More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2357 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2357  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  697    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.116724  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1210  MscS mechanosensitive ion channel  49.85 
 
 		 344 aa  330  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  46.25 
 
 		 338 aa  317  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  48.39 
 
 		 348 aa  296  4e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000167428  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2568  MscS mechanosensitive ion channel  45.56 
 
 		 358 aa  237  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  44.31 
 
 		 378 aa  231  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  42.58 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0623  MscS Mechanosensitive ion channel  36.79 
 
 		 337 aa  203  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  36.41 
 
 		 345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  29.89 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  29.14 
 
 		 484 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  28.23 
 
 		 364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  29.51 
 
 		 360 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  33.2 
 
 		 547 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  32.21 
 
 		 533 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  27.18 
 
 		 359 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  30.41 
 
 		 538 aa  123  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  25.39 
 
 		 361 aa  122  7e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  32.02 
 
 		 366 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  33.63 
 
 		 563 aa  119  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  25.97 
 
 		 362 aa  119  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  31.94 
 
 		 544 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 551 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 551 aa  117  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  34.4 
 
 		 532 aa  117  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 550 aa  116  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2479  MscS Mechanosensitive ion channel  30.18 
 
 		 383 aa  116  6e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.827266 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  32.57 
 
 		 292 aa  115  8.999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  31.05 
 
 		 549 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  31.05 
 
 		 549 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  31.05 
 
 		 549 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  29.62 
 
 		 561 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  29.36 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  31.4 
 
 		 277 aa  114  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  30.65 
 
 		 547 aa  114  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  28.29 
 
 		 369 aa  113  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2837  MscS Mechanosensitive ion channel  27 
 
 		 366 aa  113  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.426677  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  24.05 
 
 		 362 aa  113  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  30.63 
 
 		 540 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  31.07 
 
 		 275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  31.07 
 
 		 275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  30.82 
 
 		 275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  29.82 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1106  small-conductance mechanosensitive channel  31.4 
 
 		 265 aa  110  5e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  31.82 
 
 		 269 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  30.59 
 
 		 806 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  32.33 
 
 		 685 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  31.15 
 
 		 287 aa  107  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  30.47 
 
 		 275 aa  107  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  30.1 
 
 		 275 aa  107  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  29.97 
 
 		 274 aa  106  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  30.18 
 
 		 275 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  32.39 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13183  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  34.7 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  30.39 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  27.67 
 
 		 494 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  30.34 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  25.21 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  26.84 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  30.9 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  29.82 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  29.82 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19990  small-conductance mechanosensitive channel  36.52 
 
 		 264 aa  104  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  28.68 
 
 		 534 aa  103  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2594  MscS mechanosensitive ion channel  27.56 
 
 		 388 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0905  MscS Mechanosensitive ion channel  24.5 
 
 		 373 aa  103  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  26.84 
 
 		 354 aa  102  8e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 		 426 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  32.85 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  28.25 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  28.99 
 
 		 531 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 752 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  29.57 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  31.37 
 
 		 200 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1409  MscS mechanosensitive ion channel  27.33 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0014  MscS Mechanosensitive ion channel  31.72 
 
 		 289 aa  100  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  30.77 
 
 		 288 aa  100  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  27.68 
 
 		 840 aa  100  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  31.3 
 
 		 352 aa  100  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  27.37 
 
 		 380 aa  99.8  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  29.15 
 
 		 341 aa  99.8  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  31 
 
 		 274 aa  99.8  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  26.85 
 
 		 289 aa  99.4  8e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  28.31 
 
 		 289 aa  99.4  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  28.31 
 
 		 289 aa  99.4  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  28.31 
 
 		 289 aa  99.4  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1300  MscS mechanosensitive ion channel  26.73 
 
 		 343 aa  99.4  9e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.987941  hitchhiker  0.00895683 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  28.52 
 
 		 291 aa  99  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  32.58 
 
 		 270 aa  99  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  26.49 
 
 		 321 aa  99  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.88 
 
 		 479 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  29.12 
 
 		 275 aa  98.2  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  30.84 
 
 		 275 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  27.02 
 
 		 351 aa  98.2  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  30.08 
 
 		 270 aa  98.2  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1462  small-conductance mechanosensitive channel protein  29.31 
 
 		 373 aa  97.4  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  30.43 
 
 		 275 aa  97.1  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  33.05 
 
 		 288 aa  97.1  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  30.24 
 
 		 280 aa  97.1  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  42.75 
 
 		 276 aa  96.7  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>