More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1229 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1229  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 268 aa  535  1e-151  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1226  MscS mechanosensitive ion channel  98.13 
 
 		 268 aa  528  1e-149  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.735162  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0886  MscS mechanosensitive ion channel  40.48 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.36483  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0104  MscS mechanosensitive ion channel  40.39 
 
 		 278 aa  218  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00989653  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0321  MscS mechanosensitive ion channel  44.49 
 
 		 261 aa  215  5e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1649  MscS Mechanosensitive ion channel  40.62 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  37.34 
 
 		 563 aa  165  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  36.51 
 
 		 532 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  35.98 
 
 		 269 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  39.22 
 
 		 292 aa  157  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  32.82 
 
 		 534 aa  152  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 		 547 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  31.47 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  33.07 
 
 		 533 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  32.93 
 
 		 550 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  32.94 
 
 		 538 aa  149  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 276 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  34.4 
 
 		 544 aa  149  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  31.4 
 
 		 280 aa  149  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  32.44 
 
 		 531 aa  148  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  32.93 
 
 		 551 aa  148  8e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  32.93 
 
 		 551 aa  148  8e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  32.14 
 
 		 549 aa  148  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  32.14 
 
 		 549 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  32.14 
 
 		 549 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  32.65 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  32.65 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  36.36 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  32.65 
 
 		 275 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  34.02 
 
 		 547 aa  145  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  37.63 
 
 		 200 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  32.24 
 
 		 275 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  33.48 
 
 		 540 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  35.05 
 
 		 561 aa  145  9e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  32.03 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  32.81 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  32.67 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0306  small-conductance mechanosensitive channel  32.07 
 
 		 284 aa  143  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000279081  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  30.28 
 
 		 277 aa  142  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  29.08 
 
 		 275 aa  142  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  30.67 
 
 		 274 aa  142  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  31.43 
 
 		 275 aa  142  8e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  30.65 
 
 		 270 aa  141  9e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  30.99 
 
 		 275 aa  141  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  32.81 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4603  mechanosensitive ion channel family protein  31.08 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  30.68 
 
 		 277 aa  140  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  30.2 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  33.82 
 
 		 276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  31.84 
 
 		 274 aa  139  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  30.61 
 
 		 275 aa  139  7e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  32.14 
 
 		 288 aa  138  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  30.58 
 
 		 275 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  30.58 
 
 		 275 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  31.02 
 
 		 274 aa  138  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  31.92 
 
 		 287 aa  137  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  32.99 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  34.91 
 
 		 360 aa  136  4e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  31.05 
 
 		 275 aa  136  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  33.88 
 
 		 359 aa  135  5e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  32.14 
 
 		 267 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  30.86 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  30.08 
 
 		 281 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  31.2 
 
 		 286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  31.2 
 
 		 286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  31.2 
 
 		 286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  31.2 
 
 		 286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  31.2 
 
 		 286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  31.2 
 
 		 286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  31.2 
 
 		 286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  31.2 
 
 		 291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  31.2 
 
 		 286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  31.13 
 
 		 288 aa  132  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  32.41 
 
 		 356 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0541  MscS mechanosensitive ion channel  28.51 
 
 		 273 aa  132  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  28.97 
 
 		 276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  32.33 
 
 		 284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  31.35 
 
 		 267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  32.68 
 
 		 360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  30.08 
 
 		 298 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  31.12 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  31.47 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  29.2 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  29.57 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  32.68 
 
 		 279 aa  126  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  31.03 
 
 		 286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  31.03 
 
 		 286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  31.03 
 
 		 286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  29.73 
 
 		 494 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  31.03 
 
 		 286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1202  MscS Mechanosensitive ion channel  29.62 
 
 		 270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.49703  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0091  MscS mechanosensitive ion channel  30.16 
 
 		 267 aa  125  5e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  30.8 
 
 		 300 aa  125  6e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  30.6 
 
 		 286 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  33.82 
 
 		 842 aa  125  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  35.86 
 
 		 864 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  27.2 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  31.82 
 
 		 816 aa  122  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3397  MscS mechanosensitive ion channel  31.41 
 
 		 291 aa  123  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  31.02 
 
 		 276 aa  122  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>