More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1197 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1197  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 
569 aa  1159    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1226  MscS Mechanosensitive ion channel  99.65 
 
 
569 aa  1155    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  33.59 
 
 
537 aa  237  4e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  31.91 
 
 
550 aa  237  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  33.27 
 
 
538 aa  219  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2274  MscS mechanosensitive ion channel  30.11 
 
 
586 aa  211  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5186  MscS Mechanosensitive ion channel  30.35 
 
 
600 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000148025 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  29.5 
 
 
528 aa  200  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  29.5 
 
 
528 aa  200  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0540  MscS Mechanosensitive ion channel  29.94 
 
 
582 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1803  MscS Mechanosensitive ion channel  28.29 
 
 
595 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  0.895337 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  30.3 
 
 
599 aa  179  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  35.91 
 
 
394 aa  147  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  39.62 
 
 
350 aa  147  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  36.99 
 
 
442 aa  144  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  39.39 
 
 
568 aa  139  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  32.44 
 
 
693 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  34.84 
 
 
335 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  37.1 
 
 
344 aa  137  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  34.25 
 
 
454 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  37.84 
 
 
356 aa  136  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  36.71 
 
 
787 aa  136  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  32.2 
 
 
337 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  35.91 
 
 
879 aa  134  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  33.95 
 
 
762 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  30.46 
 
 
719 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  31.66 
 
 
288 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  31.23 
 
 
321 aa  130  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  35 
 
 
767 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  33.64 
 
 
771 aa  130  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7342  MscS Mechanosensitive ion channel  34.53 
 
 
342 aa  130  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546474 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  34.56 
 
 
718 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  28.75 
 
 
822 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  34.55 
 
 
876 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  28.75 
 
 
822 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  28.75 
 
 
822 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13451  putative mechanosensitive ion channel, MscS family protein  31.52 
 
 
656 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  32.88 
 
 
342 aa  128  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5772  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 
705 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429261  normal  0.122613 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  31.44 
 
 
505 aa  127  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  33.8 
 
 
735 aa  127  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  33.8 
 
 
735 aa  127  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  29.36 
 
 
821 aa  126  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2062  MscS mechanosensitive ion channel  35.02 
 
 
747 aa  126  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11550  small-conductance mechanosensitive channel  31.92 
 
 
316 aa  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3871  MscS mechanosensitive ion channel  33.02 
 
 
674 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  25.06 
 
 
773 aa  124  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  32.25 
 
 
342 aa  125  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  35.55 
 
 
336 aa  124  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  33.07 
 
 
283 aa  124  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4584  MscS mechanosensitive ion channel  32.13 
 
 
697 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.99351  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1514  MscS mechanosensitive ion channel  30.8 
 
 
836 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.767095  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  32.3 
 
 
325 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  32.1 
 
 
336 aa  123  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4634  MscS Mechanosensitive ion channel  36.32 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0333987  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5133  MscS Mechanosensitive ion channel  31.44 
 
 
658 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538778  normal  0.147558 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4477  MscS mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 
772 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3278  MscS mechanosensitive ion channel  30.99 
 
 
864 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3797  MscS mechanosensitive ion channel  30.99 
 
 
871 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198076  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4680  MscS mechanosensitive ion channel  29.88 
 
 
837 aa  121  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  33.18 
 
 
308 aa  121  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5420  MscS Mechanosensitive ion channel  32.16 
 
 
889 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1627  MscS mechanosensitive ion channel  36.6 
 
 
881 aa  121  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3072  MscS mechanosensitive ion channel  34.09 
 
 
773 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.718015  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4049  MscS Mechanosensitive ion channel  32.56 
 
 
650 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5033  MscS mechanosensitive ion channel  31.63 
 
 
701 aa  120  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.149124 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1181  hypothetical protein  32.16 
 
 
884 aa  120  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.40697 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1320  MscS mechanosensitive ion channel  35.02 
 
 
717 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1728  hypothetical protein  35.02 
 
 
717 aa  120  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784062  normal  0.0313644 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  30.89 
 
 
327 aa  120  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  30.89 
 
 
327 aa  120  9e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  30.89 
 
 
327 aa  120  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0940  MscS Mechanosensitive ion channel  29.45 
 
 
293 aa  119  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.285938  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0676  mechanosensitive ion channel family protein  28.33 
 
 
767 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3991  MscS mechanosensitive ion channel  35.02 
 
 
715 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0693455  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1971  MscS Mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 
716 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170847  normal  0.348628 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1224  MscS Mechanosensitive ion channel  35.15 
 
 
838 aa  119  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  32.27 
 
 
753 aa  117  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2401  MscS Mechanosensitive ion channel  28.37 
 
 
718 aa  117  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0124939 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5311  MscS mechanosensitive ion channel  30.52 
 
 
858 aa  117  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021896 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  30 
 
 
337 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1790  MscS Mechanosensitive ion channel  29.13 
 
 
716 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.192721 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3068  hypothetical protein  31.37 
 
 
756 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.36924 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  34.54 
 
 
372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3911  MscS mechanosensitive ion channel  30.69 
 
 
367 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1579  mechanosensitive ion channel family protein  31.13 
 
 
455 aa  114  5e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.397271  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0181  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 
707 aa  114  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2511  MscS mechanosensitive ion channel  27.55 
 
 
282 aa  113  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.399769  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3536  MscS mechanosensitive ion channel  29.25 
 
 
388 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1324  MscS mechanosensitive ion channel  30.66 
 
 
458 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00452452  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6137  hypothetical protein  28.57 
 
 
725 aa  112  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.119326  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0082  MscS mechanosensitive ion channel  33.48 
 
 
303 aa  112  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0423997  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  30.2 
 
 
273 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  35.07 
 
 
289 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2666  MscS Mechanosensitive ion channel  27.6 
 
 
911 aa  111  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232424  normal  0.397707 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1456  mechanosensitive ion channel protein  30.19 
 
 
455 aa  111  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000389307  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0186  MscS Mechanosensitive ion channel  32.88 
 
 
304 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  32.13 
 
 
549 aa  110  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0901  MscS Mechanosensitive ion channel  30 
 
 
766 aa  110  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1824  MscS Mechanosensitive ion channel  31.16 
 
 
330 aa  110  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000045049  normal  0.0757476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>