More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1773 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1773  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 547 aa  1119    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2568  MscS mechanosensitive ion channel  26.12 
 
 		 358 aa  97.1  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  31.56 
 
 		 338 aa  95.1  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2357  hypothetical protein  27.55 
 
 		 348 aa  94.7  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.116724  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  27.85 
 
 		 345 aa  91.7  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  28.15 
 
 		 753 aa  91.3  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1210  MscS mechanosensitive ion channel  28.11 
 
 		 344 aa  90.1  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  27.06 
 
 		 840 aa  90.1  9e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  25.75 
 
 		 378 aa  90.1  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  26.82 
 
 		 348 aa  87.8  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000167428  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 299 aa  87.4  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  27.84 
 
 		 364 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  25.41 
 
 		 874 aa  86.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  27.98 
 
 		 807 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  26.22 
 
 		 361 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  27.71 
 
 		 732 aa  85.1  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  26.12 
 
 		 685 aa  85.1  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  27.9 
 
 		 843 aa  83.6  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  27.47 
 
 		 844 aa  83.2  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3826  MscS Mechanosensitive ion channel  27.12 
 
 		 444 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  25.58 
 
 		 867 aa  80.9  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  25.53 
 
 		 859 aa  80.5  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  25.65 
 
 		 369 aa  80.1  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  24.14 
 
 		 981 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  25.2 
 
 		 806 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  25.21 
 
 		 796 aa  78.2  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  26.01 
 
 		 825 aa  78.2  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  23.33 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  26.48 
 
 		 484 aa  77.4  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  23.48 
 
 		 1105 aa  77.4  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08271  hypothetical protein  28.57 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  24.43 
 
 		 636 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  24.43 
 
 		 636 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  25.23 
 
 		 816 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2215  small-conductance mechanosensitive channel-like  23.85 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0212215  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  24.79 
 
 		 847 aa  74.7  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  25.53 
 
 		 752 aa  74.3  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  24.72 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  21.81 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  24.91 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  25.94 
 
 		 847 aa  74.3  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2035  MscS Mechanosensitive ion channel  24.08 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  24.59 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  25.11 
 
 		 864 aa  73.9  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0579  MscS mechanosensitive ion channel  21.99 
 
 		 440 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0872803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  23.95 
 
 		 849 aa  72.8  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  22.96 
 
 		 845 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2010  MscS Mechanosensitive ion channel  23.67 
 
 		 447 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  25.69 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  22.86 
 
 		 795 aa  70.9  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7380  mechanosensitive ion channel protein  23.77 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  26.24 
 
 		 877 aa  70.5  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2719  MscS Mechanosensitive ion channel  26.46 
 
 		 457 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0803  small mechanosensitive ion channel  25.56 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2560  small-conductance mechanosensitive channel-like  22.39 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  22.55 
 
 		 472 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2507  MscS mechanosensitive ion channel  24.18 
 
 		 475 aa  69.3  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  23.77 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  23.95 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2330  MscS Mechanosensitive ion channel  25.32 
 
 		 458 aa  67.8  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194216  normal  0.152351 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1903  MscS Mechanosensitive ion channel  28.46 
 
 		 303 aa  66.2  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  22.31 
 
 		 832 aa  66.6  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6436  MscS Mechanosensitive ion channel  24.79 
 
 		 432 aa  66.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.227593 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0136  MscS mechanosensitive ion channel  23.61 
 
 		 451 aa  66.2  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 369 aa  66.2  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  23.31 
 
 		 1235 aa  65.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  22.22 
 
 		 860 aa  65.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  23.57 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1816  mscS family protein  23.85 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.316092  normal  0.285124 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  24.9 
 
 		 1111 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0635  small mechanosensitive ion channel  26.34 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.352398  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  25.49 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1699  MscS mechanosensitive ion channel  23.33 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.254155  normal  0.22429 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  23.4 
 
 		 825 aa  64.3  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  25.42 
 
 		 842 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3392  MscS Mechanosensitive ion channel  22.86 
 
 		 833 aa  64.3  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  25.78 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  22.93 
 
 		 1102 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3394  MscS mechanosensitive ion channel  25.83 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00053127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  30.09 
 
 		 1127 aa  62.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  24.53 
 
 		 291 aa  62.8  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  22.51 
 
 		 1144 aa  63.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1849  small mechanosensitive ion channel  26.2 
 
 		 340 aa  63.2  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.00611524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  24.71 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  26.27 
 
 		 298 aa  62.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0623  MscS Mechanosensitive ion channel  25.46 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  24.1 
 
 		 1102 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  23.29 
 
 		 784 aa  62.4  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  24.7 
 
 		 301 aa  62.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  23.45 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  25.77 
 
 		 843 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  21.72 
 
 		 1117 aa  61.6  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  23.53 
 
 		 637 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  24.47 
 
 		 830 aa  62  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  23.36 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07011  small mechanosensitive ion channel  25.45 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184839  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0905  MscS Mechanosensitive ion channel  23.86 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  24.37 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2257  MscS mechanosensitive ion channel  24.06 
 
 		 1110 aa  60.8  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>