More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0951 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 341 aa  689    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  40.36 
 
 		 393 aa  192  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  35.14 
 
 		 270 aa  161  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  34.33 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  32.84 
 
 		 274 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  32.18 
 
 		 276 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  34.62 
 
 		 276 aa  149  6e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  32.1 
 
 		 275 aa  149  9e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  32.75 
 
 		 277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1342  MscS Mechanosensitive ion channel  35.17 
 
 		 266 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00293598  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  33.62 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  32.49 
 
 		 274 aa  147  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  32.11 
 
 		 275 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  32.11 
 
 		 275 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  32.11 
 
 		 275 aa  146  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  31.85 
 
 		 534 aa  145  9e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  35.02 
 
 		 280 aa  145  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  32.11 
 
 		 275 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  32.78 
 
 		 406 aa  144  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1584  MscS mechanosensitive ion channel  31.69 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00518641  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  31.33 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  31.33 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  33.2 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  31.47 
 
 		 275 aa  143  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  30.12 
 
 		 275 aa  143  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  31.95 
 
 		 279 aa  142  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  32.68 
 
 		 544 aa  142  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  30.9 
 
 		 275 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  30.12 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  35.74 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  30.71 
 
 		 274 aa  140  3e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  35.21 
 
 		 302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  31.85 
 
 		 275 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  32.03 
 
 		 547 aa  139  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  31.16 
 
 		 298 aa  139  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  32.44 
 
 		 273 aa  138  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  30.15 
 
 		 280 aa  138  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  29.69 
 
 		 533 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  32.32 
 
 		 531 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 549 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  32.35 
 
 		 540 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 549 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  35 
 
 		 277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 549 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  30.94 
 
 		 547 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  32.51 
 
 		 328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  31 
 
 		 279 aa  136  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  37.16 
 
 		 299 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  31.6 
 
 		 275 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  38.62 
 
 		 286 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.461855 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  28.8 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  30.86 
 
 		 550 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2402  hypothetical protein  34.66 
 
 		 279 aa  133  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.267781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4090  MscS mechanosensitive ion channel  34.36 
 
 		 349 aa  133  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  30.65 
 
 		 538 aa  132  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  30.86 
 
 		 551 aa  132  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  31.43 
 
 		 270 aa  132  6.999999999999999e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  30.86 
 
 		 551 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0541  MscS mechanosensitive ion channel  27.73 
 
 		 273 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0767  small-conductance mechanosensitive ion channel  31.95 
 
 		 401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.967765  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  31.37 
 
 		 401 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  31.39 
 
 		 685 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  31.3 
 
 		 322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  33.79 
 
 		 291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  34.18 
 
 		 200 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  33.06 
 
 		 400 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  32.95 
 
 		 362 aa  129  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  31.6 
 
 		 283 aa  129  7.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  30.08 
 
 		 282 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1187  MscS Mechanosensitive ion channel  35.45 
 
 		 305 aa  129  9.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0250538  hitchhiker  0.00000123969 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4603  mechanosensitive ion channel family protein  30.68 
 
 		 275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  30.53 
 
 		 268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  29.74 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  30.15 
 
 		 274 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  28.34 
 
 		 277 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  29.02 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  28.46 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  32.44 
 
 		 275 aa  126  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0427  MscS mechanosensitive ion channel  30.08 
 
 		 288 aa  126  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0918944  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 305 aa  125  7e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  30.5 
 
 		 288 aa  126  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 305 aa  125  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  33.79 
 
 		 291 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  29.96 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3397  MscS mechanosensitive ion channel  27.03 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 276 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  35.42 
 
 		 288 aa  124  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 637 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  27.71 
 
 		 494 aa  124  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  30.18 
 
 		 431 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0015  MscS mechanosensitive ion channel  30.71 
 
 		 287 aa  123  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  30.47 
 
 		 532 aa  123  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  30 
 
 		 281 aa  123  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  29.84 
 
 		 563 aa  123  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  35.1 
 
 		 806 aa  122  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  32.34 
 
 		 292 aa  122  9e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  28.63 
 
 		 284 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  28.74 
 
 		 258 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 288 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>