More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2755 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  100 
 
 		 276 aa  549  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  45.24 
 
 		 282 aa  248  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0427  MscS mechanosensitive ion channel  45.24 
 
 		 288 aa  247  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0918944  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 270 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  30.22 
 
 		 533 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0306  small-conductance mechanosensitive channel  31.95 
 
 		 284 aa  153  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000279081  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00678  mechanosensitive ion channel family protein  33.96 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.096226  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 544 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  32.21 
 
 		 277 aa  149  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  30.26 
 
 		 550 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  30.94 
 
 		 547 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  32.84 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  32.84 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  31.6 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  32.03 
 
 		 288 aa  146  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3684  MscS mechanosensitive ion channel  30.74 
 
 		 278 aa  147  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  32.42 
 
 		 288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  32.84 
 
 		 540 aa  145  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3509  MscS mechanosensitive ion channel  30.37 
 
 		 278 aa  146  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  30.26 
 
 		 551 aa  145  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  30.26 
 
 		 551 aa  145  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  32.45 
 
 		 275 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  32.1 
 
 		 275 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  32.1 
 
 		 275 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 538 aa  145  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0443  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 278 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  30.92 
 
 		 547 aa  144  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  32.32 
 
 		 275 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1730  MscS Mechanosensitive ion channel  28.78 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.351236  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  31.73 
 
 		 275 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4512  MscS mechanosensitive ion channel  32.28 
 
 		 277 aa  143  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  29.52 
 
 		 549 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  29.52 
 
 		 549 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  29.52 
 
 		 549 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  32.1 
 
 		 275 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  31.37 
 
 		 274 aa  142  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  31 
 
 		 275 aa  141  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  34.92 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  30 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  30.63 
 
 		 534 aa  141  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0463  MscS mechanosensitive ion channel  30.74 
 
 		 278 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.11026  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3856  MscS mechanosensitive ion channel  30.74 
 
 		 278 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.20088  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  31.09 
 
 		 275 aa  137  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  28.3 
 
 		 532 aa  138  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  31.4 
 
 		 276 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0487  MscS Mechanosensitive ion channel  30.74 
 
 		 278 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0484  MscS mechanosensitive ion channel  30.74 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0216741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0246  hypothetical protein  29.2 
 
 		 285 aa  136  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  31.32 
 
 		 274 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  30.38 
 
 		 298 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  32.21 
 
 		 274 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  27.17 
 
 		 563 aa  135  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  30.28 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  30.28 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  30.28 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  30.28 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  30.28 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  30.28 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  30.28 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  30.28 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  31.13 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  30.28 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1342  MscS Mechanosensitive ion channel  34.32 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00293598  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  30.65 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  30.5 
 
 		 268 aa  132  5e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  30.57 
 
 		 274 aa  132  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5331  MscS mechanosensitive ion channel  31.62 
 
 		 301 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  29.21 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  30.74 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  29.6 
 
 		 561 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  29.34 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4436  MscS Mechanosensitive ion channel  31.54 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.312478 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0457  MscS mechanosensitive ion channel  28.47 
 
 		 278 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  33.2 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4433  MscS Mechanosensitive ion channel  31.54 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  29.04 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  34.3 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  33.2 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  33.2 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  31.92 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  33.2 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  33.2 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0539  MscS mechanosensitive ion channel  29.63 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.815557  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0541  MscS mechanosensitive ion channel  28.35 
 
 		 273 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  29.57 
 
 		 280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4503  MscS Mechanosensitive ion channel  31.15 
 
 		 285 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  31.66 
 
 		 269 aa  128  9.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  31.11 
 
 		 494 aa  128  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4349  MscS Mechanosensitive ion channel  31.15 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  28.29 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3394  MscS mechanosensitive ion channel  28.15 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00053127  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0104  mechanosensitive ion channel family protein  30.08 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  34.33 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  32.33 
 
 		 284 aa  126  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  34.36 
 
 		 200 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3406  MscS mechanosensitive ion channel  31.11 
 
 		 277 aa  125  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0457  MscS mechanosensitive ion channel  29.59 
 
 		 277 aa  125  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1245  ion channel protein  30.8 
 
 		 261 aa  125  8.000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  30.35 
 
 		 531 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  26.92 
 
 		 289 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>