion channel  36.76 
 
 		 376 aa  150  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0987654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2160  MscS mechanosensitive ion channel  31.79 
 
 		 400 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0650836  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3357  MscS Mechanosensitive ion channel  36.27 
 
 		 376 aa  146  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1381  MscS Mechanosensitive ion channel  30.91 
 
 		 377 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.524748 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1920  MscS Mechanosensitive ion channel  30.91 
 
 		 377 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000103017  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1366  MscS Mechanosensitive ion channel  30.91 
 
 		 377 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0389612  hitchhiker  0.000813003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1350  MscS Mechanosensitive ion channel  30.91 
 
 		 377 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000205244  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2101  MscS Mechanosensitive ion channel  31.02 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188968 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4819  MscS mechanosensitive ion channel  35.92 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  31.48 
 
 		 354 aa  140  3e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4608  MscS mechanosensitive ion channel  34.31 
 
 		 386 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.247282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 426 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1409  MscS mechanosensitive ion channel  26.88 
 
 		 351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  29.18 
 
 		 352 aa  124  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  26.05 
 
 		 467 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  25.62 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  32.27 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  29.66 
 
 		 356 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1267  MscS mechanosensitive ion channel  25.93 
 
 		 351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4500  MscS Mechanosensitive ion channel  27.95 
 
 		 662 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  28.8 
 
 		 275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  28.8 
 
 		 275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  28.4 
 
 		 275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0042  MscS Mechanosensitive ion channel  29.66 
 
 		 375 aa  109  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634821  normal  0.103785 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  26.8 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  28.4 
 
 		 275 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  27.12 
 
 		 380 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  27.01 
 
 		 381 aa  106  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 274 aa  106  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  23.12 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  22.94 
 
 		 431 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  26.07 
 
 		 433 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  25.96 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  26.36 
 
 		 269 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  26.8 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  26.34 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  26.4 
 
 		 275 aa  100  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  29.76 
 
 		 288 aa  98.6  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  24.77 
 
 		 384 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  24.5 
 
 		 359 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  23.68 
 
 		 366 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1300  MscS mechanosensitive ion channel  25.21 
 
 		 343 aa  97.4  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.987941  hitchhiker  0.00895683 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  21.8 
 
 		 362 aa  97.4  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  32.47 
 
 		 342 aa  97.1  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  26.89 
 
 		 361 aa  97.1  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  24.33 
 
 		 274 aa  95.5  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  25.32 
 
 		 369 aa  95.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  25.69 
 
 		 288 aa  95.5  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 274 aa  95.1  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0922  MscS mechanosensitive ion channel  30.51 
 
 		 456 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837868 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  25.88 
 
 		 383 aa  94.4  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  27.06 
 
 		 288 aa  94.4  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  24.91 
 
 		 274 aa  93.6  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1462  small-conductance mechanosensitive channel protein  28.7 
 
 		 373 aa  93.6  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  25.59 
 
 		 383 aa  93.6  5e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1500  MscS mechanosensitive ion channel  22.84 
 
 		 614 aa  93.2  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  27.19 
 
 		 286 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  26.73 
 
 		 286 aa  92.8  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  26.73 
 
 		 286 aa  92.8  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  26.73 
 
 		 286 aa  92.8  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  26.73 
 
 		 286 aa  92.8  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  25.49 
 
 		 276 aa  92.8  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  22.09 
 
 		 362 aa  92.8  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1900  MscS mechanosensitive ion channel  30.05 
 
 		 240 aa  92.4  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0998935  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  24.81 
 
 		 281 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  25.2 
 
 		 275 aa  92  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  25.09 
 
 		 286 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  25.09 
 
 		 286 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1848  MscS family hypothetical protein  25 
 
 		 343 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  25.09 
 
 		 286 aa  91.3  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>