More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0263 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0289  mechanosensitive ion channel family protein  98.72 
 
 
627 aa  1243    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.658149  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  97.77 
 
 
627 aa  1209    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0263  mechanosensitive ion channel family protein  100 
 
 
627 aa  1256    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  54.53 
 
 
624 aa  628  1e-178  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  41.18 
 
 
633 aa  457  1e-127  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  42.81 
 
 
682 aa  457  1e-127  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  42.11 
 
 
624 aa  451  1e-125  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  31.45 
 
 
380 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  32.1 
 
 
356 aa  162  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  28.8 
 
 
381 aa  162  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2594  MscS mechanosensitive ion channel  27.53 
 
 
388 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4500  MscS Mechanosensitive ion channel  29.18 
 
 
662 aa  140  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1791  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  33.33 
 
 
343 aa  136  9e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  28.45 
 
 
426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  26.89 
 
 
369 aa  135  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  26.8 
 
 
384 aa  134  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  30.14 
 
 
354 aa  134  6e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01308  conserved inner membrane protein  33.2 
 
 
343 aa  134  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2315  MscS Mechanosensitive ion channel  33.2 
 
 
343 aa  134  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0901587  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2294  MscS mechanosensitive ion channel  33.2 
 
 
343 aa  134  6.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1447  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  33.2 
 
 
343 aa  134  6.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1978  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  33.2 
 
 
343 aa  134  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.218747 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1570  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  33.2 
 
 
343 aa  134  6.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1543  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  33.2 
 
 
343 aa  134  6.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01318  hypothetical protein  33.2 
 
 
343 aa  134  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.831445  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  28.09 
 
 
413 aa  133  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4873  MscS Mechanosensitive ion channel  25.68 
 
 
567 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0883  MscS mechanosensitive ion channel  26.15 
 
 
380 aa  130  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0942  MscS Mechanosensitive ion channel  29.1 
 
 
377 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000347454  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1848  MscS family hypothetical protein  33.47 
 
 
343 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512359  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1786  MscS family inner membrane protein YnaI  33.47 
 
 
343 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0416525  normal  0.388102 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1154  hypothetical protein  30.19 
 
 
363 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0298455  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1488  MscS family inner membrane protein YnaI  33.47 
 
 
343 aa  128  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.445516  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  28.87 
 
 
351 aa  128  3e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4048  MscS mechanosensitive ion channel  26.53 
 
 
569 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138882  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1788  MscS family inner membrane protein YnaI  33.06 
 
 
343 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.150216 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1670  MscS family inner membrane protein YnaI  33.06 
 
 
343 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.107683 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  25.22 
 
 
431 aa  127  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  26.27 
 
 
467 aa  127  9e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1409  MscS mechanosensitive ion channel  28.87 
 
 
351 aa  126  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  24.56 
 
 
433 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05088  hypothetical protein  28.23 
 
 
399 aa  125  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0922  MscS mechanosensitive ion channel  29.46 
 
 
456 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.837868 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1650  MscS mechanosensitive ion channel  26.04 
 
 
570 aa  125  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.598293 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  24.27 
 
 
433 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1295  MscS mechanosensitive ion channel  26.42 
 
 
391 aa  124  4e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  27.2 
 
 
362 aa  123  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  23.86 
 
 
362 aa  121  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  32.44 
 
 
352 aa  122  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  27.93 
 
 
383 aa  122  3e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  27.93 
 
 
383 aa  120  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0910  MscS mechanosensitive ion channel  26.28 
 
 
400 aa  120  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505459  normal  0.0192096 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1446  MscS mechanosensitive ion channel  24.84 
 
 
648 aa  118  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.770596  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1462  small-conductance mechanosensitive channel protein  27.3 
 
 
373 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0970  small-conductance mechanosensitive ion channel  26.12 
 
 
650 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00371389 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  27.82 
 
 
274 aa  114  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  26.84 
 
 
362 aa  114  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0803  small mechanosensitive ion channel  24.14 
 
 
342 aa  112  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4194  MscS mechanosensitive ion channel  26.12 
 
 
562 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3649  mechanosensitive ion channel family protein  26.61 
 
 
374 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0707  MscS Mechanosensitive ion channel  32.05 
 
 
344 aa  111  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  24.55 
 
 
359 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4819  MscS mechanosensitive ion channel  26.75 
 
 
392 aa  110  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749552  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  24.41 
 
 
360 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1267  MscS mechanosensitive ion channel  31.64 
 
 
351 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  27.43 
 
 
276 aa  108  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001221  small-conductance mechanosensitive channel  26.26 
 
 
367 aa  108  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  28.97 
 
 
275 aa  108  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4689  MscS Mechanosensitive ion channel  27.17 
 
 
374 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  25.83 
 
 
280 aa  107  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3612  MscS Mechanosensitive ion channel  27.17 
 
 
374 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.649067 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1500  MscS mechanosensitive ion channel  30.87 
 
 
614 aa  107  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1822  MscS mechanosensitive ion channel  26.21 
 
 
374 aa  107  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00396347  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  26 
 
 
484 aa  105  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0172  MscS mechanosensitive ion channel  25.75 
 
 
375 aa  105  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1849  small mechanosensitive ion channel  25.43 
 
 
340 aa  104  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.00611524  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2066  MscS mechanosensitive ion channel  25.56 
 
 
424 aa  104  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.838165  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  26.95 
 
 
275 aa  104  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00392  hypothetical protein  27.31 
 
 
377 aa  104  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.65965  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  27.3 
 
 
275 aa  104  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  27.3 
 
 
275 aa  104  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  26.3 
 
 
274 aa  103  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  24.78 
 
 
338 aa  103  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0905  MscS Mechanosensitive ion channel  26.1 
 
 
373 aa  103  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  25.17 
 
 
287 aa  103  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0460  putative mechanosensitive ion channel  28.27 
 
 
357 aa  103  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  27.27 
 
 
288 aa  103  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.46 
 
 
479 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  24.4 
 
 
362 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2171  MscS mechanosensitive ion channel  23.29 
 
 
374 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920192  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2220  MscS Mechanosensitive ion channel  28.3 
 
 
339 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  25.91 
 
 
364 aa  101  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1452  MscS mechanosensitive ion channel  27.13 
 
 
355 aa  100  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.678727  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  26.3 
 
 
275 aa  101  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  26.3 
 
 
275 aa  101  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0042  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 
375 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634821  normal  0.103785 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  26.64 
 
 
275 aa  100  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  27.78 
 
 
275 aa  100  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  38.06 
 
 
292 aa  100  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2101  MscS Mechanosensitive ion channel  29.01 
 
 
377 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000188968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>