More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1010 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 308 aa  624  1e-178  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  35.42 
 
 		 351 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  35.25 
 
 		 307 aa  169  4e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0227  MscS mechanosensitive ion channel  37.86 
 
 		 268 aa  142  9e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  35.22 
 
 		 278 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10518  MscS Mechanosensitive ion channel  33.67 
 
 		 591 aa  129  9.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526339  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1262  MscS mechanosensitive ion channel  33.5 
 
 		 627 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.523793  normal  0.0747451 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1004  MscS mechanosensitive ion channel  32.4 
 
 		 648 aa  110  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  34.59 
 
 		 360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0307  MscS mechanosensitive ion channel  29.96 
 
 		 435 aa  107  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.381926  normal  0.0553472 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  29.78 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  34.3 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  32.81 
 
 		 279 aa  107  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  34.95 
 
 		 305 aa  106  6e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  31.94 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1933  MscS Mechanosensitive ion channel  31.61 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  34.95 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  31.89 
 
 		 364 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  31 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  28.96 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1121  MscS mechanosensitive ion channel  34.02 
 
 		 374 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  28.17 
 
 		 806 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  37.13 
 
 		 273 aa  103  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  33.51 
 
 		 359 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  31.19 
 
 		 287 aa  103  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  31.89 
 
 		 276 aa  102  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5898  MscS Mechanosensitive ion channel  38.19 
 
 		 268 aa  102  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  30.52 
 
 		 270 aa  102  9e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6267  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  27.27 
 
 		 365 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  32.81 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1042  MscS Mechanosensitive ion channel  36.23 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  30.2 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  31.38 
 
 		 362 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  31.91 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2855  MscS mechanosensitive ion channel  33.51 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154936 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  30.48 
 
 		 753 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  29.21 
 
 		 360 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  28.28 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  30.47 
 
 		 531 aa  99.8  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0838  MscS Mechanosensitive ion channel  31.12 
 
 		 374 aa  98.6  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  27.92 
 
 		 336 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  27.67 
 
 		 636 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4603  mechanosensitive ion channel family protein  26.27 
 
 		 275 aa  98.2  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 414 aa  97.8  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  31.55 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  29.38 
 
 		 356 aa  97.8  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  27.67 
 
 		 636 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4086  MscS mechanosensitive ion channel  34.85 
 
 		 276 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  28.33 
 
 		 408 aa  97.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  34.09 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 421 aa  97.1  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2302  MscS mechanosensitive ion channel  29.59 
 
 		 399 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.47196 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1861  MscS Mechanosensitive ion channel  27.94 
 
 		 402 aa  96.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  30.53 
 
 		 342 aa  96.7  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2310  MscS mechanosensitive ion channel  29.59 
 
 		 399 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2263  MscS mechanosensitive ion channel  29.59 
 
 		 402 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  29.84 
 
 		 280 aa  97.1  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5934  MscS Mechanosensitive ion channel  27.86 
 
 		 378 aa  96.7  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  32.28 
 
 		 288 aa  96.7  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2568  MscS mechanosensitive ion channel  30.8 
 
 		 358 aa  96.3  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  34.6 
 
 		 286 aa  95.5  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  29.44 
 
 		 359 aa  95.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  31.13 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  30.86 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  32.61 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1797  MscS mechanosensitive ion channel  28.19 
 
 		 390 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986921 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  31.63 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5188  MscS mechanosensitive ion channel  28.19 
 
 		 390 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  31.32 
 
 		 277 aa  94.7  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6191  MscS mechanosensitive ion channel  28.19 
 
 		 390 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.593763  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  31.11 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1911  MscS mechanosensitive ion channel  28.19 
 
 		 390 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801877 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1825  MscS mechanosensitive ion channel  28.19 
 
 		 390 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0903923  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1888  MscS mechanosensitive ion channel  28.19 
 
 		 390 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2357  hypothetical protein  28.52 
 
 		 348 aa  94  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.116724  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3654  MscS mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 393 aa  94  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  33.18 
 
 		 275 aa  93.6  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0960  MscS mechanosensitive ion channel  36.09 
 
 		 280 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  27.65 
 
 		 840 aa  93.2  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  30.35 
 
 		 286 aa  93.2  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.461855 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  31.07 
 
 		 563 aa  93.2  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4392  mechanosensitive ion channel family protein  35.33 
 
 		 276 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2527  MscS mechanosensitive ion channel  28.43 
 
 		 566 aa  92.8  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.145786 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  26.95 
 
 		 328 aa  92.8  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3947  MscS Mechanosensitive ion channel  29.64 
 
 		 393 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0285178  normal  0.460909 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5044  mechanosensitive ion channel protein  26.82 
 
 		 357 aa  92.4  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 291 aa  92.4  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  30.98 
 
 		 275 aa  92.4  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1187  MscS Mechanosensitive ion channel  31.89 
 
 		 305 aa  92.4  9e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0250538  hitchhiker  0.00000123969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4496  MscS mechanosensitive ion channel  36.09 
 
 		 280 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737667  normal  0.727724 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  28.65 
 
 		 360 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1009  small-conductance mechanosensitive channel  29.74 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0235  MscS mechanosensitive ion channel  30.88 
 
 		 368 aa  91.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  30.69 
 
 		 429 aa  91.7  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7380  mechanosensitive ion channel protein  26.29 
 
 		 439 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2760  MscS Mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 		 359 aa  92  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  27.37 
 
 		 275 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  27.6 
 
 		 279 aa  91.7  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3940  MscS Mechanosensitive ion channel  30.93 
 
 		 393 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0755374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>