More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4049 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4049  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 650 aa  1281    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5133  MscS Mechanosensitive ion channel  57.36 
 
 		 658 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538778  normal  0.147558 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  44.99 
 
 		 693 aa  445  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4584  MscS mechanosensitive ion channel  43.16 
 
 		 697 aa  441  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.99351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3523  MscS Mechanosensitive ion channel  39.58 
 
 		 703 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0609886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5772  MscS mechanosensitive ion channel  42.84 
 
 		 705 aa  395  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429261  normal  0.122613 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3228  MscS Mechanosensitive ion channel  40.47 
 
 		 704 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2401  MscS Mechanosensitive ion channel  38.24 
 
 		 718 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0124939 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1971  MscS Mechanosensitive ion channel  34.87 
 
 		 716 aa  349  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170847  normal  0.348628 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1790  MscS Mechanosensitive ion channel  37.19 
 
 		 716 aa  346  8e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.192721 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3687  MscS mechanosensitive ion channel  40.32 
 
 		 784 aa  231  3e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276928  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6137  hypothetical protein  44.58 
 
 		 725 aa  218  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.119326  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  39.87 
 
 		 773 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2973  MscS Mechanosensitive ion channel  42.25 
 
 		 652 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1627  MscS mechanosensitive ion channel  39.64 
 
 		 881 aa  189  9e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  33.02 
 
 		 787 aa  177  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  37.99 
 
 		 762 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  38.75 
 
 		 771 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2784  MscS mechanosensitive ion channel  38.41 
 
 		 801 aa  171  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  34.42 
 
 		 822 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  34.42 
 
 		 822 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  34.42 
 
 		 822 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3871  MscS mechanosensitive ion channel  36.72 
 
 		 674 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4477  MscS mechanosensitive ion channel  34 
 
 		 772 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  36.84 
 
 		 719 aa  165  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5311  MscS mechanosensitive ion channel  35.23 
 
 		 858 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021896 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0901  MscS Mechanosensitive ion channel  35.11 
 
 		 766 aa  164  6e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  35.12 
 
 		 876 aa  163  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  31.21 
 
 		 505 aa  163  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5033  MscS mechanosensitive ion channel  35.92 
 
 		 701 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149124 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1457  MscS mechanosensitive ion channel  31.36 
 
 		 768 aa  162  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0676  mechanosensitive ion channel family protein  30.55 
 
 		 767 aa  162  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  35.71 
 
 		 767 aa  162  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  34.9 
 
 		 735 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3797  MscS mechanosensitive ion channel  35.77 
 
 		 871 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198076  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3278  MscS mechanosensitive ion channel  35.77 
 
 		 864 aa  160  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  33.98 
 
 		 718 aa  160  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1181  hypothetical protein  37.2 
 
 		 884 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.40697 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0349  MscS Mechanosensitive ion channel  35.17 
 
 		 759 aa  160  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  36.74 
 
 		 735 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  29.21 
 
 		 821 aa  158  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  32.84 
 
 		 879 aa  158  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3072  MscS mechanosensitive ion channel  38.86 
 
 		 773 aa  158  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.718015  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3991  MscS mechanosensitive ion channel  33.21 
 
 		 715 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0693455  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5420  MscS Mechanosensitive ion channel  36.8 
 
 		 889 aa  156  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1320  MscS mechanosensitive ion channel  33.71 
 
 		 717 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  32.06 
 
 		 753 aa  156  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1728  hypothetical protein  33.46 
 
 		 717 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784062  normal  0.0313644 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  35.04 
 
 		 321 aa  155  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0181  MscS mechanosensitive ion channel  34.67 
 
 		 707 aa  154  4e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2062  MscS mechanosensitive ion channel  36 
 
 		 747 aa  154  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3104  MscS mechanosensitive ion channel  36.9 
 
 		 790 aa  153  8e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1224  MscS Mechanosensitive ion channel  27.16 
 
 		 838 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3068  hypothetical protein  34.15 
 
 		 756 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.36924 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  30.82 
 
 		 550 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2666  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 911 aa  145  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232424  normal  0.397707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  32.7 
 
 		 308 aa  144  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1514  MscS mechanosensitive ion channel  35.45 
 
 		 836 aa  144  8e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.767095  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2998  putative mechanosensitive ion channel  32.78 
 
 		 826 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1895  small-conductance mechanosensitive ion channel  31.82 
 
 		 787 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  30.6 
 
 		 792 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  31.82 
 
 		 787 aa  142  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  33.95 
 
 		 528 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  33.95 
 
 		 528 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  32.5 
 
 		 342 aa  137  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1487  MscS mechanosensitive ion channel  27.53 
 
 		 796 aa  137  9e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  31.46 
 
 		 599 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0186  MscS Mechanosensitive ion channel  34.34 
 
 		 304 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  30.34 
 
 		 350 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  33.77 
 
 		 356 aa  134  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3348  MscS Mechanosensitive ion channel  31.72 
 
 		 757 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.703913 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3001  MscS Mechanosensitive ion channel  31.28 
 
 		 755 aa  130  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.996341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1226  MscS Mechanosensitive ion channel  31.71 
 
 		 569 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1197  MscS Mechanosensitive ion channel  31.71 
 
 		 569 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  31.8 
 
 		 538 aa  128  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  29.5 
 
 		 335 aa  127  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1631  MscS mechanosensitive ion channel  28.09 
 
 		 414 aa  126  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5186  MscS Mechanosensitive ion channel  29.7 
 
 		 600 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000148025 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 344 aa  125  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1476  hypothetical protein  32.72 
 
 		 737 aa  124  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  31.64 
 
 		 288 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1579  mechanosensitive ion channel family protein  31.72 
 
 		 455 aa  121  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.397271  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11550  small-conductance mechanosensitive channel  30.58 
 
 		 316 aa  122  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1324  MscS mechanosensitive ion channel  31.72 
 
 		 458 aa  120  7e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00452452  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1456  mechanosensitive ion channel protein  31.72 
 
 		 455 aa  120  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000389307  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1398  MscS Mechanosensitive ion channel  31.86 
 
 		 266 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  31.02 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0540  MscS Mechanosensitive ion channel  26.97 
 
 		 582 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  31.87 
 
 		 337 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  32.83 
 
 		 372 aa  119  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  31.58 
 
 		 337 aa  118  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  28.77 
 
 		 278 aa  117  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1803  MscS Mechanosensitive ion channel  28.51 
 
 		 595 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  0.895337 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  32.6 
 
 		 336 aa  117  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0831  hypothetical protein  34.69 
 
 		 741 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0229209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  33 
 
 		 336 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0082  MscS mechanosensitive ion channel  30.61 
 
 		 303 aa  116  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0423997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0863  hypothetical protein  34.69 
 
 		 741 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00697122  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  31.77 
 
 		 537 aa  116  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0956  hypothetical protein  34.69 
 
 		 741 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0640759  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>