More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0332 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 773 aa  1560    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1627  MscS mechanosensitive ion channel  37.69 
 
 		 881 aa  315  2.9999999999999996e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3687  MscS mechanosensitive ion channel  34.52 
 
 		 784 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276928  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2401  MscS Mechanosensitive ion channel  46.32 
 
 		 718 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0124939 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  48.51 
 
 		 693 aa  229  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2973  MscS Mechanosensitive ion channel  45.32 
 
 		 652 aa  228  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1790  MscS Mechanosensitive ion channel  31.37 
 
 		 716 aa  226  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.192721 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1971  MscS Mechanosensitive ion channel  39.23 
 
 		 716 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170847  normal  0.348628 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4584  MscS mechanosensitive ion channel  41.67 
 
 		 697 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.99351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4049  MscS Mechanosensitive ion channel  42.65 
 
 		 650 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3523  MscS Mechanosensitive ion channel  44.07 
 
 		 703 aa  202  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0609886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5772  MscS mechanosensitive ion channel  39.62 
 
 		 705 aa  201  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429261  normal  0.122613 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3228  MscS Mechanosensitive ion channel  44.07 
 
 		 704 aa  200  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6137  hypothetical protein  40.3 
 
 		 725 aa  198  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.119326  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5133  MscS Mechanosensitive ion channel  45.13 
 
 		 658 aa  197  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538778  normal  0.147558 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5420  MscS Mechanosensitive ion channel  27.15 
 
 		 889 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0901  MscS Mechanosensitive ion channel  28.35 
 
 		 766 aa  180  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1181  hypothetical protein  27.11 
 
 		 884 aa  179  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.40697 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  30.61 
 
 		 822 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  30.61 
 
 		 822 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  30.61 
 
 		 822 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0349  MscS Mechanosensitive ion channel  32.39 
 
 		 759 aa  173  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3072  MscS mechanosensitive ion channel  29.68 
 
 		 773 aa  173  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.718015  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  30.96 
 
 		 753 aa  172  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0181  MscS mechanosensitive ion channel  30.4 
 
 		 707 aa  171  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3797  MscS mechanosensitive ion channel  27.07 
 
 		 871 aa  170  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198076  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3278  MscS mechanosensitive ion channel  26.89 
 
 		 864 aa  171  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  31.78 
 
 		 787 aa  170  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1895  small-conductance mechanosensitive ion channel  31.78 
 
 		 787 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  32.65 
 
 		 787 aa  167  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4477  MscS mechanosensitive ion channel  30.7 
 
 		 772 aa  167  9e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5311  MscS mechanosensitive ion channel  25.14 
 
 		 858 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021896 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1457  MscS mechanosensitive ion channel  26.65 
 
 		 768 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 821 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1476  hypothetical protein  27.03 
 
 		 737 aa  164  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3871  MscS mechanosensitive ion channel  29.25 
 
 		 674 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5033  MscS mechanosensitive ion channel  29.01 
 
 		 701 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149124 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1487  MscS mechanosensitive ion channel  29 
 
 		 796 aa  162  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  31.46 
 
 		 767 aa  161  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  27.98 
 
 		 735 aa  162  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0676  mechanosensitive ion channel family protein  29.43 
 
 		 767 aa  160  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  27.64 
 
 		 735 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  30.92 
 
 		 876 aa  159  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1514  MscS mechanosensitive ion channel  25.14 
 
 		 836 aa  159  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.767095  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 321 aa  159  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  34.07 
 
 		 505 aa  157  9e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  30.03 
 
 		 879 aa  156  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  35.11 
 
 		 792 aa  156  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  32.74 
 
 		 718 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1224  MscS Mechanosensitive ion channel  24.48 
 
 		 838 aa  154  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2666  MscS Mechanosensitive ion channel  27.45 
 
 		 911 aa  154  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232424  normal  0.397707 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  38.01 
 
 		 356 aa  153  8.999999999999999e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3104  MscS mechanosensitive ion channel  30.1 
 
 		 790 aa  153  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  32.29 
 
 		 719 aa  152  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3068  hypothetical protein  33.47 
 
 		 756 aa  150  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.36924 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4680  MscS mechanosensitive ion channel  26.15 
 
 		 837 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2784  MscS mechanosensitive ion channel  27.6 
 
 		 801 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1320  MscS mechanosensitive ion channel  32.29 
 
 		 717 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1728  hypothetical protein  32.29 
 
 		 717 aa  147  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784062  normal  0.0313644 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  33.03 
 
 		 771 aa  147  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3991  MscS mechanosensitive ion channel  32.29 
 
 		 715 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0693455  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2998  putative mechanosensitive ion channel  34.33 
 
 		 826 aa  145  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 335 aa  145  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  32.27 
 
 		 762 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  32.6 
 
 		 550 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  34.58 
 
 		 342 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  34.54 
 
 		 308 aa  140  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00775  predicted mechanosensitive channel  25.48 
 
 		 741 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2834  MscS Mechanosensitive ion channel  25.48 
 
 		 741 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.269757  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00792  hypothetical protein  25.48 
 
 		 741 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2835  hypothetical protein  25.48 
 
 		 741 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.49236  normal  0.59414 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0876  hypothetical protein  25.48 
 
 		 741 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000367014  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0831  hypothetical protein  25.48 
 
 		 741 aa  140  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0229209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0956  hypothetical protein  25.68 
 
 		 741 aa  140  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0640759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0863  hypothetical protein  25.29 
 
 		 741 aa  139  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00697122  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 442 aa  138  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3001  MscS Mechanosensitive ion channel  28.9 
 
 		 755 aa  138  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.996341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3348  MscS Mechanosensitive ion channel  28.7 
 
 		 757 aa  138  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.703913 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  34.25 
 
 		 294 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  31.13 
 
 		 528 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  31.13 
 
 		 528 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  36.09 
 
 		 335 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  34.43 
 
 		 454 aa  136  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  33.8 
 
 		 299 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  34.18 
 
 		 394 aa  135  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  33.47 
 
 		 327 aa  135  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  33.47 
 
 		 327 aa  135  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  33.2 
 
 		 327 aa  134  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  35.93 
 
 		 342 aa  134  9e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2062  MscS mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 747 aa  133  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11550  small-conductance mechanosensitive channel  34.74 
 
 		 316 aa  133  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 273 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  31.16 
 
 		 288 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0186  MscS Mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 304 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  34.12 
 
 		 336 aa  132  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 336 aa  132  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0975  hypothetical protein  24.36 
 
 		 740 aa  131  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0954  hypothetical protein  24.36 
 
 		 740 aa  131  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  34.72 
 
 		 337 aa  131  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 285 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>