More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3563 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 762 aa  1506    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  67.48 
 
 		 771 aa  865    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  44.44 
 
 		 767 aa  536  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  45.07 
 
 		 876 aa  533  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  44.27 
 
 		 879 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  38.75 
 
 		 718 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  36.3 
 
 		 719 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1320  MscS mechanosensitive ion channel  37.95 
 
 		 717 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1728  hypothetical protein  37.65 
 
 		 717 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784062  normal  0.0313644 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3001  MscS Mechanosensitive ion channel  41.48 
 
 		 755 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.996341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3348  MscS Mechanosensitive ion channel  41.78 
 
 		 757 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.703913 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3991  MscS mechanosensitive ion channel  37.78 
 
 		 715 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0693455  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  38.26 
 
 		 735 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  37.95 
 
 		 735 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3068  hypothetical protein  40.35 
 
 		 756 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.36924 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  38.9 
 
 		 787 aa  429  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5033  MscS mechanosensitive ion channel  37.68 
 
 		 701 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0676  mechanosensitive ion channel family protein  37.11 
 
 		 767 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4477  MscS mechanosensitive ion channel  34.6 
 
 		 772 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3871  MscS mechanosensitive ion channel  36.98 
 
 		 674 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2062  MscS mechanosensitive ion channel  35.8 
 
 		 747 aa  330  4e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  34.99 
 
 		 787 aa  210  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1895  small-conductance mechanosensitive ion channel  34.99 
 
 		 787 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3072  MscS mechanosensitive ion channel  30.21 
 
 		 773 aa  208  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.718015  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0901  MscS Mechanosensitive ion channel  33.77 
 
 		 766 aa  208  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0349  MscS Mechanosensitive ion channel  35.35 
 
 		 759 aa  200  7e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  33.17 
 
 		 753 aa  200  7.999999999999999e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  37.59 
 
 		 792 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2784  MscS mechanosensitive ion channel  32.01 
 
 		 801 aa  199  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3104  MscS mechanosensitive ion channel  31.91 
 
 		 790 aa  196  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5420  MscS Mechanosensitive ion channel  30.26 
 
 		 889 aa  195  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  33.81 
 
 		 505 aa  194  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1181  hypothetical protein  34.67 
 
 		 884 aa  194  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.40697 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  34.36 
 
 		 822 aa  191  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  34.36 
 
 		 822 aa  191  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  34.36 
 
 		 822 aa  191  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2998  putative mechanosensitive ion channel  31.57 
 
 		 826 aa  189  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0181  MscS mechanosensitive ion channel  32.13 
 
 		 707 aa  189  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3797  MscS mechanosensitive ion channel  32.08 
 
 		 871 aa  187  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198076  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  33.86 
 
 		 821 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1514  MscS mechanosensitive ion channel  34.66 
 
 		 836 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.767095  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3278  MscS mechanosensitive ion channel  31.76 
 
 		 864 aa  185  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5311  MscS mechanosensitive ion channel  31.51 
 
 		 858 aa  182  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021896 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1457  MscS mechanosensitive ion channel  35.76 
 
 		 768 aa  181  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1487  MscS mechanosensitive ion channel  31.51 
 
 		 796 aa  178  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4680  MscS mechanosensitive ion channel  34.77 
 
 		 837 aa  177  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2666  MscS Mechanosensitive ion channel  32.51 
 
 		 911 aa  175  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232424  normal  0.397707 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  36.86 
 
 		 550 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  37.72 
 
 		 321 aa  171  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5772  MscS mechanosensitive ion channel  35.19 
 
 		 705 aa  167  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429261  normal  0.122613 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  32.18 
 
 		 693 aa  167  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1971  MscS Mechanosensitive ion channel  30.03 
 
 		 716 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170847  normal  0.348628 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2401  MscS Mechanosensitive ion channel  35.48 
 
 		 718 aa  164  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0124939 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  35.94 
 
 		 528 aa  164  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  35.94 
 
 		 528 aa  164  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4584  MscS mechanosensitive ion channel  31.79 
 
 		 697 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.99351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 273 aa  163  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5133  MscS Mechanosensitive ion channel  34.94 
 
 		 658 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538778  normal  0.147558 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4049  MscS Mechanosensitive ion channel  38.81 
 
 		 650 aa  163  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1790  MscS Mechanosensitive ion channel  29.59 
 
 		 716 aa  162  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.192721 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1224  MscS Mechanosensitive ion channel  26.37 
 
 		 838 aa  160  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  31.23 
 
 		 568 aa  158  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0186  MscS Mechanosensitive ion channel  37.08 
 
 		 304 aa  154  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6137  hypothetical protein  29.61 
 
 		 725 aa  153  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.119326  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  30.85 
 
 		 537 aa  152  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  30.03 
 
 		 538 aa  150  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  28.9 
 
 		 773 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  35.27 
 
 		 350 aa  149  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  32.84 
 
 		 289 aa  146  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1476  hypothetical protein  29.81 
 
 		 737 aa  145  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  35.11 
 
 		 283 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0956  hypothetical protein  27.86 
 
 		 741 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0640759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  35.59 
 
 		 344 aa  142  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  34.23 
 
 		 356 aa  142  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  37.33 
 
 		 549 aa  141  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  35.16 
 
 		 299 aa  141  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00775  predicted mechanosensitive channel  27.94 
 
 		 741 aa  140  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2834  MscS Mechanosensitive ion channel  27.94 
 
 		 741 aa  140  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.269757  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0831  hypothetical protein  27.94 
 
 		 741 aa  140  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0229209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2835  hypothetical protein  27.94 
 
 		 741 aa  140  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.49236  normal  0.59414 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00792  hypothetical protein  27.94 
 
 		 741 aa  140  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0876  hypothetical protein  27.94 
 
 		 741 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000367014  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  34.11 
 
 		 335 aa  140  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  32.57 
 
 		 308 aa  140  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3687  MscS mechanosensitive ion channel  33.18 
 
 		 784 aa  140  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276928  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0863  hypothetical protein  27.72 
 
 		 741 aa  139  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00697122  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  30.38 
 
 		 288 aa  139  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1627  MscS mechanosensitive ion channel  29.8 
 
 		 881 aa  139  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  35.43 
 
 		 294 aa  137  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1803  MscS Mechanosensitive ion channel  31.74 
 
 		 595 aa  137  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  0.895337 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  31.95 
 
 		 394 aa  136  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  35.56 
 
 		 335 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0954  hypothetical protein  27.6 
 
 		 740 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2973  MscS Mechanosensitive ion channel  34.73 
 
 		 652 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  33.63 
 
 		 336 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3523  MscS Mechanosensitive ion channel  34.44 
 
 		 703 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0609886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  32.33 
 
 		 599 aa  135  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0975  hypothetical protein  27.39 
 
 		 740 aa  135  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1295  hypothetical protein  29.34 
 
 		 737 aa  135  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.159266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  29.55 
 
 		 325 aa  134  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>