More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1803 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1803  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 595 aa  1172    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  0.895337 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  37.29 
 
 		 599 aa  332  9e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0540  MscS Mechanosensitive ion channel  34.05 
 
 		 582 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5186  MscS Mechanosensitive ion channel  32.35 
 
 		 600 aa  279  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000148025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  33.56 
 
 		 538 aa  258  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  32.17 
 
 		 550 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  30.09 
 
 		 537 aa  224  4e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  31.76 
 
 		 528 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  31.76 
 
 		 528 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2274  MscS mechanosensitive ion channel  26.31 
 
 		 586 aa  192  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13451  putative mechanosensitive ion channel, MscS family protein  27.97 
 
 		 656 aa  187  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  44.14 
 
 		 350 aa  185  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1226  MscS Mechanosensitive ion channel  27.34 
 
 		 569 aa  177  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1197  MscS Mechanosensitive ion channel  27.16 
 
 		 569 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  33.86 
 
 		 394 aa  169  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  41.43 
 
 		 344 aa  162  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  31.07 
 
 		 356 aa  157  7e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 294 aa  154  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  34.21 
 
 		 289 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  35.95 
 
 		 321 aa  152  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  33.09 
 
 		 299 aa  150  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  33.18 
 
 		 442 aa  146  8.000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3911  MscS mechanosensitive ion channel  33.87 
 
 		 367 aa  146  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  31.82 
 
 		 283 aa  145  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  32.88 
 
 		 505 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  30.28 
 
 		 335 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  36.52 
 
 		 285 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  36.24 
 
 		 370 aa  144  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  35.65 
 
 		 299 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  32.29 
 
 		 454 aa  144  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  35.22 
 
 		 293 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  35.22 
 
 		 293 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  35.22 
 
 		 293 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  35.22 
 
 		 293 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  35.02 
 
 		 342 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  35.22 
 
 		 293 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  35.22 
 
 		 293 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3536  MscS mechanosensitive ion channel  34.7 
 
 		 388 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  31.62 
 
 		 568 aa  141  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  31.17 
 
 		 288 aa  141  3.9999999999999997e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  34.29 
 
 		 372 aa  141  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  33.21 
 
 		 337 aa  141  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  34.35 
 
 		 293 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  31.46 
 
 		 787 aa  139  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  28.52 
 
 		 308 aa  139  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  34.35 
 
 		 293 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  34.35 
 
 		 293 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1487  MscS mechanosensitive ion channel  38.07 
 
 		 796 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3278  MscS mechanosensitive ion channel  28.62 
 
 		 864 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  28.68 
 
 		 342 aa  136  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4634  MscS Mechanosensitive ion channel  33.03 
 
 		 334 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0333987  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  32.56 
 
 		 336 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  32.84 
 
 		 549 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3797  MscS mechanosensitive ion channel  28.52 
 
 		 871 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198076  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2401  MscS Mechanosensitive ion channel  29.95 
 
 		 718 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0124939 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  31.42 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  33.91 
 
 		 285 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  34.11 
 
 		 771 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  31.06 
 
 		 762 aa  131  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3072  MscS mechanosensitive ion channel  30.61 
 
 		 773 aa  131  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.718015  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  29.87 
 
 		 753 aa  131  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  32.08 
 
 		 325 aa  130  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  29.3 
 
 		 821 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4680  MscS mechanosensitive ion channel  31.7 
 
 		 837 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1398  MscS Mechanosensitive ion channel  38.37 
 
 		 266 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3795  MscS mechanosensitive ion channel  35.68 
 
 		 313 aa  130  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.840492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  27.92 
 
 		 822 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  27.92 
 
 		 822 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  27.92 
 
 		 822 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  28.63 
 
 		 693 aa  128  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0349  MscS Mechanosensitive ion channel  33.66 
 
 		 759 aa  127  7e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7342  MscS Mechanosensitive ion channel  29.75 
 
 		 342 aa  127  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546474 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1456  mechanosensitive ion channel protein  30 
 
 		 455 aa  126  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000389307  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11550  small-conductance mechanosensitive channel  29 
 
 		 316 aa  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1579  mechanosensitive ion channel family protein  29.41 
 
 		 455 aa  125  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.397271  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  28.93 
 
 		 335 aa  125  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  27.56 
 
 		 876 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  27.24 
 
 		 767 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  30.4 
 
 		 792 aa  124  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  28.01 
 
 		 879 aa  123  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  30.49 
 
 		 787 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1324  MscS mechanosensitive ion channel  30.41 
 
 		 458 aa  123  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00452452  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0186  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 304 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1895  small-conductance mechanosensitive ion channel  30.08 
 
 		 787 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  30.92 
 
 		 273 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1181  hypothetical protein  26.69 
 
 		 884 aa  120  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.40697 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2666  MscS Mechanosensitive ion channel  27.08 
 
 		 911 aa  120  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232424  normal  0.397707 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  32.23 
 
 		 327 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  32.23 
 
 		 327 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  32.23 
 
 		 327 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0676  mechanosensitive ion channel family protein  30.8 
 
 		 767 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  28.22 
 
 		 735 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  29 
 
 		 337 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1912  MscS mechanosensitive ion channel  27.4 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.476783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0901  MscS Mechanosensitive ion channel  33.84 
 
 		 766 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5311  MscS mechanosensitive ion channel  29.65 
 
 		 858 aa  118  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021896 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1514  MscS mechanosensitive ion channel  26.64 
 
 		 836 aa  118  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.767095  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2784  MscS mechanosensitive ion channel  31.22 
 
 		 801 aa  118  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  30.7 
 
 		 718 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4477  MscS mechanosensitive ion channel  32.86 
 
 		 772 aa  117  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>