More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3024 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 282 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0427  MscS mechanosensitive ion channel  77.66 
 
 		 288 aa  460  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0918944  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  45.24 
 
 		 276 aa  248  6e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  33.21 
 
 		 286 aa  169  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3394  MscS mechanosensitive ion channel  33.2 
 
 		 277 aa  165  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00053127  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  33.86 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  33.47 
 
 		 275 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  33.47 
 
 		 275 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4512  MscS mechanosensitive ion channel  33.2 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3509  MscS mechanosensitive ion channel  34.24 
 
 		 278 aa  163  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0246  hypothetical protein  33.73 
 
 		 285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0443  MscS mechanosensitive ion channel  33.85 
 
 		 278 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  32.55 
 
 		 277 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  31.5 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  32.81 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  31.89 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  32.81 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  32.81 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3684  MscS mechanosensitive ion channel  32.41 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  32.17 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  32.41 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  31.06 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0104  mechanosensitive ion channel family protein  30.89 
 
 		 309 aa  158  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0306  small-conductance mechanosensitive channel  30.45 
 
 		 284 aa  158  8e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000279081  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  32.02 
 
 		 275 aa  158  8e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  31.7 
 
 		 275 aa  157  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  30.92 
 
 		 275 aa  156  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  30.62 
 
 		 274 aa  156  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0457  MscS mechanosensitive ion channel  31.23 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  29.92 
 
 		 287 aa  155  6e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  30.47 
 
 		 269 aa  155  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00678  mechanosensitive ion channel family protein  31.3 
 
 		 271 aa  155  9e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.096226  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  30.62 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  31.78 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  28.68 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  31.09 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  32.58 
 
 		 538 aa  153  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  32.59 
 
 		 533 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  35.25 
 
 		 540 aa  152  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  30.04 
 
 		 534 aa  152  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  33.6 
 
 		 547 aa  152  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  31.08 
 
 		 547 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  33.08 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  29.02 
 
 		 280 aa  149  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0539  MscS mechanosensitive ion channel  31.91 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.815557  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  32.58 
 
 		 544 aa  149  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  29.77 
 
 		 270 aa  148  8e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  29.25 
 
 		 275 aa  148  9e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0463  MscS mechanosensitive ion channel  31.23 
 
 		 278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.11026  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  29.37 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  32.2 
 
 		 550 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2565  hypothetical protein  30.3 
 
 		 283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  32.64 
 
 		 283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  32.2 
 
 		 551 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  32.2 
 
 		 551 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3856  MscS mechanosensitive ion channel  30.83 
 
 		 278 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.20088  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0487  MscS Mechanosensitive ion channel  30.83 
 
 		 278 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0484  MscS mechanosensitive ion channel  30.83 
 
 		 278 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0216741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  31.3 
 
 		 298 aa  145  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  31.34 
 
 		 549 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  31.34 
 
 		 549 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  31.34 
 
 		 549 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  34.17 
 
 		 200 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  32.91 
 
 		 279 aa  142  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5331  MscS mechanosensitive ion channel  28.91 
 
 		 301 aa  142  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0408  hypothetical protein  30.12 
 
 		 282 aa  142  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  28.62 
 
 		 563 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  28.24 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  32.67 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1730  MscS Mechanosensitive ion channel  27.91 
 
 		 276 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.351236  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  29.58 
 
 		 276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  28.62 
 
 		 532 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  30.51 
 
 		 277 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1584  MscS mechanosensitive ion channel  30.59 
 
 		 279 aa  139  6e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00518641  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1342  MscS Mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 266 aa  138  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00293598  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  28.52 
 
 		 531 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  29.14 
 
 		 291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3406  MscS mechanosensitive ion channel  32.81 
 
 		 277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  29.14 
 
 		 286 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  29.14 
 
 		 286 aa  136  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  29.14 
 
 		 286 aa  136  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  29.14 
 
 		 286 aa  136  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  29.14 
 
 		 286 aa  136  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  29.14 
 
 		 286 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  29.14 
 
 		 286 aa  136  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  29.14 
 
 		 286 aa  136  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  27.38 
 
 		 268 aa  135  5e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  30.13 
 
 		 291 aa  135  8e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  30.6 
 
 		 286 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0457  MscS mechanosensitive ion channel  30.83 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  30.6 
 
 		 286 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  30.6 
 
 		 286 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  30.6 
 
 		 286 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  30.3 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  29.17 
 
 		 280 aa  132  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  28.31 
 
 		 277 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0541  MscS mechanosensitive ion channel  25.3 
 
 		 273 aa  132  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  29.01 
 
 		 288 aa  132  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  32.4 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>