More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2274 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2274  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 586 aa  1163    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5186  MscS Mechanosensitive ion channel  30.6 
 
 		 600 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000148025 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0540  MscS Mechanosensitive ion channel  30.33 
 
 		 582 aa  233  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  31.57 
 
 		 550 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  31.18 
 
 		 537 aa  226  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  32.94 
 
 		 528 aa  217  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  32.94 
 
 		 528 aa  217  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  29.67 
 
 		 538 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1197  MscS Mechanosensitive ion channel  30.11 
 
 		 569 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1226  MscS Mechanosensitive ion channel  30.39 
 
 		 569 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1803  MscS Mechanosensitive ion channel  26.41 
 
 		 595 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  0.895337 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  26.64 
 
 		 599 aa  167  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13451  putative mechanosensitive ion channel, MscS family protein  31.29 
 
 		 656 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  28.31 
 
 		 350 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  31.31 
 
 		 356 aa  139  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 344 aa  136  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  30.91 
 
 		 442 aa  135  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  32.52 
 
 		 308 aa  135  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  29.55 
 
 		 454 aa  131  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  29.68 
 
 		 337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  32.09 
 
 		 342 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  33.49 
 
 		 289 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  29.88 
 
 		 283 aa  127  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  28.52 
 
 		 288 aa  126  9e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  28.5 
 
 		 336 aa  124  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  31.55 
 
 		 787 aa  123  8e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  31.76 
 
 		 568 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  29.52 
 
 		 394 aa  122  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  30.52 
 
 		 336 aa  122  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  30.22 
 
 		 505 aa  121  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  28.7 
 
 		 335 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  29.05 
 
 		 767 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3068  hypothetical protein  25.17 
 
 		 756 aa  120  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.36924 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  26.09 
 
 		 876 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  29.11 
 
 		 342 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  28.42 
 
 		 771 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  31.31 
 
 		 718 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  29.89 
 
 		 278 aa  118  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  29.65 
 
 		 879 aa  117  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3072  MscS mechanosensitive ion channel  34.07 
 
 		 773 aa  117  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.718015  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  27.11 
 
 		 325 aa  117  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1579  mechanosensitive ion channel family protein  26.77 
 
 		 455 aa  117  6e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.397271  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11550  small-conductance mechanosensitive channel  23.64 
 
 		 316 aa  117  6.9999999999999995e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1456  mechanosensitive ion channel protein  27.09 
 
 		 455 aa  116  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000389307  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  29.02 
 
 		 762 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  29.8 
 
 		 719 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3687  MscS mechanosensitive ion channel  32.72 
 
 		 784 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276928  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1324  MscS mechanosensitive ion channel  29.44 
 
 		 458 aa  115  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00452452  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  28.05 
 
 		 294 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7342  MscS Mechanosensitive ion channel  30.3 
 
 		 342 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546474 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  30.33 
 
 		 299 aa  113  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  27.46 
 
 		 337 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6137  hypothetical protein  26.91 
 
 		 725 aa  113  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.119326  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1728  hypothetical protein  30.94 
 
 		 717 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784062  normal  0.0313644 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1320  MscS mechanosensitive ion channel  31.49 
 
 		 717 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4634  MscS Mechanosensitive ion channel  28.64 
 
 		 334 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0333987  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  26.64 
 
 		 327 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3991  MscS mechanosensitive ion channel  30.94 
 
 		 715 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0693455  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  26.64 
 
 		 327 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  26.64 
 
 		 327 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1971  MscS Mechanosensitive ion channel  28.39 
 
 		 716 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170847  normal  0.348628 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  27.48 
 
 		 321 aa  110  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  24.43 
 
 		 773 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  28.91 
 
 		 273 aa  109  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3795  MscS mechanosensitive ion channel  26.61 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.840492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  24.62 
 
 		 293 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  27.96 
 
 		 370 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  29.67 
 
 		 283 aa  108  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  24.62 
 
 		 293 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  24.62 
 
 		 293 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  24.62 
 
 		 293 aa  107  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  24.62 
 
 		 293 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  24.62 
 
 		 293 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  26.76 
 
 		 735 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1790  MscS Mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 716 aa  107  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.192721 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  26.76 
 
 		 735 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1514  MscS mechanosensitive ion channel  28.87 
 
 		 836 aa  107  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.767095  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2062  MscS mechanosensitive ion channel  26.48 
 
 		 747 aa  107  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  24.62 
 
 		 293 aa  107  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  27.01 
 
 		 821 aa  106  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 		 299 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  25.88 
 
 		 372 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3348  MscS Mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 757 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.703913 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3001  MscS Mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 755 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.996341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4680  MscS mechanosensitive ion channel  26.07 
 
 		 837 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1627  MscS mechanosensitive ion channel  29.83 
 
 		 881 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2401  MscS Mechanosensitive ion channel  24.61 
 
 		 718 aa  105  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0124939 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  24.71 
 
 		 285 aa  105  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0186  MscS Mechanosensitive ion channel  32.29 
 
 		 304 aa  105  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  27.93 
 
 		 309 aa  104  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2511  MscS mechanosensitive ion channel  27.57 
 
 		 282 aa  104  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.399769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  24.62 
 
 		 293 aa  104  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  26.07 
 
 		 822 aa  104  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  26.07 
 
 		 822 aa  104  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3278  MscS mechanosensitive ion channel  26.54 
 
 		 864 aa  104  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  26.07 
 
 		 822 aa  104  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3797  MscS mechanosensitive ion channel  26.54 
 
 		 871 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198076  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  27.89 
 
 		 693 aa  103  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  24.33 
 
 		 285 aa  103  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4049  MscS Mechanosensitive ion channel  29.12 
 
 		 650 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>