More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3024 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 344 aa  675    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  59.65 
 
 		 350 aa  391  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  43.62 
 
 		 394 aa  226  6e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  42.41 
 
 		 550 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  41.87 
 
 		 528 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  41.87 
 
 		 528 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  42.22 
 
 		 538 aa  187  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  41.1 
 
 		 537 aa  183  4.0000000000000006e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  45.1 
 
 		 335 aa  170  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  41.55 
 
 		 356 aa  169  8e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  40.45 
 
 		 342 aa  169  9e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  42.55 
 
 		 599 aa  168  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  40.55 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  41.12 
 
 		 454 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 289 aa  165  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  39.72 
 
 		 342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  39.27 
 
 		 442 aa  162  8.000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  42.06 
 
 		 337 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  41.98 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4634  MscS Mechanosensitive ion channel  38.53 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0333987  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  39.15 
 
 		 321 aa  159  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  35.92 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  39.62 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1803  MscS Mechanosensitive ion channel  46.11 
 
 		 595 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  0.895337 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  39.62 
 
 		 299 aa  155  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1579  mechanosensitive ion channel family protein  34.72 
 
 		 455 aa  155  7e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.397271  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  40.1 
 
 		 372 aa  155  9e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13451  putative mechanosensitive ion channel, MscS family protein  37.09 
 
 		 656 aa  153  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3795  MscS mechanosensitive ion channel  38.56 
 
 		 313 aa  153  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.840492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  36.32 
 
 		 370 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1324  MscS mechanosensitive ion channel  34.72 
 
 		 458 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00452452  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  37.28 
 
 		 336 aa  152  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  39.61 
 
 		 787 aa  152  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1456  mechanosensitive ion channel protein  34.34 
 
 		 455 aa  152  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000389307  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  36.32 
 
 		 753 aa  152  8.999999999999999e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  37.44 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  37.44 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  37.44 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1398  MscS Mechanosensitive ion channel  42.86 
 
 		 266 aa  151  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  37.88 
 
 		 719 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  35.98 
 
 		 568 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 718 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3911  MscS mechanosensitive ion channel  35.6 
 
 		 367 aa  146  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0349  MscS Mechanosensitive ion channel  34.43 
 
 		 759 aa  146  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  37.16 
 
 		 767 aa  146  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  35.89 
 
 		 283 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7342  MscS Mechanosensitive ion channel  33.95 
 
 		 342 aa  145  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546474 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5186  MscS Mechanosensitive ion channel  41.62 
 
 		 600 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000148025 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0901  MscS Mechanosensitive ion channel  35.38 
 
 		 766 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  36.7 
 
 		 876 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  35.78 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3068  hypothetical protein  36.84 
 
 		 756 aa  143  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.36924 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0186  MscS Mechanosensitive ion channel  40.09 
 
 		 304 aa  142  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  36.49 
 
 		 771 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0181  MscS mechanosensitive ion channel  30.64 
 
 		 707 aa  142  6e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  36.7 
 
 		 879 aa  142  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  35.59 
 
 		 762 aa  142  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1728  hypothetical protein  36.36 
 
 		 717 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784062  normal  0.0313644 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1320  MscS mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 717 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3991  MscS mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 715 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0693455  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3536  MscS mechanosensitive ion channel  35.18 
 
 		 388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  34.72 
 
 		 787 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  36.74 
 
 		 735 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  36.28 
 
 		 735 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1895  small-conductance mechanosensitive ion channel  36.32 
 
 		 787 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3072  MscS mechanosensitive ion channel  30.69 
 
 		 773 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.718015  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  39.5 
 
 		 337 aa  139  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  35.85 
 
 		 273 aa  139  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  37.21 
 
 		 285 aa  139  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  35.38 
 
 		 792 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  32.26 
 
 		 505 aa  139  8.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2744  MscS mechanosensitive ion channel  37.29 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535922  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0190  small-conductance mechanosensitive channel  35.19 
 
 		 263 aa  138  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2401  MscS Mechanosensitive ion channel  34.48 
 
 		 718 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0124939 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1226  MscS Mechanosensitive ion channel  37.1 
 
 		 569 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1197  MscS Mechanosensitive ion channel  37.1 
 
 		 569 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  36.32 
 
 		 285 aa  136  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2432  MscS Mechanosensitive ion channel  38.49 
 
 		 307 aa  136  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00547938  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2784  MscS mechanosensitive ion channel  33.8 
 
 		 801 aa  135  9e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1224  MscS Mechanosensitive ion channel  34.36 
 
 		 838 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  35.38 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  35.38 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0082  MscS mechanosensitive ion channel  34.84 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0423997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1609  MscS mechanosensitive ion channel  35.27 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  35.38 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1634  MscS mechanosensitive ion channel  35.27 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1580  MscS mechanosensitive ion channel  35.27 
 
 		 319 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2666  MscS Mechanosensitive ion channel  33.8 
 
 		 911 aa  134  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232424  normal  0.397707 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  33.18 
 
 		 278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0104  hypothetical protein  35.71 
 
 		 280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0511133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  34.91 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  34.91 
 
 		 293 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  34.91 
 
 		 293 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  34.91 
 
 		 293 aa  133  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  34.91 
 
 		 293 aa  133  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  34.91 
 
 		 293 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2998  putative mechanosensitive ion channel  38.21 
 
 		 826 aa  132  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5033  MscS mechanosensitive ion channel  33.8 
 
 		 701 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149124 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1487  MscS mechanosensitive ion channel  36.46 
 
 		 796 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>