More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0306 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0306  small-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 284 aa  573  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000279081  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3684  MscS mechanosensitive ion channel  51.47 
 
 		 278 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3509  MscS mechanosensitive ion channel  50.37 
 
 		 278 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0443  MscS mechanosensitive ion channel  50 
 
 		 278 aa  300  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3394  MscS mechanosensitive ion channel  51.12 
 
 		 277 aa  294  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00053127  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0104  mechanosensitive ion channel family protein  47.48 
 
 		 309 aa  290  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3856  MscS mechanosensitive ion channel  51.1 
 
 		 278 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.20088  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0487  MscS Mechanosensitive ion channel  51.1 
 
 		 278 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0484  MscS mechanosensitive ion channel  50.74 
 
 		 278 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0216741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0457  MscS mechanosensitive ion channel  51.48 
 
 		 277 aa  285  8e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0463  MscS mechanosensitive ion channel  51.1 
 
 		 278 aa  285  9e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.11026  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0246  hypothetical protein  53.33 
 
 		 285 aa  281  8.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0539  MscS mechanosensitive ion channel  51.49 
 
 		 278 aa  276  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.815557  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1730  MscS Mechanosensitive ion channel  46.86 
 
 		 276 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.351236  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0457  MscS mechanosensitive ion channel  48.34 
 
 		 278 aa  268  7e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4512  MscS mechanosensitive ion channel  50.39 
 
 		 277 aa  266  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0408  hypothetical protein  49.08 
 
 		 282 aa  265  5e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3406  MscS mechanosensitive ion channel  48.74 
 
 		 277 aa  258  8e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00678  mechanosensitive ion channel family protein  44.07 
 
 		 271 aa  255  7e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.096226  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  38.52 
 
 		 275 aa  191  8e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  38.52 
 
 		 275 aa  191  8e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  38.15 
 
 		 275 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  34.81 
 
 		 277 aa  186  6e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  36.94 
 
 		 274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  35.11 
 
 		 269 aa  181  9.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  35.82 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  35.82 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  35.45 
 
 		 275 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  35.56 
 
 		 275 aa  179  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  35.45 
 
 		 275 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  33.85 
 
 		 288 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  35.41 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  34.07 
 
 		 275 aa  176  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  35.56 
 
 		 275 aa  175  9e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  31.72 
 
 		 270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  33.21 
 
 		 274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  36.33 
 
 		 268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  33.58 
 
 		 274 aa  172  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  32.84 
 
 		 274 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  32.09 
 
 		 275 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  33.46 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  34.81 
 
 		 274 aa  168  9e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  32.46 
 
 		 275 aa  168  9e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  34.35 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  33.45 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0427  MscS mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 288 aa  165  9e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0918944  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  31.52 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  31.84 
 
 		 279 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2565  hypothetical protein  34.08 
 
 		 283 aa  163  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  30.71 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  29.81 
 
 		 270 aa  159  5e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  34.42 
 
 		 276 aa  159  6e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  30.45 
 
 		 282 aa  158  9e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  34.32 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  32.82 
 
 		 288 aa  156  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  31.44 
 
 		 277 aa  156  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  32.83 
 
 		 277 aa  155  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1419  mechanosensitive ion channel family protein  33.21 
 
 		 278 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0541  MscS mechanosensitive ion channel  30.18 
 
 		 273 aa  155  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  32.84 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  31.95 
 
 		 276 aa  153  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  32.64 
 
 		 276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  33.98 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  33.98 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  33.98 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  33.98 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4603  mechanosensitive ion channel family protein  31.73 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  33.98 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  33.98 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  33.98 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  33.98 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  33.98 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  32.54 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  38.29 
 
 		 276 aa  150  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4420  MscS mechanosensitive ion channel  32.73 
 
 		 279 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0689552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  31.3 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  28.03 
 
 		 280 aa  149  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  32.03 
 
 		 283 aa  149  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  35.74 
 
 		 294 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  31.01 
 
 		 289 aa  148  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  34.55 
 
 		 531 aa  148  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  31.01 
 
 		 289 aa  148  8e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  31.01 
 
 		 289 aa  148  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  30.5 
 
 		 280 aa  148  9e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4503  MscS Mechanosensitive ion channel  30.92 
 
 		 285 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  28.94 
 
 		 274 aa  148  9e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4433  MscS Mechanosensitive ion channel  29.73 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  33.85 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3671  MscS mechanosensitive ion channel  32.59 
 
 		 277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4349  MscS Mechanosensitive ion channel  29.73 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4436  MscS Mechanosensitive ion channel  29.73 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.312478 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1584  MscS mechanosensitive ion channel  30.35 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00518641  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  30.68 
 
 		 270 aa  146  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  31.32 
 
 		 283 aa  145  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5331  MscS mechanosensitive ion channel  29.81 
 
 		 301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2402  hypothetical protein  34.51 
 
 		 279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.267781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  31.27 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  31.78 
 
 		 293 aa  142  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  32.8 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  29.66 
 
 		 563 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>