More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0321 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0321  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 261 aa  524  1e-148  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1649  MscS Mechanosensitive ion channel  57.54 
 
 		 256 aa  317  1e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0886  MscS mechanosensitive ion channel  52.38 
 
 		 259 aa  288  8e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.36483  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1226  MscS mechanosensitive ion channel  44.76 
 
 		 268 aa  229  4e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.735162  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1229  MscS mechanosensitive ion channel  43.95 
 
 		 268 aa  227  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337735  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0104  MscS mechanosensitive ion channel  34.98 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00989653  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  35.75 
 
 		 561 aa  138  7e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  32.31 
 
 		 275 aa  137  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  31.47 
 
 		 275 aa  137  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  33.06 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  33.06 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  32.35 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  32.65 
 
 		 275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  32.24 
 
 		 275 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  32.23 
 
 		 275 aa  135  8e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 540 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  31.75 
 
 		 538 aa  133  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  31.82 
 
 		 275 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  31.82 
 
 		 275 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  33.88 
 
 		 274 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  32.34 
 
 		 276 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  31.82 
 
 		 275 aa  131  9e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  32.14 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  33.88 
 
 		 274 aa  129  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  30.28 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  31.08 
 
 		 270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  32.14 
 
 		 267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  33.65 
 
 		 544 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  33.18 
 
 		 533 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  33.82 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  32.81 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  30.2 
 
 		 547 aa  126  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  31.35 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 547 aa  126  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  30.08 
 
 		 288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  33.81 
 
 		 292 aa  125  8.000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  30.92 
 
 		 277 aa  125  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  33.82 
 
 		 551 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  33.82 
 
 		 551 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  33.82 
 
 		 550 aa  125  9e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  29.08 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  28.8 
 
 		 534 aa  124  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  29.76 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  33.82 
 
 		 549 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  33.82 
 
 		 549 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  28.74 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  33.82 
 
 		 549 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  30.8 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  28.74 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  28.74 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  28.23 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  28.85 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  28.23 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  28.74 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  28.97 
 
 		 292 aa  123  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  28.74 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  28.23 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  29.64 
 
 		 275 aa  123  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  28.74 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  28.74 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  28.74 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0306  small-conductance mechanosensitive channel  28.23 
 
 		 284 aa  122  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000279081  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  30.92 
 
 		 258 aa  122  7e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  29.92 
 
 		 563 aa  122  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  33.85 
 
 		 200 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  32.84 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0091  MscS mechanosensitive ion channel  29.76 
 
 		 267 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  28.97 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  32.35 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3942  MscS mechanosensitive ion channel  32.16 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.639966 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  32.35 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  32.35 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  32.35 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  30.2 
 
 		 274 aa  120  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  32.86 
 
 		 532 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  28.91 
 
 		 275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  28.29 
 
 		 279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  29.52 
 
 		 494 aa  117  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2090  hypothetical protein  30.86 
 
 		 301 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  25.84 
 
 		 531 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  30.69 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4603  mechanosensitive ion channel family protein  29.44 
 
 		 275 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  28.35 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  29.55 
 
 		 269 aa  116  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3397  MscS mechanosensitive ion channel  31.46 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0204  mechanosensitive ion channel family protein  29.51 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.171183  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0202  mechanosensitive ion channel family protein  29.39 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  28.52 
 
 		 389 aa  113  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1202  MscS Mechanosensitive ion channel  28.52 
 
 		 270 aa  113  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.49703  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  27.38 
 
 		 276 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  30.17 
 
 		 360 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  27.19 
 
 		 283 aa  112  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  25.4 
 
 		 311 aa  112  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1584  MscS mechanosensitive ion channel  29.96 
 
 		 279 aa  112  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00518641  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  25.91 
 
 		 300 aa  112  8.000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  32.02 
 
 		 286 aa  112  8.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  28.97 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  26.07 
 
 		 310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  35.84 
 
 		 360 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0795  MscS mechanosensitive ion channel  34.85 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>