More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0689 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 351 aa  694    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1409  MscS mechanosensitive ion channel  97.72 
 
 		 351 aa  624  1e-178  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1267  MscS mechanosensitive ion channel  96.87 
 
 		 351 aa  597  1e-170  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  74.36 
 
 		 352 aa  489  1e-137  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  49.13 
 
 		 354 aa  333  3e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  38.89 
 
 		 380 aa  219  6e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  34.76 
 
 		 381 aa  216  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4500  MscS Mechanosensitive ion channel  35.28 
 
 		 662 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  40.27 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0042  MscS Mechanosensitive ion channel  31.4 
 
 		 375 aa  170  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634821  normal  0.103785 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4427  MscS Mechanosensitive ion channel  30.84 
 
 		 349 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0238849  normal  0.125106 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  33.43 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  29.12 
 
 		 431 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  29.71 
 
 		 433 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  29.71 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  39.04 
 
 		 426 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  33.45 
 
 		 682 aa  160  3e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0707  MscS Mechanosensitive ion channel  32.38 
 
 		 344 aa  159  5e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  29.14 
 
 		 362 aa  159  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4932  MscS Mechanosensitive ion channel  28.69 
 
 		 400 aa  159  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  30.09 
 
 		 362 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  27.22 
 
 		 369 aa  156  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  27.35 
 
 		 360 aa  155  9e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  29.5 
 
 		 467 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4873  MscS Mechanosensitive ion channel  30.41 
 
 		 567 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4048  MscS mechanosensitive ion channel  36.7 
 
 		 569 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138882  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  30.66 
 
 		 366 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1154  hypothetical protein  34.09 
 
 		 363 aa  153  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0298455  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  29.38 
 
 		 359 aa  153  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0905  MscS Mechanosensitive ion channel  30.19 
 
 		 373 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  27.95 
 
 		 364 aa  151  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4194  MscS mechanosensitive ion channel  35.45 
 
 		 562 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  37.42 
 
 		 361 aa  149  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  26.84 
 
 		 624 aa  149  7e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4819  MscS mechanosensitive ion channel  34.51 
 
 		 392 aa  149  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  28.95 
 
 		 627 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0803  small mechanosensitive ion channel  27.41 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1452  MscS mechanosensitive ion channel  32.4 
 
 		 355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.678727  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0289  mechanosensitive ion channel family protein  28.42 
 
 		 627 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.658149  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2171  MscS mechanosensitive ion channel  36.18 
 
 		 374 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2398  MscS mechanosensitive ion channel  36.68 
 
 		 374 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  31.17 
 
 		 633 aa  146  6e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0263  mechanosensitive ion channel family protein  28.69 
 
 		 627 aa  145  8.000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1849  small mechanosensitive ion channel  28.87 
 
 		 340 aa  145  9e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.00611524  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3360  hypothetical protein  36.18 
 
 		 374 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3649  mechanosensitive ion channel family protein  34.78 
 
 		 374 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  35.34 
 
 		 369 aa  144  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0253  mechanosensitive ion channel family protein  37.3 
 
 		 378 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0247  mechanosensitive ion channel family protein  37.3 
 
 		 378 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07431  small mechanosensitive ion channel  28.21 
 
 		 343 aa  142  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.1802 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1822  MscS mechanosensitive ion channel  34.78 
 
 		 374 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00396347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1500  MscS mechanosensitive ion channel  35.15 
 
 		 614 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1578  small-conductance mechanosensitive channel  37.98 
 
 		 534 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00006998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06981  small mechanosensitive ion channel  26.23 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.247932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  30.7 
 
 		 413 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0075  small-conductance mechanosensitive channel  24.65 
 
 		 338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.221122  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0883  MscS mechanosensitive ion channel  31.53 
 
 		 380 aa  136  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0942  MscS Mechanosensitive ion channel  29.91 
 
 		 377 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000347454  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 384 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  26.6 
 
 		 362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0635  small mechanosensitive ion channel  32.7 
 
 		 343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.352398  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3612  MscS Mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 374 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649067 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4689  MscS Mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 374 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0910  MscS mechanosensitive ion channel  27.51 
 
 		 400 aa  134  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505459  normal  0.0192096 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1462  small-conductance mechanosensitive channel protein  31.12 
 
 		 373 aa  133  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0922  MscS mechanosensitive ion channel  30.48 
 
 		 456 aa  133  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837868 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2594  MscS mechanosensitive ion channel  30.09 
 
 		 388 aa  133  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0172  MscS mechanosensitive ion channel  29.68 
 
 		 375 aa  132  7.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1650  MscS mechanosensitive ion channel  31.23 
 
 		 570 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598293 
 
 
-
 
NC_003296  RS00392  hypothetical protein  30.59 
 
 		 377 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.65965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2152  MscS mechanosensitive ion channel  26.55 
 
 		 377 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1900  MscS mechanosensitive ion channel  37.75 
 
 		 240 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0998935  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  33.71 
 
 		 624 aa  130  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  31.1 
 
 		 484 aa  130  5.0000000000000004e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1943  MscS mechanosensitive ion channel  34.95 
 
 		 533 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000658199  decreased coverage  0.00758396 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1920  MscS Mechanosensitive ion channel  27.09 
 
 		 377 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000103017  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1381  MscS Mechanosensitive ion channel  27.09 
 
 		 377 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.524748 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1366  MscS Mechanosensitive ion channel  27.09 
 
 		 377 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0389612  hitchhiker  0.000813003 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06621  small mechanosensitive ion channel  27.01 
 
 		 343 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.16712  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2101  MscS Mechanosensitive ion channel  27.12 
 
 		 377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188968 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1350  MscS Mechanosensitive ion channel  27.09 
 
 		 377 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000205244  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1446  MscS mechanosensitive ion channel  28.53 
 
 		 648 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.770596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07011  small mechanosensitive ion channel  30.81 
 
 		 343 aa  126  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184839  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1300  MscS mechanosensitive ion channel  31.98 
 
 		 343 aa  126  6e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.987941  hitchhiker  0.00895683 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0970  small-conductance mechanosensitive ion channel  28.53 
 
 		 650 aa  126  7e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371389 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  27.56 
 
 		 342 aa  125  9e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1295  MscS mechanosensitive ion channel  31.6 
 
 		 391 aa  125  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20120  Mechanosensitive ion channel family protein  29.67 
 
 		 418 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06911  small mechanosensitive ion channel  33.02 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412375  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0641  hypothetical protein  29.32 
 
 		 543 aa  124  3e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0460  putative mechanosensitive ion channel  31.04 
 
 		 357 aa  123  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1488  MscS family inner membrane protein YnaI  32.72 
 
 		 343 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.445516  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1848  MscS family hypothetical protein  32.72 
 
 		 343 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1786  MscS family inner membrane protein YnaI  32.72 
 
 		 343 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0416525  normal  0.388102 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1788  MscS family inner membrane protein YnaI  32.72 
 
 		 343 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150216 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1352  MscS mechanosensitive ion channel  30.56 
 
 		 376 aa  122  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.308859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1670  MscS family inner membrane protein YnaI  32.72 
 
 		 343 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.107683 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1791  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  32.72 
 
 		 343 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2294  MscS mechanosensitive ion channel  32.72 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01318  hypothetical protein  32.72 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.831445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>