More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0499 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 321 aa  643    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  49.8 
 
 		 273 aa  249  4e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3072  MscS mechanosensitive ion channel  47.76 
 
 		 773 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.718015  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0901  MscS Mechanosensitive ion channel  42.43 
 
 		 766 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0186  MscS Mechanosensitive ion channel  46.28 
 
 		 304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  41.77 
 
 		 505 aa  229  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  47.7 
 
 		 792 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0349  MscS Mechanosensitive ion channel  44.53 
 
 		 759 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  41.38 
 
 		 787 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1895  small-conductance mechanosensitive ion channel  47.19 
 
 		 787 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  40.65 
 
 		 753 aa  223  4e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0181  MscS mechanosensitive ion channel  40.78 
 
 		 707 aa  218  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2784  MscS mechanosensitive ion channel  42.18 
 
 		 801 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  36.49 
 
 		 568 aa  203  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2998  putative mechanosensitive ion channel  43.09 
 
 		 826 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3104  MscS mechanosensitive ion channel  44.24 
 
 		 790 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  41.3 
 
 		 876 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  43.31 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  41.42 
 
 		 767 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  36.25 
 
 		 787 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  36.08 
 
 		 879 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  36.69 
 
 		 288 aa  188  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  37.45 
 
 		 718 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  39.27 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  34.04 
 
 		 550 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  36.54 
 
 		 719 aa  182  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  39.02 
 
 		 735 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  40.07 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  37.96 
 
 		 735 aa  178  9e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  43.31 
 
 		 350 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1728  hypothetical protein  37.05 
 
 		 717 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784062  normal  0.0313644 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3991  MscS mechanosensitive ion channel  37.05 
 
 		 715 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0693455  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1320  MscS mechanosensitive ion channel  37.05 
 
 		 717 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1457  MscS mechanosensitive ion channel  40.81 
 
 		 768 aa  176  7e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2666  MscS Mechanosensitive ion channel  40.55 
 
 		 911 aa  175  8e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232424  normal  0.397707 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  39.65 
 
 		 771 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  42.55 
 
 		 335 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2062  MscS mechanosensitive ion channel  40.91 
 
 		 747 aa  172  5e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  37.72 
 
 		 762 aa  172  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  33.7 
 
 		 283 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  38.56 
 
 		 538 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  44.5 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5311  MscS mechanosensitive ion channel  36.42 
 
 		 858 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021896 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  36.88 
 
 		 285 aa  169  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  37.18 
 
 		 693 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1514  MscS mechanosensitive ion channel  40.27 
 
 		 836 aa  168  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.767095  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1971  MscS Mechanosensitive ion channel  40.52 
 
 		 716 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170847  normal  0.348628 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  38.66 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  42.34 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  41.59 
 
 		 442 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  35.04 
 
 		 528 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  35.04 
 
 		 528 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1790  MscS Mechanosensitive ion channel  40.43 
 
 		 716 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.192721 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  35.27 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  35.4 
 
 		 394 aa  166  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1487  MscS mechanosensitive ion channel  44.95 
 
 		 796 aa  166  5e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5033  MscS mechanosensitive ion channel  38.4 
 
 		 701 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3871  MscS mechanosensitive ion channel  41.15 
 
 		 674 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 822 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  33 
 
 		 299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 822 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 822 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  34.97 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4680  MscS mechanosensitive ion channel  38.01 
 
 		 837 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  35.6 
 
 		 821 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1456  mechanosensitive ion channel protein  38.77 
 
 		 455 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000389307  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1324  MscS mechanosensitive ion channel  38.36 
 
 		 458 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00452452  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1224  MscS Mechanosensitive ion channel  34.84 
 
 		 838 aa  162  8.000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  35.84 
 
 		 537 aa  161  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  37.25 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  40.65 
 
 		 454 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  38.01 
 
 		 370 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1579  mechanosensitive ion channel family protein  38.39 
 
 		 455 aa  161  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.397271  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  33.81 
 
 		 293 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  33.81 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  33.81 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  33.81 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  33.81 
 
 		 293 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  33.81 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  42.71 
 
 		 372 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  33.81 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3797  MscS mechanosensitive ion channel  33.46 
 
 		 871 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198076  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3278  MscS mechanosensitive ion channel  33.46 
 
 		 864 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 773 aa  159  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3068  hypothetical protein  37.12 
 
 		 756 aa  159  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.36924 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  39.15 
 
 		 344 aa  159  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  37.28 
 
 		 336 aa  159  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  38.32 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  34.4 
 
 		 285 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1181  hypothetical protein  36.25 
 
 		 884 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.40697 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5772  MscS mechanosensitive ion channel  37.74 
 
 		 705 aa  155  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429261  normal  0.122613 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5133  MscS Mechanosensitive ion channel  36.05 
 
 		 658 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538778  normal  0.147558 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5420  MscS Mechanosensitive ion channel  35.16 
 
 		 889 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0676  mechanosensitive ion channel family protein  38.83 
 
 		 767 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4477  MscS mechanosensitive ion channel  38.83 
 
 		 772 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4584  MscS mechanosensitive ion channel  35.79 
 
 		 697 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.99351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3911  MscS mechanosensitive ion channel  35.45 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  36.82 
 
 		 549 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  33.45 
 
 		 293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  37.56 
 
 		 289 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>