More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03115 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 378 aa  767    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2568  MscS mechanosensitive ion channel  58.82 
 
 		 358 aa  403  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2357  hypothetical protein  44.31 
 
 		 348 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.116724  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1210  MscS mechanosensitive ion channel  46.57 
 
 		 344 aa  215  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  39.76 
 
 		 338 aa  206  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  43.69 
 
 		 348 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000167428  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  36.57 
 
 		 352 aa  172  9e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0623  MscS Mechanosensitive ion channel  39.06 
 
 		 337 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  30.86 
 
 		 345 aa  158  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  34.58 
 
 		 369 aa  137  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  33.18 
 
 		 364 aa  134  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  36.06 
 
 		 359 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  32.21 
 
 		 360 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  29.38 
 
 		 362 aa  127  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  33.5 
 
 		 361 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  37.44 
 
 		 484 aa  124  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  31.62 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 362 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  31.1 
 
 		 341 aa  119  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  32.27 
 
 		 269 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  35.79 
 
 		 342 aa  116  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  29.7 
 
 		 299 aa  116  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  34.63 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  33.49 
 
 		 538 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  32.41 
 
 		 533 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  27.76 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  32.66 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  32.56 
 
 		 547 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  30.83 
 
 		 637 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  33.66 
 
 		 532 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  33.33 
 
 		 563 aa  111  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  32.79 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  32.79 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  26.24 
 
 		 362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  33.17 
 
 		 544 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  33.18 
 
 		 806 aa  110  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  27.06 
 
 		 384 aa  110  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  33.64 
 
 		 275 aa  110  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  32.41 
 
 		 547 aa  109  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  31.3 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  28.81 
 
 		 531 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  30.12 
 
 		 753 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1300  MscS mechanosensitive ion channel  32.56 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.987941  hitchhiker  0.00895683 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  32.42 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  35.1 
 
 		 273 aa  108  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  32.24 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  31.02 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  32.69 
 
 		 274 aa  107  4e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  29.81 
 
 		 561 aa  106  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  31.16 
 
 		 551 aa  107  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  31.16 
 
 		 551 aa  107  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  30.41 
 
 		 540 aa  106  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  31.16 
 
 		 550 aa  106  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  32.24 
 
 		 275 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  32.24 
 
 		 275 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  32.86 
 
 		 277 aa  106  8e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  33.64 
 
 		 275 aa  105  9e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  32.24 
 
 		 275 aa  106  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  33.06 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  30.7 
 
 		 549 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  30.7 
 
 		 549 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  33.8 
 
 		 843 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  31.47 
 
 		 636 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3392  MscS Mechanosensitive ion channel  28.16 
 
 		 833 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  30.7 
 
 		 549 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  31.47 
 
 		 636 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  28.4 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  33.18 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  31.1 
 
 		 277 aa  103  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  28.53 
 
 		 840 aa  103  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  28.03 
 
 		 685 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  29.58 
 
 		 311 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  27.65 
 
 		 752 aa  103  7e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0905  MscS Mechanosensitive ion channel  31.43 
 
 		 373 aa  102  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  26.92 
 
 		 276 aa  102  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  31.02 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3942  MscS mechanosensitive ion channel  33.48 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.639966 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  28.29 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  29.13 
 
 		 813 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.183155 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  27.8 
 
 		 291 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0202  mechanosensitive ion channel family protein  33.18 
 
 		 271 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0014  MscS Mechanosensitive ion channel  36.08 
 
 		 289 aa  100  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  28.63 
 
 		 275 aa  100  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  31.95 
 
 		 274 aa  99.8  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  28.64 
 
 		 534 aa  99.8  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  30.14 
 
 		 270 aa  99.8  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  27.86 
 
 		 322 aa  99.8  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1042  MscS Mechanosensitive ion channel  33.17 
 
 		 310 aa  99.4  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  33.52 
 
 		 366 aa  99.4  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  30.1 
 
 		 200 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  32.38 
 
 		 286 aa  99.4  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  30.36 
 
 		 560 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0204  mechanosensitive ion channel family protein  33.99 
 
 		 271 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.171183  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  27.84 
 
 		 322 aa  98.2  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1419  mechanosensitive ion channel family protein  32.65 
 
 		 278 aa  98.2  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2837  MscS Mechanosensitive ion channel  28.51 
 
 		 366 aa  98.2  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.426677  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1903  MscS Mechanosensitive ion channel  30.31 
 
 		 303 aa  97.4  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  29.51 
 
 		 274 aa  97.8  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  31.14 
 
 		 275 aa  97.4  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  29.46 
 
 		 283 aa  97.4  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>