More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1849 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1849  small mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 340 aa  688    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.00611524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0803  small mechanosensitive ion channel  53.89 
 
 		 342 aa  373  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07431  small mechanosensitive ion channel  46.39 
 
 		 343 aa  326  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.1802 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06981  small mechanosensitive ion channel  45 
 
 		 338 aa  315  5e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.247932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0075  small-conductance mechanosensitive channel  44.69 
 
 		 338 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.221122  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0635  small mechanosensitive ion channel  44.98 
 
 		 343 aa  272  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.352398  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07011  small mechanosensitive ion channel  44.08 
 
 		 343 aa  262  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184839  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06621  small mechanosensitive ion channel  45.42 
 
 		 343 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.16712  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06911  small mechanosensitive ion channel  45.1 
 
 		 343 aa  258  8e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412375  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0905  MscS Mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4427  MscS Mechanosensitive ion channel  31.83 
 
 		 349 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0238849  normal  0.125106 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4932  MscS Mechanosensitive ion channel  34.57 
 
 		 400 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1452  MscS mechanosensitive ion channel  35.86 
 
 		 355 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.678727  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3649  mechanosensitive ion channel family protein  37.7 
 
 		 374 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  38.46 
 
 		 362 aa  180  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1822  MscS mechanosensitive ion channel  39.13 
 
 		 374 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00396347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2152  MscS mechanosensitive ion channel  33.02 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0172  MscS mechanosensitive ion channel  36.7 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3612  MscS Mechanosensitive ion channel  35.59 
 
 		 374 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649067 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4689  MscS Mechanosensitive ion channel  35.59 
 
 		 374 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_003296  RS00392  hypothetical protein  31.15 
 
 		 377 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.65965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20120  Mechanosensitive ion channel family protein  38.79 
 
 		 418 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1352  MscS mechanosensitive ion channel  36.92 
 
 		 376 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.308859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0707  MscS Mechanosensitive ion channel  29.57 
 
 		 344 aa  161  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3360  hypothetical protein  33.18 
 
 		 374 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2398  MscS mechanosensitive ion channel  33.18 
 
 		 374 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1920  MscS Mechanosensitive ion channel  36.76 
 
 		 377 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000103017  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1381  MscS Mechanosensitive ion channel  36.76 
 
 		 377 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.524748 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1366  MscS Mechanosensitive ion channel  36.76 
 
 		 377 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0389612  hitchhiker  0.000813003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1350  MscS Mechanosensitive ion channel  36.76 
 
 		 377 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000205244  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2171  MscS mechanosensitive ion channel  33.66 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2101  MscS Mechanosensitive ion channel  36.45 
 
 		 377 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188968 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4007  MscS mechanosensitive ion channel  35.19 
 
 		 376 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0987654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3357  MscS Mechanosensitive ion channel  34.72 
 
 		 376 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4608  MscS mechanosensitive ion channel  35.64 
 
 		 386 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.247282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1409  MscS mechanosensitive ion channel  30.5 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  28.93 
 
 		 351 aa  132  9e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  31.23 
 
 		 356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4819  MscS mechanosensitive ion channel  33.65 
 
 		 392 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  28.53 
 
 		 354 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1267  MscS mechanosensitive ion channel  30.12 
 
 		 351 aa  129  6e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  30.03 
 
 		 352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2160  MscS mechanosensitive ion channel  34.48 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0650836  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  27.76 
 
 		 380 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  26.79 
 
 		 381 aa  119  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  25.23 
 
 		 467 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  32.89 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  23.99 
 
 		 433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  28.41 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  23.99 
 
 		 433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  30.67 
 
 		 484 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0942  MscS Mechanosensitive ion channel  24.76 
 
 		 377 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000347454  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4500  MscS Mechanosensitive ion channel  27.44 
 
 		 662 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  23.05 
 
 		 431 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  25.78 
 
 		 362 aa  105  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1154  hypothetical protein  27.11 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0298455  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  25.93 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0910  MscS mechanosensitive ion channel  25.86 
 
 		 400 aa  103  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505459  normal  0.0192096 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0922  MscS mechanosensitive ion channel  30.65 
 
 		 456 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837868 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  27.84 
 
 		 366 aa  102  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  28.11 
 
 		 864 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  28.9 
 
 		 299 aa  100  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  28.24 
 
 		 345 aa  99.8  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2594  MscS mechanosensitive ion channel  25.47 
 
 		 388 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  31.42 
 
 		 369 aa  98.2  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0042  MscS Mechanosensitive ion channel  28.02 
 
 		 375 aa  98.2  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634821  normal  0.103785 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1500  MscS mechanosensitive ion channel  29.85 
 
 		 614 aa  96.3  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  29.29 
 
 		 281 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  24.06 
 
 		 369 aa  95.9  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0289  mechanosensitive ion channel family protein  25.43 
 
 		 627 aa  94.7  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.658149  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0541  MscS mechanosensitive ion channel  26.89 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0263  mechanosensitive ion channel family protein  25.43 
 
 		 627 aa  95.1  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1848  MscS family hypothetical protein  30.12 
 
 		 343 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  25.43 
 
 		 627 aa  93.2  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  28.23 
 
 		 286 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  28.23 
 
 		 286 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  28.23 
 
 		 286 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  28.23 
 
 		 286 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  28.23 
 
 		 286 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  28.23 
 
 		 286 aa  92.8  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  27.61 
 
 		 361 aa  92.8  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  28.23 
 
 		 286 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1300  MscS mechanosensitive ion channel  26.1 
 
 		 343 aa  92.8  8e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.987941  hitchhiker  0.00895683 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  28.23 
 
 		 286 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1488  MscS family inner membrane protein YnaI  30.43 
 
 		 343 aa  92.4  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.445516  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  28.23 
 
 		 291 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1788  MscS family inner membrane protein YnaI  30.12 
 
 		 343 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150216 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1786  MscS family inner membrane protein YnaI  30.12 
 
 		 343 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0416525  normal  0.388102 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  29.23 
 
 		 274 aa  92.4  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  22.62 
 
 		 360 aa  92.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1670  MscS family inner membrane protein YnaI  30.12 
 
 		 343 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.107683 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  23.58 
 
 		 624 aa  92.4  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  29.44 
 
 		 843 aa  92  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  29 
 
 		 383 aa  91.3  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  27.57 
 
 		 806 aa  91.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  24.44 
 
 		 359 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  29 
 
 		 383 aa  91.3  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  25.81 
 
 		 274 aa  91.3  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  23.66 
 
 		 364 aa  90.9  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>