More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_4003 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 362 aa  741    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  54.57 
 
 		 426 aa  391  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  33.44 
 
 		 380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4500  MscS Mechanosensitive ion channel  40.94 
 
 		 662 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  37.45 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  33.76 
 
 		 431 aa  166  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  33.12 
 
 		 433 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  32.8 
 
 		 433 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  32.19 
 
 		 467 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  34.53 
 
 		 352 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0905  MscS Mechanosensitive ion channel  39.81 
 
 		 373 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  34.85 
 
 		 354 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  34.75 
 
 		 356 aa  150  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  40.27 
 
 		 351 aa  149  7e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1409  MscS mechanosensitive ion channel  39.82 
 
 		 351 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0641  hypothetical protein  39.34 
 
 		 543 aa  145  1e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0042  MscS Mechanosensitive ion channel  30.74 
 
 		 375 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634821  normal  0.103785 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  31.82 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1295  MscS mechanosensitive ion channel  31.23 
 
 		 391 aa  140  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  30.31 
 
 		 413 aa  139  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1267  MscS mechanosensitive ion channel  38.94 
 
 		 351 aa  135  8e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  29.28 
 
 		 369 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4932  MscS Mechanosensitive ion channel  31.73 
 
 		 400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4048  MscS mechanosensitive ion channel  32.84 
 
 		 569 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138882  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4873  MscS Mechanosensitive ion channel  34.62 
 
 		 567 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0803  small mechanosensitive ion channel  32.39 
 
 		 342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4194  MscS mechanosensitive ion channel  37.76 
 
 		 562 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  29.62 
 
 		 362 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  32.24 
 
 		 362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1300  MscS mechanosensitive ion channel  31.89 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.987941  hitchhiker  0.00895683 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1578  small-conductance mechanosensitive channel  33.03 
 
 		 534 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00006998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  32.95 
 
 		 341 aa  129  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  29.26 
 
 		 484 aa  129  6e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1462  small-conductance mechanosensitive channel protein  29.78 
 
 		 373 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0942  MscS Mechanosensitive ion channel  34.48 
 
 		 377 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000347454  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2152  MscS mechanosensitive ion channel  34.74 
 
 		 377 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20120  Mechanosensitive ion channel family protein  30.16 
 
 		 418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  29.38 
 
 		 378 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1154  hypothetical protein  32.89 
 
 		 363 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0298455  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  28.21 
 
 		 384 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  30.52 
 
 		 361 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  29.77 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1943  MscS mechanosensitive ion channel  32.08 
 
 		 533 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000658199  decreased coverage  0.00758396 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  29.77 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  30.39 
 
 		 359 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1900  MscS mechanosensitive ion channel  33.03 
 
 		 240 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0998935  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3649  mechanosensitive ion channel family protein  33.98 
 
 		 374 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0075  small-conductance mechanosensitive channel  32.27 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.221122  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  32.66 
 
 		 682 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07011  small mechanosensitive ion channel  35.32 
 
 		 343 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184839  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06981  small mechanosensitive ion channel  32.67 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.247932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  28.71 
 
 		 360 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0635  small mechanosensitive ion channel  35.35 
 
 		 343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.352398  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  27.67 
 
 		 277 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0707  MscS Mechanosensitive ion channel  33.96 
 
 		 344 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3612  MscS Mechanosensitive ion channel  30.24 
 
 		 374 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649067 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4689  MscS Mechanosensitive ion channel  30.24 
 
 		 374 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2568  MscS mechanosensitive ion channel  28.27 
 
 		 358 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1650  MscS mechanosensitive ion channel  27.11 
 
 		 570 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598293 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  31.66 
 
 		 624 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  33.59 
 
 		 366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  34.6 
 
 		 352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0172  MscS mechanosensitive ion channel  30.85 
 
 		 375 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1822  MscS mechanosensitive ion channel  32.52 
 
 		 374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00396347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0922  MscS mechanosensitive ion channel  33 
 
 		 456 aa  117  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837868 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4819  MscS mechanosensitive ion channel  31.86 
 
 		 392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  33.33 
 
 		 627 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  29.41 
 
 		 279 aa  116  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2066  MscS mechanosensitive ion channel  28.7 
 
 		 424 aa  116  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.838165  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1791  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  32.31 
 
 		 343 aa  116  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0289  mechanosensitive ion channel family protein  33.33 
 
 		 627 aa  116  6.9999999999999995e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.658149  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2594  MscS mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 		 388 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0263  mechanosensitive ion channel family protein  33.33 
 
 		 627 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4427  MscS Mechanosensitive ion channel  32.65 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0238849  normal  0.125106 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01308  conserved inner membrane protein  32.44 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2315  MscS Mechanosensitive ion channel  32.44 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0901587  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01318  hypothetical protein  32.44 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.831445  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2294  MscS mechanosensitive ion channel  32.44 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1447  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  32.44 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1978  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  32.44 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218747 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1500  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 614 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1543  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  32.44 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1570  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  32.44 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  28.57 
 
 		 364 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05088  hypothetical protein  31.4 
 
 		 399 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 338 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2171  MscS mechanosensitive ion channel  33 
 
 		 374 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07431  small mechanosensitive ion channel  32.23 
 
 		 343 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.1802 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06911  small mechanosensitive ion channel  34.88 
 
 		 343 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412375  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3360  hypothetical protein  31.77 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  28.67 
 
 		 550 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06621  small mechanosensitive ion channel  34.88 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.16712  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2398  MscS mechanosensitive ion channel  31.77 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  28.67 
 
 		 551 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  28.67 
 
 		 551 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0247  mechanosensitive ion channel family protein  30.46 
 
 		 378 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0253  mechanosensitive ion channel family protein  30.94 
 
 		 378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  28.69 
 
 		 289 aa  109  6e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  30.33 
 
 		 360 aa  109  6e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>