More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0970 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0970  small-conductance mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 650 aa  1326    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371389 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1446  MscS mechanosensitive ion channel  90.42 
 
 		 648 aa  1182    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.770596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1650  MscS mechanosensitive ion channel  54.51 
 
 		 570 aa  613  9.999999999999999e-175  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4873  MscS Mechanosensitive ion channel  32.2 
 
 		 567 aa  296  8e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4048  MscS mechanosensitive ion channel  32.01 
 
 		 569 aa  283  9e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138882  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4194  MscS mechanosensitive ion channel  32.7 
 
 		 562 aa  270  7e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3200  MscS mechanosensitive ion channel  31.52 
 
 		 590 aa  229  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1943  MscS mechanosensitive ion channel  25.44 
 
 		 533 aa  171  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000658199  decreased coverage  0.00758396 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2145  MscS mechanosensitive ion channel  27.46 
 
 		 537 aa  167  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000018711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1578  small-conductance mechanosensitive channel  24.95 
 
 		 534 aa  167  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00006998  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0969  mechanosensitive ion channel family protein  29.06 
 
 		 554 aa  156  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  30.23 
 
 		 467 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1500  MscS mechanosensitive ion channel  26.18 
 
 		 614 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638706  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  34.45 
 
 		 433 aa  134  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  34.45 
 
 		 433 aa  134  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  34.93 
 
 		 431 aa  134  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  25.42 
 
 		 380 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1900  MscS mechanosensitive ion channel  27.57 
 
 		 240 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0998935  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  24.8 
 
 		 381 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0263  mechanosensitive ion channel family protein  26.12 
 
 		 627 aa  107  8e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  27.24 
 
 		 362 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  33.17 
 
 		 633 aa  104  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0289  mechanosensitive ion channel family protein  25.59 
 
 		 627 aa  103  7e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.658149  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  26.5 
 
 		 351 aa  103  7e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  25.59 
 
 		 627 aa  102  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  25.15 
 
 		 682 aa  102  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  24.84 
 
 		 413 aa  100  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1409  MscS mechanosensitive ion channel  25.93 
 
 		 351 aa  100  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  26.43 
 
 		 384 aa  98.6  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4500  MscS Mechanosensitive ion channel  26.49 
 
 		 662 aa  98.6  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0641  hypothetical protein  36.36 
 
 		 543 aa  98.6  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 406 aa  98.2  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1267  MscS mechanosensitive ion channel  26.78 
 
 		 351 aa  98.2  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  27.09 
 
 		 356 aa  98.2  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  26.42 
 
 		 369 aa  97.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1295  MscS mechanosensitive ion channel  25.48 
 
 		 391 aa  95.5  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  27.92 
 
 		 624 aa  95.5  3e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0253  mechanosensitive ion channel family protein  31.49 
 
 		 378 aa  95.5  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0247  mechanosensitive ion channel family protein  31.49 
 
 		 378 aa  95.1  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4932  MscS Mechanosensitive ion channel  24.11 
 
 		 400 aa  94.7  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  26.4 
 
 		 383 aa  94.4  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1004  MscS mechanosensitive ion channel  22.18 
 
 		 648 aa  94  7e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  26.36 
 
 		 383 aa  93.6  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  36.75 
 
 		 352 aa  92.8  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  35.16 
 
 		 479 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  24.42 
 
 		 426 aa  92  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  33.73 
 
 		 624 aa  90.5  9e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1920  MscS Mechanosensitive ion channel  23.69 
 
 		 377 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000103017  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1381  MscS Mechanosensitive ion channel  23.69 
 
 		 377 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.524748 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0442  MscS Mechanosensitive ion channel  32.93 
 
 		 363 aa  90.5  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1366  MscS Mechanosensitive ion channel  23.69 
 
 		 377 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0389612  hitchhiker  0.000813003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1350  MscS Mechanosensitive ion channel  23.69 
 
 		 377 aa  89.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000205244  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  27.18 
 
 		 362 aa  89.7  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2066  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 424 aa  89  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.838165  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2101  MscS Mechanosensitive ion channel  23.69 
 
 		 377 aa  89  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188968 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1352  MscS mechanosensitive ion channel  24.36 
 
 		 376 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.308859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  25.09 
 
 		 362 aa  87.4  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 362 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  26.38 
 
 		 359 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  26.64 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  25.9 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  33.76 
 
 		 773 aa  84.7  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0042  MscS Mechanosensitive ion channel  28.37 
 
 		 375 aa  84  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.634821  normal  0.103785 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  25.81 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0767  small-conductance mechanosensitive ion channel  25.4 
 
 		 401 aa  83.2  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.967765  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  30.46 
 
 		 879 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  28.64 
 
 		 876 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0172  MscS mechanosensitive ion channel  27.31 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  25.99 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20120  Mechanosensitive ion channel family protein  21.66 
 
 		 418 aa  80.1  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  28.14 
 
 		 767 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1410  MscS Mechanosensitive ion channel  31.9 
 
 		 362 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  25.88 
 
 		 283 aa  79.3  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0905  MscS Mechanosensitive ion channel  24.91 
 
 		 373 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  33.06 
 
 		 352 aa  79.3  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4427  MscS Mechanosensitive ion channel  25.32 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0238849  normal  0.125106 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  26.83 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1411  MscS Mechanosensitive ion channel  32.28 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  33.04 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  29.33 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  26.09 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  22.9 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  25.23 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  27.93 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  30.13 
 
 		 735 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  27.93 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  27.93 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  27.93 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  27.93 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  27.93 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4819  MscS mechanosensitive ion channel  33.91 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  30.13 
 
 		 735 aa  77  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1822  MscS mechanosensitive ion channel  22.64 
 
 		 374 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00396347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  31.11 
 
 		 289 aa  76.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  23.56 
 
 		 275 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4608  MscS mechanosensitive ion channel  26.69 
 
 		 386 aa  76.6  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.247282  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>