More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0886 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0886  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 259 aa  517  1e-146  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.36483  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1649  MscS Mechanosensitive ion channel  66.27 
 
 		 256 aa  350  1e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0321  MscS mechanosensitive ion channel  54.81 
 
 		 261 aa  259  4e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1229  MscS mechanosensitive ion channel  40.48 
 
 		 268 aa  199  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1226  MscS mechanosensitive ion channel  40.08 
 
 		 268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.735162  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0104  MscS mechanosensitive ion channel  34.88 
 
 		 278 aa  165  5.9999999999999996e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00989653  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  30.24 
 
 		 286 aa  125  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  30.24 
 
 		 286 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  30.24 
 
 		 286 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  30.24 
 
 		 286 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  30.24 
 
 		 286 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  30.24 
 
 		 286 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  30.24 
 
 		 286 aa  125  8.000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  30.24 
 
 		 286 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  30.2 
 
 		 291 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  29.74 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  29.74 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  29.74 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  29.74 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  29.74 
 
 		 286 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  30.35 
 
 		 538 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  28.88 
 
 		 284 aa  115  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  29.63 
 
 		 531 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  30.92 
 
 		 533 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  27.86 
 
 		 270 aa  112  5e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  29.69 
 
 		 532 aa  112  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  31.68 
 
 		 550 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  27.03 
 
 		 276 aa  112  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  30.32 
 
 		 561 aa  111  9e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  31.38 
 
 		 292 aa  111  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  29.6 
 
 		 544 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  28.34 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  30.47 
 
 		 563 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  28.4 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  28.06 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  31.19 
 
 		 551 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  31.19 
 
 		 551 aa  110  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  31.91 
 
 		 534 aa  109  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 283 aa  108  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  30.93 
 
 		 200 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  28.69 
 
 		 275 aa  108  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  31.22 
 
 		 549 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  31.22 
 
 		 549 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  31.22 
 
 		 549 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  29.65 
 
 		 540 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  30.2 
 
 		 547 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  28.92 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  26.56 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  28 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 283 aa  105  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  27.52 
 
 		 429 aa  105  8e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  28.95 
 
 		 275 aa  105  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  32.24 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  29.41 
 
 		 494 aa  104  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  29.53 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  28.87 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  26.48 
 
 		 289 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  26.48 
 
 		 289 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  30.69 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  26.48 
 
 		 289 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  27.48 
 
 		 547 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3942  MscS mechanosensitive ion channel  28.33 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.639966 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  30.83 
 
 		 334 aa  103  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  27.39 
 
 		 310 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  30.24 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4433  MscS Mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 285 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  30.24 
 
 		 275 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  30.24 
 
 		 275 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  27.06 
 
 		 275 aa  102  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  29.76 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4436  MscS Mechanosensitive ion channel  26.88 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.312478 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4349  MscS Mechanosensitive ion channel  26.88 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  30.4 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  27.98 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5331  MscS mechanosensitive ion channel  30.93 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2090  hypothetical protein  24.91 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  35.12 
 
 		 479 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  29.7 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  26.51 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4503  MscS Mechanosensitive ion channel  26.48 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  28.34 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  28.16 
 
 		 275 aa  99.4  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  27.8 
 
 		 277 aa  99  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  36.26 
 
 		 360 aa  97.1  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  27.94 
 
 		 843 aa  97.8  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  28.69 
 
 		 281 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  30.85 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  29.48 
 
 		 304 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  27.67 
 
 		 275 aa  97.1  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  28.12 
 
 		 269 aa  96.7  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  30.1 
 
 		 275 aa  96.7  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  29.8 
 
 		 276 aa  96.3  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  28.64 
 
 		 275 aa  96.3  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  28.64 
 
 		 275 aa  96.3  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  25.79 
 
 		 277 aa  95.9  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  27.35 
 
 		 274 aa  95.9  6e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0204  mechanosensitive ion channel family protein  28.3 
 
 		 271 aa  95.5  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.171183  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0202  mechanosensitive ion channel family protein  28.2 
 
 		 271 aa  95.1  9e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  27 
 
 		 275 aa  94.4  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>