More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2834 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00775  predicted mechanosensitive channel  100 
 
 		 741 aa  1502    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2834  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 741 aa  1502    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.269757  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0876  hypothetical protein  99.87 
 
 		 741 aa  1502    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000367014  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0863  hypothetical protein  99.87 
 
 		 741 aa  1499    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00697122  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0831  hypothetical protein  99.6 
 
 		 741 aa  1496    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0229209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0954  hypothetical protein  85.85 
 
 		 740 aa  1248    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0922  hypothetical protein  85.44 
 
 		 740 aa  1228    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.493132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1476  hypothetical protein  48.31 
 
 		 737 aa  639    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0891  hypothetical protein  85.31 
 
 		 740 aa  1228    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0863  hypothetical protein  85.58 
 
 		 740 aa  1230    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1295  hypothetical protein  82.59 
 
 		 737 aa  1209    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.159266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0975  hypothetical protein  85.71 
 
 		 740 aa  1240    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2835  hypothetical protein  100 
 
 		 741 aa  1502    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.49236  normal  0.59414 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0956  hypothetical protein  99.6 
 
 		 741 aa  1496    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0640759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00792  hypothetical protein  100 
 
 		 741 aa  1502    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0349  MscS Mechanosensitive ion channel  37.21 
 
 		 759 aa  429  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3104  MscS mechanosensitive ion channel  38.23 
 
 		 790 aa  412  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2784  MscS mechanosensitive ion channel  35.58 
 
 		 801 aa  401  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0181  MscS mechanosensitive ion channel  37.04 
 
 		 707 aa  395  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0901  MscS Mechanosensitive ion channel  34.58 
 
 		 766 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  34.64 
 
 		 753 aa  356  8.999999999999999e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1457  MscS mechanosensitive ion channel  32.17 
 
 		 768 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  30.24 
 
 		 787 aa  303  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1895  small-conductance mechanosensitive ion channel  30.5 
 
 		 787 aa  303  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2998  putative mechanosensitive ion channel  35.48 
 
 		 826 aa  275  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  37.83 
 
 		 792 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3072  MscS mechanosensitive ion channel  28.51 
 
 		 773 aa  211  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.718015  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  28.88 
 
 		 822 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  28.88 
 
 		 822 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  28.88 
 
 		 822 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3797  MscS mechanosensitive ion channel  27.91 
 
 		 871 aa  179  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198076  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1514  MscS mechanosensitive ion channel  27.68 
 
 		 836 aa  178  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.767095  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5311  MscS mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 858 aa  177  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021896 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2666  MscS Mechanosensitive ion channel  28.73 
 
 		 911 aa  176  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232424  normal  0.397707 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3278  MscS mechanosensitive ion channel  27.74 
 
 		 864 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  28.1 
 
 		 821 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1224  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 838 aa  175  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5420  MscS Mechanosensitive ion channel  26.82 
 
 		 889 aa  172  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1181  hypothetical protein  30.98 
 
 		 884 aa  169  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.40697 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4680  MscS mechanosensitive ion channel  28.36 
 
 		 837 aa  167  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  25.29 
 
 		 773 aa  160  9e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  37.55 
 
 		 321 aa  159  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  32.63 
 
 		 735 aa  159  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  32.63 
 
 		 735 aa  158  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 787 aa  156  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  36.55 
 
 		 767 aa  154  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  34.55 
 
 		 719 aa  152  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  36.55 
 
 		 876 aa  152  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3068  hypothetical protein  34.92 
 
 		 756 aa  151  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.36924 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  35.42 
 
 		 879 aa  151  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3871  MscS mechanosensitive ion channel  27.29 
 
 		 674 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  35.63 
 
 		 762 aa  148  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  36.64 
 
 		 771 aa  147  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  27.64 
 
 		 718 aa  147  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1971  MscS Mechanosensitive ion channel  28.47 
 
 		 716 aa  146  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170847  normal  0.348628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1320  MscS mechanosensitive ion channel  29.04 
 
 		 717 aa  144  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  32.21 
 
 		 299 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1487  MscS mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 796 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  31.54 
 
 		 294 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1728  hypothetical protein  28.82 
 
 		 717 aa  142  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784062  normal  0.0313644 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  37.27 
 
 		 693 aa  142  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3991  MscS mechanosensitive ion channel  28.82 
 
 		 715 aa  142  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0693455  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5033  MscS mechanosensitive ion channel  25.68 
 
 		 701 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149124 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1790  MscS Mechanosensitive ion channel  30.63 
 
 		 716 aa  140  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.192721 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  37.74 
 
 		 308 aa  139  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3687  MscS mechanosensitive ion channel  26.04 
 
 		 784 aa  139  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276928  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2401  MscS Mechanosensitive ion channel  31.02 
 
 		 718 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0124939 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4477  MscS mechanosensitive ion channel  27.25 
 
 		 772 aa  137  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1627  MscS mechanosensitive ion channel  26.47 
 
 		 881 aa  137  8e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  33.96 
 
 		 344 aa  136  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  31.11 
 
 		 288 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  29.6 
 
 		 505 aa  134  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0676  mechanosensitive ion channel family protein  30.7 
 
 		 767 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5133  MscS Mechanosensitive ion channel  34.62 
 
 		 658 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538778  normal  0.147558 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  30.86 
 
 		 394 aa  132  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0940  MscS Mechanosensitive ion channel  33.82 
 
 		 293 aa  132  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.285938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  30.96 
 
 		 285 aa  132  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 549 aa  132  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  32.93 
 
 		 342 aa  130  8.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5772  MscS mechanosensitive ion channel  37.27 
 
 		 705 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429261  normal  0.122613 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6137  hypothetical protein  34.2 
 
 		 725 aa  127  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.119326  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  29.47 
 
 		 454 aa  127  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  34.84 
 
 		 289 aa  126  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  30.8 
 
 		 325 aa  126  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  31.62 
 
 		 285 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4584  MscS mechanosensitive ion channel  35.91 
 
 		 697 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.99351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  31.51 
 
 		 442 aa  123  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  31.01 
 
 		 293 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  34.58 
 
 		 293 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  34.58 
 
 		 293 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  34.62 
 
 		 337 aa  122  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  33.48 
 
 		 299 aa  122  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  29.09 
 
 		 550 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  30.91 
 
 		 350 aa  122  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  31.62 
 
 		 293 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  31.62 
 
 		 293 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  31.62 
 
 		 293 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  30.66 
 
 		 293 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  31.62 
 
 		 293 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  29.51 
 
 		 356 aa  121  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>