More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_13451 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_13451  putative mechanosensitive ion channel, MscS family protein  100 
 
 		 656 aa  1332    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  37.27 
 
 		 550 aa  206  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  37.84 
 
 		 537 aa  204  4e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  37.81 
 
 		 538 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  42.34 
 
 		 528 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  42.34 
 
 		 528 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0540  MscS Mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 582 aa  198  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  37.65 
 
 		 599 aa  190  9e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1803  MscS Mechanosensitive ion channel  28.42 
 
 		 595 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  0.895337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5186  MscS Mechanosensitive ion channel  27.04 
 
 		 600 aa  177  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000148025 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  36.44 
 
 		 350 aa  163  9e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2274  MscS mechanosensitive ion channel  31.08 
 
 		 586 aa  155  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  37.09 
 
 		 344 aa  153  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  33.46 
 
 		 394 aa  152  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  31.97 
 
 		 356 aa  140  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  35 
 
 		 442 aa  130  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  31.42 
 
 		 336 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  31.94 
 
 		 454 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  29.07 
 
 		 762 aa  128  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  31.82 
 
 		 335 aa  128  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  29 
 
 		 771 aa  128  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1226  MscS Mechanosensitive ion channel  32.77 
 
 		 569 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  29.91 
 
 		 299 aa  127  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  31.16 
 
 		 289 aa  127  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1197  MscS Mechanosensitive ion channel  32.77 
 
 		 569 aa  127  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  32.67 
 
 		 568 aa  127  7e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  33.7 
 
 		 283 aa  127  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  34.43 
 
 		 505 aa  127  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1456  mechanosensitive ion channel protein  32.58 
 
 		 455 aa  125  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000389307  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  34.47 
 
 		 342 aa  125  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1579  mechanosensitive ion channel family protein  32.13 
 
 		 455 aa  124  5e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.397271  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3068  hypothetical protein  29.86 
 
 		 756 aa  124  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.36924 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1324  MscS mechanosensitive ion channel  32.13 
 
 		 458 aa  123  8e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00452452  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  30.37 
 
 		 342 aa  123  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  28.83 
 
 		 787 aa  123  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  31.46 
 
 		 278 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1398  MscS Mechanosensitive ion channel  32.87 
 
 		 266 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3455  MscS Mechanosensitive ion channel  37.36 
 
 		 320 aa  121  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3072  MscS mechanosensitive ion channel  34.59 
 
 		 773 aa  120  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.718015  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  31.78 
 
 		 321 aa  120  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  30.95 
 
 		 308 aa  118  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  29.91 
 
 		 299 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  30.41 
 
 		 325 aa  117  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  26.4 
 
 		 718 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  29.91 
 
 		 294 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  29.07 
 
 		 879 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1912  MscS mechanosensitive ion channel  34.81 
 
 		 325 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.476783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  27.06 
 
 		 719 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1895  small-conductance mechanosensitive ion channel  28.63 
 
 		 787 aa  115  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  27.99 
 
 		 787 aa  115  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0128  MscS mechanosensitive ion channel  28.19 
 
 		 275 aa  114  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0186  MscS Mechanosensitive ion channel  33.78 
 
 		 304 aa  114  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  29.86 
 
 		 337 aa  113  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  27.6 
 
 		 767 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  27.15 
 
 		 876 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3348  MscS Mechanosensitive ion channel  28.35 
 
 		 757 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.703913 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3001  MscS Mechanosensitive ion channel  29.88 
 
 		 755 aa  111  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.996341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  29.72 
 
 		 336 aa  110  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  27.61 
 
 		 792 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  27.38 
 
 		 273 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1728  hypothetical protein  26.4 
 
 		 717 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784062  normal  0.0313644 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3991  MscS mechanosensitive ion channel  26.4 
 
 		 715 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0693455  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  30.28 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  30.28 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  30.28 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4901  MscS Mechanosensitive ion channel  32.26 
 
 		 301 aa  109  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1320  MscS mechanosensitive ion channel  26.4 
 
 		 717 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2511  MscS mechanosensitive ion channel  28.14 
 
 		 282 aa  108  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.399769  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  28.37 
 
 		 337 aa  108  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1580  MscS mechanosensitive ion channel  32.04 
 
 		 319 aa  107  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1634  MscS mechanosensitive ion channel  32.04 
 
 		 319 aa  107  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1609  MscS mechanosensitive ion channel  32.04 
 
 		 319 aa  107  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7342  MscS Mechanosensitive ion channel  32.02 
 
 		 342 aa  107  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546474 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11550  small-conductance mechanosensitive channel  33.93 
 
 		 316 aa  106  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13121  transmembrane protein  31.82 
 
 		 308 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.609452 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  27.57 
 
 		 288 aa  105  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  26.38 
 
 		 335 aa  104  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2401  MscS Mechanosensitive ion channel  26.63 
 
 		 718 aa  104  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0124939 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2666  MscS Mechanosensitive ion channel  26.95 
 
 		 911 aa  104  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232424  normal  0.397707 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0349  MscS Mechanosensitive ion channel  26.36 
 
 		 759 aa  104  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3911  MscS mechanosensitive ion channel  26.2 
 
 		 367 aa  103  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0940  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 293 aa  103  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.285938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  29.11 
 
 		 735 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  31.32 
 
 		 309 aa  102  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  28.57 
 
 		 735 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 285 aa  102  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  27.68 
 
 		 293 aa  102  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  27.23 
 
 		 293 aa  101  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  27.68 
 
 		 293 aa  101  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  27.68 
 
 		 293 aa  101  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  27.68 
 
 		 293 aa  101  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1631  MscS mechanosensitive ion channel  27.67 
 
 		 414 aa  101  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  27.68 
 
 		 293 aa  101  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0901  MscS Mechanosensitive ion channel  25.74 
 
 		 766 aa  101  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4450  MscS mechanosensitive ion channel  31.32 
 
 		 334 aa  101  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  27.68 
 
 		 293 aa  101  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3536  MscS mechanosensitive ion channel  28.1 
 
 		 388 aa  101  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4680  MscS mechanosensitive ion channel  25.6 
 
 		 837 aa  100  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1487  MscS mechanosensitive ion channel  31.64 
 
 		 796 aa  100  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  27.23 
 
 		 293 aa  100  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>