More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0940 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0940  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 293 aa  578  1e-164  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.285938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  52.28 
 
 		 337 aa  248  7e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1363  MscS Mechanosensitive ion channel  51.24 
 
 		 366 aa  225  8e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.207761  hitchhiker  0.0000810048 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  42.07 
 
 		 336 aa  222  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  42.44 
 
 		 454 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  40.83 
 
 		 325 aa  216  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  43.02 
 
 		 356 aa  216  5e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  42.32 
 
 		 342 aa  211  9e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  43.38 
 
 		 442 aa  211  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  38.57 
 
 		 327 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  38.57 
 
 		 327 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  38.91 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2432  MscS Mechanosensitive ion channel  39.73 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00547938  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  44.04 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3795  MscS mechanosensitive ion channel  40.55 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.840492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 335 aa  202  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  38.46 
 
 		 336 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3911  MscS mechanosensitive ion channel  47.15 
 
 		 367 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2744  MscS mechanosensitive ion channel  39.41 
 
 		 315 aa  199  7e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535922  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4634  MscS Mechanosensitive ion channel  39.93 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0333987  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  41.76 
 
 		 337 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3536  MscS mechanosensitive ion channel  45.63 
 
 		 388 aa  191  9e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1824  MscS Mechanosensitive ion channel  38.83 
 
 		 330 aa  179  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000045049  normal  0.0757476 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1100  MscS Mechanosensitive ion channel  38.05 
 
 		 341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0753115  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11550  small-conductance mechanosensitive channel  34.75 
 
 		 316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  35.71 
 
 		 308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2634  MscS Mechanosensitive ion channel  36.58 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.218755 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2413  MscS mechanosensitive ion channel  47.83 
 
 		 221 aa  153  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0138474  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  38.21 
 
 		 288 aa  152  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  31.67 
 
 		 550 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  32.12 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 528 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 528 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2167  MscS Mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 228 aa  145  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000258413 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  36.32 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0181  MscS mechanosensitive ion channel  38.35 
 
 		 707 aa  144  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  34.39 
 
 		 792 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1181  hypothetical protein  36.74 
 
 		 884 aa  142  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.40697 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7342  MscS Mechanosensitive ion channel  37.2 
 
 		 342 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546474 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  35.35 
 
 		 821 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  34.26 
 
 		 505 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1457  MscS mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 		 768 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1579  mechanosensitive ion channel family protein  35.61 
 
 		 455 aa  140  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.397271  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  32.2 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4680  MscS mechanosensitive ion channel  34.88 
 
 		 837 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3278  MscS mechanosensitive ion channel  35.81 
 
 		 864 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5420  MscS Mechanosensitive ion channel  36.28 
 
 		 889 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3797  MscS mechanosensitive ion channel  35.81 
 
 		 871 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198076  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1971  MscS Mechanosensitive ion channel  31.52 
 
 		 716 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170847  normal  0.348628 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  34.88 
 
 		 822 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  34.88 
 
 		 822 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  34.88 
 
 		 822 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1456  mechanosensitive ion channel protein  38.18 
 
 		 455 aa  138  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000389307  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  35.05 
 
 		 753 aa  137  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  32.58 
 
 		 278 aa  138  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0349  MscS Mechanosensitive ion channel  36.27 
 
 		 759 aa  138  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1895  small-conductance mechanosensitive ion channel  34.39 
 
 		 787 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  31.52 
 
 		 537 aa  137  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1324  MscS mechanosensitive ion channel  35.71 
 
 		 458 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00452452  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3072  MscS mechanosensitive ion channel  36.97 
 
 		 773 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.718015  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5311  MscS mechanosensitive ion channel  33.09 
 
 		 858 aa  136  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021896 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  33.94 
 
 		 787 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  33.1 
 
 		 538 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0082  MscS mechanosensitive ion channel  35.02 
 
 		 303 aa  135  7.000000000000001e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0423997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  38.01 
 
 		 335 aa  135  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09010  small-conductance mechanosensitive channel  39.2 
 
 		 298 aa  135  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0427247  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  35.48 
 
 		 787 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  33.49 
 
 		 718 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  32.76 
 
 		 719 aa  132  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  35.55 
 
 		 344 aa  133  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1514  MscS mechanosensitive ion channel  34.93 
 
 		 836 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.767095  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1790  MscS Mechanosensitive ion channel  30.8 
 
 		 716 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.192721 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  35.75 
 
 		 350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  27.46 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2784  MscS mechanosensitive ion channel  33.66 
 
 		 801 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  33.64 
 
 		 735 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  35.87 
 
 		 568 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  34.25 
 
 		 879 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  33.64 
 
 		 735 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1728  hypothetical protein  33.49 
 
 		 717 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784062  normal  0.0313644 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1295  hypothetical protein  33.46 
 
 		 737 aa  129  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.159266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1320  MscS mechanosensitive ion channel  33.02 
 
 		 717 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3991  MscS mechanosensitive ion channel  33.49 
 
 		 715 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0693455  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  31.88 
 
 		 549 aa  128  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2511  MscS mechanosensitive ion channel  37.86 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.399769  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  33.02 
 
 		 693 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  29.06 
 
 		 283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2062  MscS mechanosensitive ion channel  36.15 
 
 		 747 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00775  predicted mechanosensitive channel  33.82 
 
 		 741 aa  126  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2834  MscS Mechanosensitive ion channel  33.82 
 
 		 741 aa  126  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.269757  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2835  hypothetical protein  33.82 
 
 		 741 aa  126  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.49236  normal  0.59414 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00792  hypothetical protein  33.82 
 
 		 741 aa  126  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0831  hypothetical protein  33.82 
 
 		 741 aa  125  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0229209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0956  hypothetical protein  33.82 
 
 		 741 aa  125  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0640759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5186  MscS Mechanosensitive ion channel  26.74 
 
 		 600 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000148025 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  30.82 
 
 		 599 aa  125  8.000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  35.41 
 
 		 370 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  32.86 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  33.78 
 
 		 767 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0876  hypothetical protein  33.46 
 
 		 741 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000367014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>