More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1650 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1650  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 570 aa  1169    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598293 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0970  small-conductance mechanosensitive ion channel  54.51 
 
 		 650 aa  613  9.999999999999999e-175  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371389 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1446  MscS mechanosensitive ion channel  53.35 
 
 		 648 aa  606  9.999999999999999e-173  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.770596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4873  MscS Mechanosensitive ion channel  33.79 
 
 		 567 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4048  MscS mechanosensitive ion channel  32.21 
 
 		 569 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138882  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4194  MscS mechanosensitive ion channel  32.32 
 
 		 562 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3200  MscS mechanosensitive ion channel  31.54 
 
 		 590 aa  234  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_0969  mechanosensitive ion channel family protein  29.03 
 
 		 554 aa  160  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  32.73 
 
 		 467 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1578  small-conductance mechanosensitive channel  25.26 
 
 		 534 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00006998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2145  MscS mechanosensitive ion channel  26.33 
 
 		 537 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000018711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1500  MscS mechanosensitive ion channel  37.05 
 
 		 614 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1943  MscS mechanosensitive ion channel  23.5 
 
 		 533 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000658199  decreased coverage  0.00758396 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  33.93 
 
 		 431 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  33.64 
 
 		 433 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  33.49 
 
 		 433 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  24.01 
 
 		 380 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009901  Spea_1900  MscS mechanosensitive ion channel  29.82 
 
 		 240 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0998935  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  27.11 
 
 		 362 aa  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
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NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  23.3 
 
 		 633 aa  114  7.000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  25.85 
 
 		 627 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  25.46 
 
 		 624 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  24.56 
 
 		 682 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0263  mechanosensitive ion channel family protein  26.04 
 
 		 627 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  25.37 
 
 		 426 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0289  mechanosensitive ion channel family protein  25.86 
 
 		 627 aa  110  5e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.658149  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  24.02 
 
 		 381 aa  108  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
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NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  27.02 
 
 		 356 aa  107  8e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  28.33 
 
 		 351 aa  104  4e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  28.14 
 
 		 369 aa  104  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0641  hypothetical protein  27.17 
 
 		 543 aa  100  7e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007520  Tcr_1295  MscS mechanosensitive ion channel  25.56 
 
 		 391 aa  100  8e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1409  MscS mechanosensitive ion channel  28.14 
 
 		 351 aa  100  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  27.11 
 
 		 352 aa  98.2  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  27.49 
 
 		 384 aa  95.5  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1267  MscS mechanosensitive ion channel  28.33 
 
 		 351 aa  94.7  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  32.06 
 
 		 479 aa  93.6  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
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NC_013171  Apre_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  30.82 
 
 		 283 aa  92.8  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4500  MscS Mechanosensitive ion channel  21.35 
 
 		 662 aa  93.2  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  25.5 
 
 		 354 aa  92  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0042  MscS Mechanosensitive ion channel  30.1 
 
 		 375 aa  92.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634821  normal  0.103785 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  25.09 
 
 		 413 aa  92.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  30.27 
 
 		 624 aa  92  3e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
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NC_011884  Cyan7425_4427  MscS Mechanosensitive ion channel  26.3 
 
 		 349 aa  91.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0238849  normal  0.125106 
 
 
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NC_008261  CPF_0253  mechanosensitive ion channel family protein  34.59 
 
 		 378 aa  90.9  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008262  CPR_0247  mechanosensitive ion channel family protein  34.05 
 
 		 378 aa  90.1  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  32.35 
 
 		 344 aa  89  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal  1 
 
 
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NC_003296  RS00392  hypothetical protein  23.28 
 
 		 377 aa  89  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.65965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  23.67 
 
 		 362 aa  89.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A1350  MscS Mechanosensitive ion channel  24.08 
 
 		 377 aa  87.8  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000205244  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4932  MscS Mechanosensitive ion channel  22.31 
 
 		 400 aa  87.4  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4689  MscS Mechanosensitive ion channel  23.55 
 
 		 374 aa  87.4  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3612  MscS Mechanosensitive ion channel  23.55 
 
 		 374 aa  87.4  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649067 
 
 
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NC_007947  Mfla_1452  MscS mechanosensitive ion channel  25.11 
 
 		 355 aa  87  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.678727  normal  0.0144942 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1366  MscS Mechanosensitive ion channel  23.77 
 
 		 377 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0389612  hitchhiker  0.000813003 
 
 
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NC_011149  SeAg_B1920  MscS Mechanosensitive ion channel  23.77 
 
 		 377 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000103017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  32.77 
 
 		 362 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C1381  MscS Mechanosensitive ion channel  23.77 
 
 		 377 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.524748 
 
 
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NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  32.04 
 
 		 773 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A2101  MscS Mechanosensitive ion channel  23.77 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188968 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1462  small-conductance mechanosensitive channel protein  25.63 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008786  Veis_0172  MscS mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  0.753414 
 
 
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NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  28.24 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  27.93 
 
 		 360 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  32.77 
 
 		 362 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1352  MscS mechanosensitive ion channel  22.12 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.308859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0803  small mechanosensitive ion channel  20.71 
 
 		 342 aa  82.4  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  25.91 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  28.24 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  28.24 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  28.24 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0460  putative mechanosensitive ion channel  29.23 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  28.24 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  25.91 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
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NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  25.91 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  28.24 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0922  MscS mechanosensitive ion channel  28.08 
 
 		 456 aa  80.9  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837868 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  28.24 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  25.32 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  26.09 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  29.27 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  27.22 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  28.24 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
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NC_014150  Bmur_0707  MscS Mechanosensitive ion channel  29.11 
 
 		 344 aa  79.7  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000854556  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  26.97 
 
 		 285 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_2171  MscS mechanosensitive ion channel  23.04 
 
 		 374 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920192  normal  1 
 
 
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NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  25.56 
 
 		 383 aa  80.1  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  28.09 
 
 		 285 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  25.56 
 
 		 383 aa  80.1  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_4608  MscS mechanosensitive ion channel  33.93 
 
 		 386 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.247282  normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_4007  MscS mechanosensitive ion channel  32.06 
 
 		 376 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0987654  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3649  mechanosensitive ion channel family protein  22.27 
 
 		 374 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
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NC_007963  Csal_2066  MscS mechanosensitive ion channel  26.94 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.838165  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_0442  MscS Mechanosensitive ion channel  29.05 
 
 		 363 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_20120  Mechanosensitive ion channel family protein  20.91 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  27.88 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  28.09 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
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NC_011988  Avi_6137  hypothetical protein  28.43 
 
 		 725 aa  78.2  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.119326  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_3357  MscS Mechanosensitive ion channel  32.06 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011901  Tgr7_2594  MscS mechanosensitive ion channel  25.31 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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