More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0623 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0623  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 337 aa  666    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  38.51 
 
 		 348 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000167428  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2357  hypothetical protein  36.79 
 
 		 348 aa  203  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.116724  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1210  MscS mechanosensitive ion channel  40.17 
 
 		 344 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2568  MscS mechanosensitive ion channel  31.96 
 
 		 358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  34.26 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  39.06 
 
 		 378 aa  161  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 352 aa  146  5e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  31.13 
 
 		 345 aa  140  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  26.51 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  27.52 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  22.86 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  22.75 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  24.19 
 
 		 484 aa  72.8  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5823  MscS mechanosensitive ion channel  25.33 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  0.440829 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  24.48 
 
 		 426 aa  72.8  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  29.74 
 
 		 1067 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  29.74 
 
 		 1067 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3321  MscS mechanosensitive ion channel  28.8 
 
 		 1078 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.660513  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2790  MscS mechanosensitive ion channel  26.05 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.557915 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2519  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25.6 
 
 		 492 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.806579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3904  MscS mechanosensitive ion channel  29.89 
 
 		 1072 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3291  MscS mechanosensitive ion channel  29.89 
 
 		 1068 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.563171  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3721  MscS Mechanosensitive ion channel  29.89 
 
 		 1072 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3778  MscS mechanosensitive ion channel  29.89 
 
 		 1072 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0547  MscS mechanosensitive ion channel  29.89 
 
 		 1067 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  24.25 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0586  MscS mechanosensitive ion channel  29.23 
 
 		 1067 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0875624 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0587  MscS mechanosensitive ion channel  29.23 
 
 		 1067 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0226105 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  26.09 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0786  MscS mechanosensitive ion channel  28.8 
 
 		 1066 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.213544  hitchhiker  0.000495101 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2775  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  24.76 
 
 		 493 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  31.29 
 
 		 322 aa  68.9  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3036  transporter, putative  28.8 
 
 		 1080 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0415629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  30.11 
 
 		 1127 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  26.53 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  31.84 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2837  MscS Mechanosensitive ion channel  25.51 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.426677  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  26.77 
 
 		 825 aa  67  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  26.77 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  31.22 
 
 		 732 aa  66.2  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  32.6 
 
 		 753 aa  65.9  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0886  MscS mechanosensitive ion channel  27.88 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.36483  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0555  MscS mechanosensitive ion channel  27.14 
 
 		 1060 aa  65.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0475901  normal  0.179203 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  30.06 
 
 		 287 aa  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  27.8 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4182  MscS mechanosensitive ion channel  28.8 
 
 		 1070 aa  64.7  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  28.75 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  26.09 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  24.14 
 
 		 563 aa  65.1  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  34.71 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  24.08 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  22.99 
 
 		 532 aa  64.3  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  24.06 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  26.55 
 
 		 840 aa  64.3  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  31.84 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  25.62 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  25.62 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  25.62 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  25.62 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  25.62 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  25.62 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  26.74 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  26.18 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  26.18 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  25.53 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  25.62 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  25.62 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  28.18 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  26.18 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  26.18 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  25.62 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  26.18 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  22.02 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  33.05 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  28.07 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  30.24 
 
 		 853 aa  63.2  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1300  MscS mechanosensitive ion channel  26.06 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.987941  hitchhiker  0.00895683 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  30.65 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  25.52 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3942  MscS mechanosensitive ion channel  29.81 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.639966 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  33.88 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2257  MscS mechanosensitive ion channel  27.69 
 
 		 1110 aa  62.8  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371999  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1178  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.89 
 
 		 505 aa  62.8  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.811879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0321  MscS mechanosensitive ion channel  28.3 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  29.94 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  35.2 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  34.71 
 
 		 275 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  34.71 
 
 		 275 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2569  MscS Mechanosensitive ion channel  25.6 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1773  MscS mechanosensitive ion channel  25.46 
 
 		 547 aa  62  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  32.43 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2066  MscS mechanosensitive ion channel  31.33 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.838165  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  28.34 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3551  MscS mechanosensitive ion channel  27.75 
 
 		 1062 aa  61.6  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  27.37 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  24.91 
 
 		 796 aa  60.8  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4726  MscS mechanosensitive ion channel  25.15 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440183  normal  0.105448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>