More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1188 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 549 aa  1090    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4456  MscS mechanosensitive ion channel  33.44 
 
 		 550 aa  196  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1631  MscS mechanosensitive ion channel  28.54 
 
 		 414 aa  192  9e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  35.66 
 
 		 285 aa  183  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  37.87 
 
 		 294 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  41.94 
 
 		 370 aa  176  7e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  42.59 
 
 		 299 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  34.1 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  34.1 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  34.1 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  34.1 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  34.1 
 
 		 293 aa  170  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  33.72 
 
 		 293 aa  169  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  33.72 
 
 		 293 aa  169  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  33.46 
 
 		 285 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  37.6 
 
 		 288 aa  166  9e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  37.5 
 
 		 293 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  37.5 
 
 		 293 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  35.08 
 
 		 299 aa  160  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  36 
 
 		 372 aa  160  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  33.08 
 
 		 289 aa  158  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  38.36 
 
 		 336 aa  157  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  36.82 
 
 		 321 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  32.68 
 
 		 283 aa  153  8e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0901  MscS Mechanosensitive ion channel  36.03 
 
 		 766 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  37.22 
 
 		 550 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  39.15 
 
 		 356 aa  151  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  36.04 
 
 		 528 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  36.04 
 
 		 528 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  35.04 
 
 		 325 aa  149  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  31.13 
 
 		 753 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  34.81 
 
 		 350 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0181  MscS mechanosensitive ion channel  33.06 
 
 		 707 aa  146  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2784  MscS mechanosensitive ion channel  30.08 
 
 		 801 aa  145  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  35.32 
 
 		 282 aa  146  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0082  MscS mechanosensitive ion channel  32.62 
 
 		 303 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0423997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  38.66 
 
 		 342 aa  144  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0349  MscS Mechanosensitive ion channel  32.53 
 
 		 759 aa  143  8e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  36.74 
 
 		 718 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  36.6 
 
 		 735 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3072  MscS mechanosensitive ion channel  31.62 
 
 		 773 aa  141  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.718015  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  36.6 
 
 		 735 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3795  MscS mechanosensitive ion channel  38.25 
 
 		 313 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.840492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  37.33 
 
 		 762 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  32.26 
 
 		 787 aa  140  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3068  hypothetical protein  31.43 
 
 		 756 aa  140  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.36924 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  34.43 
 
 		 335 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3104  MscS mechanosensitive ion channel  28.61 
 
 		 790 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1971  MscS Mechanosensitive ion channel  30.63 
 
 		 716 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170847  normal  0.348628 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  35.22 
 
 		 767 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2511  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 282 aa  137  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.399769  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  35.35 
 
 		 719 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  35.4 
 
 		 336 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 278 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  35.05 
 
 		 771 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  34.39 
 
 		 335 aa  135  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  34.33 
 
 		 327 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  34.33 
 
 		 327 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  34.33 
 
 		 327 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  34.35 
 
 		 538 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  35.4 
 
 		 442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  34.07 
 
 		 879 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1895  small-conductance mechanosensitive ion channel  33.8 
 
 		 787 aa  134  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  32.14 
 
 		 792 aa  133  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11550  small-conductance mechanosensitive channel  31.71 
 
 		 316 aa  134  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1790  MscS Mechanosensitive ion channel  30.53 
 
 		 716 aa  134  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.192721 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  33.88 
 
 		 876 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  34.12 
 
 		 337 aa  133  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  31.52 
 
 		 599 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 787 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2401  MscS Mechanosensitive ion channel  33.85 
 
 		 718 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0124939 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1728  hypothetical protein  35.81 
 
 		 717 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784062  normal  0.0313644 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  35.98 
 
 		 342 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1320  MscS mechanosensitive ion channel  35.68 
 
 		 717 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3991  MscS mechanosensitive ion channel  35.81 
 
 		 715 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0693455  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0676  mechanosensitive ion channel family protein  28.37 
 
 		 767 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2998  putative mechanosensitive ion channel  35.93 
 
 		 826 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  34.26 
 
 		 454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  29.84 
 
 		 537 aa  129  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  31.85 
 
 		 308 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  37.07 
 
 		 337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1803  MscS Mechanosensitive ion channel  32.84 
 
 		 595 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  0.895337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4477  MscS mechanosensitive ion channel  28.14 
 
 		 772 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  31.56 
 
 		 568 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1181  hypothetical protein  30.53 
 
 		 884 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.40697 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2744  MscS mechanosensitive ion channel  35.14 
 
 		 315 aa  127  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535922  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0940  MscS Mechanosensitive ion channel  31.88 
 
 		 293 aa  126  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.285938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  30.89 
 
 		 822 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  33.49 
 
 		 344 aa  126  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7342  MscS Mechanosensitive ion channel  31.87 
 
 		 342 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546474 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  30.89 
 
 		 822 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  30.89 
 
 		 822 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2666  MscS Mechanosensitive ion channel  28.32 
 
 		 911 aa  125  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232424  normal  0.397707 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  31.28 
 
 		 821 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1457  MscS mechanosensitive ion channel  30.37 
 
 		 768 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  36.11 
 
 		 273 aa  125  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  29.37 
 
 		 505 aa  124  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5311  MscS mechanosensitive ion channel  32.29 
 
 		 858 aa  124  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021896 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  28.17 
 
 		 773 aa  124  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1398  MscS Mechanosensitive ion channel  32.18 
 
 		 266 aa  124  6e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>