More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1398 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1398  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 266 aa  536  1e-151  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  39.58 
 
 		 372 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  38.58 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  34.07 
 
 		 299 aa  156  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  34.65 
 
 		 321 aa  152  5e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  41.1 
 
 		 350 aa  151  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  42.86 
 
 		 344 aa  150  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  35.81 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  36.61 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  34.96 
 
 		 753 aa  148  9e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  39.05 
 
 		 537 aa  148  9e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 550 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  33.2 
 
 		 528 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  33.2 
 
 		 528 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  36.67 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  35.44 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1895  small-conductance mechanosensitive ion channel  36.09 
 
 		 787 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  34.2 
 
 		 505 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  36.09 
 
 		 787 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2511  MscS mechanosensitive ion channel  33.47 
 
 		 282 aa  143  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.399769  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  35.42 
 
 		 370 aa  142  8e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2998  putative mechanosensitive ion channel  39.82 
 
 		 826 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0349  MscS Mechanosensitive ion channel  36.71 
 
 		 759 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  37.81 
 
 		 538 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  33.58 
 
 		 599 aa  139  3.9999999999999997e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1457  MscS mechanosensitive ion channel  35.94 
 
 		 768 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  31.72 
 
 		 568 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  36.95 
 
 		 792 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  33.88 
 
 		 356 aa  136  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  36.98 
 
 		 335 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5186  MscS Mechanosensitive ion channel  32.8 
 
 		 600 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000148025 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  37.06 
 
 		 394 aa  136  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  34.01 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2784  MscS mechanosensitive ion channel  30.22 
 
 		 801 aa  132  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  32.56 
 
 		 342 aa  131  9e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2401  MscS Mechanosensitive ion channel  34.54 
 
 		 718 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0124939 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0181  MscS mechanosensitive ion channel  32.85 
 
 		 707 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3072  MscS mechanosensitive ion channel  35.32 
 
 		 773 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.718015  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  30.49 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  32.1 
 
 		 693 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1803  MscS Mechanosensitive ion channel  38.37 
 
 		 595 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  0.895337 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5772  MscS mechanosensitive ion channel  33.17 
 
 		 705 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429261  normal  0.122613 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  32.89 
 
 		 335 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  33.06 
 
 		 308 aa  128  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  33.85 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4584  MscS mechanosensitive ion channel  33.01 
 
 		 697 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.99351  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3068  hypothetical protein  35.82 
 
 		 756 aa  126  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.36924 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  34.95 
 
 		 787 aa  125  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1971  MscS Mechanosensitive ion channel  33.5 
 
 		 716 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170847  normal  0.348628 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  34.16 
 
 		 285 aa  125  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0901  MscS Mechanosensitive ion channel  30.7 
 
 		 766 aa  125  7e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  37.37 
 
 		 879 aa  125  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  32.18 
 
 		 549 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2062  MscS mechanosensitive ion channel  36.18 
 
 		 747 aa  124  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3687  MscS mechanosensitive ion channel  31.34 
 
 		 784 aa  123  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276928  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1790  MscS Mechanosensitive ion channel  32.99 
 
 		 716 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.192721 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13451  putative mechanosensitive ion channel, MscS family protein  32.87 
 
 		 656 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3104  MscS mechanosensitive ion channel  35.78 
 
 		 790 aa  122  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  32.92 
 
 		 285 aa  122  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  33.51 
 
 		 342 aa  122  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  33.47 
 
 		 876 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  36.36 
 
 		 767 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1912  MscS mechanosensitive ion channel  32.68 
 
 		 325 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.476783  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1728  hypothetical protein  33.16 
 
 		 717 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784062  normal  0.0313644 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3991  MscS mechanosensitive ion channel  33.16 
 
 		 715 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0693455  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  34.8 
 
 		 336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  33.16 
 
 		 718 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1320  MscS mechanosensitive ion channel  33.16 
 
 		 717 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  32.56 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4049  MscS Mechanosensitive ion channel  32.49 
 
 		 650 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  32.63 
 
 		 337 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0082  MscS mechanosensitive ion channel  32.13 
 
 		 303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0423997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0186  MscS Mechanosensitive ion channel  33.05 
 
 		 304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  32.1 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  32.52 
 
 		 735 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11550  small-conductance mechanosensitive channel  31.56 
 
 		 316 aa  118  7.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  33.16 
 
 		 821 aa  118  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  32.04 
 
 		 735 aa  118  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  31.69 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  31.69 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  31.69 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  31.69 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  31.06 
 
 		 719 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  31.69 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  31.84 
 
 		 442 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  31.69 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  32 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  32 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0940  MscS Mechanosensitive ion channel  33.16 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.285938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  33.33 
 
 		 336 aa  116  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  33.67 
 
 		 822 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  33.67 
 
 		 822 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  30.38 
 
 		 327 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  33.67 
 
 		 822 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1456  mechanosensitive ion channel protein  31.98 
 
 		 455 aa  115  5e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000389307  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1324  MscS mechanosensitive ion channel  31.98 
 
 		 458 aa  115  6e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00452452  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1181  hypothetical protein  32.18 
 
 		 884 aa  115  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.40697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  30.38 
 
 		 327 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  30.38 
 
 		 327 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1579  mechanosensitive ion channel family protein  31.18 
 
 		 455 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.397271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>