More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3531 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 356 aa  697    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  54.01 
 
 		 454 aa  281  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  49.2 
 
 		 442 aa  279  6e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  51.64 
 
 		 342 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  50.88 
 
 		 335 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  57.33 
 
 		 336 aa  253  5.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  48.15 
 
 		 327 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  48.15 
 
 		 327 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  48.15 
 
 		 327 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  49.82 
 
 		 325 aa  248  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  50.71 
 
 		 336 aa  247  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4634  MscS Mechanosensitive ion channel  46.39 
 
 		 334 aa  242  9e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0333987  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3911  MscS mechanosensitive ion channel  50.72 
 
 		 367 aa  239  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3536  MscS mechanosensitive ion channel  47.29 
 
 		 388 aa  232  7.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  45.04 
 
 		 342 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  46.59 
 
 		 337 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3795  MscS mechanosensitive ion channel  47.22 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.840492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2432  MscS Mechanosensitive ion channel  47.54 
 
 		 307 aa  220  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00547938  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  52.25 
 
 		 337 aa  219  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1363  MscS Mechanosensitive ion channel  50 
 
 		 366 aa  219  7e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.207761  hitchhiker  0.0000810048 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2744  MscS mechanosensitive ion channel  47.62 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535922  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0940  MscS Mechanosensitive ion channel  43.02 
 
 		 293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.285938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7342  MscS Mechanosensitive ion channel  43.02 
 
 		 342 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546474 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  37.46 
 
 		 550 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1824  MscS Mechanosensitive ion channel  39.93 
 
 		 330 aa  183  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000045049  normal  0.0757476 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  36.68 
 
 		 528 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  36.68 
 
 		 528 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  35.95 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  42.22 
 
 		 321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  34.57 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  32.97 
 
 		 537 aa  177  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 289 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  38.11 
 
 		 394 aa  175  9e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1100  MscS Mechanosensitive ion channel  40.36 
 
 		 341 aa  173  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0753115  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  41.52 
 
 		 350 aa  172  7.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  39.48 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  38.05 
 
 		 283 aa  170  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1579  mechanosensitive ion channel family protein  37.35 
 
 		 455 aa  170  4e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.397271  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09010  small-conductance mechanosensitive channel  47.85 
 
 		 298 aa  169  5e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0427247  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  33.1 
 
 		 538 aa  169  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  36.61 
 
 		 335 aa  169  9e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0186  MscS Mechanosensitive ion channel  36.88 
 
 		 304 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  42.18 
 
 		 273 aa  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  41.55 
 
 		 344 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1456  mechanosensitive ion channel protein  35.88 
 
 		 455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000389307  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1324  MscS mechanosensitive ion channel  39.21 
 
 		 458 aa  166  8e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00452452  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  39.91 
 
 		 568 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  41.33 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  39.01 
 
 		 370 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11550  small-conductance mechanosensitive channel  34 
 
 		 316 aa  162  9e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  39.13 
 
 		 372 aa  161  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  33.75 
 
 		 505 aa  159  7e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  33.7 
 
 		 599 aa  158  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2634  MscS Mechanosensitive ion channel  45.12 
 
 		 293 aa  158  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.218755 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  33.45 
 
 		 285 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1971  MscS Mechanosensitive ion channel  33.81 
 
 		 716 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170847  normal  0.348628 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  34.16 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  38.01 
 
 		 773 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  31.54 
 
 		 293 aa  153  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  31.54 
 
 		 293 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  31.54 
 
 		 293 aa  153  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  31.54 
 
 		 293 aa  153  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  31.54 
 
 		 293 aa  153  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  31.54 
 
 		 293 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  31.88 
 
 		 278 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4450  MscS mechanosensitive ion channel  39.91 
 
 		 334 aa  152  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0128  MscS mechanosensitive ion channel  45.27 
 
 		 275 aa  152  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  31.92 
 
 		 293 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  39.15 
 
 		 549 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1790  MscS Mechanosensitive ion channel  34.04 
 
 		 716 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.192721 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  36.26 
 
 		 821 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1803  MscS Mechanosensitive ion channel  31.37 
 
 		 595 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  0.895337 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  34.24 
 
 		 767 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  34.67 
 
 		 822 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  34.67 
 
 		 822 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  34.67 
 
 		 822 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2413  MscS mechanosensitive ion channel  53.6 
 
 		 221 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0138474  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  33.78 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  33.78 
 
 		 293 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5311  MscS mechanosensitive ion channel  39.01 
 
 		 858 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021896 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  33.07 
 
 		 876 aa  145  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3278  MscS mechanosensitive ion channel  36.1 
 
 		 864 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  36.24 
 
 		 771 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3797  MscS mechanosensitive ion channel  36.1 
 
 		 871 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198076  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4680  MscS mechanosensitive ion channel  37.05 
 
 		 837 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  34.6 
 
 		 879 aa  143  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1634  MscS mechanosensitive ion channel  37.2 
 
 		 319 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1580  MscS mechanosensitive ion channel  37.2 
 
 		 319 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1609  MscS mechanosensitive ion channel  37.2 
 
 		 319 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1912  MscS mechanosensitive ion channel  38.32 
 
 		 325 aa  142  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.476783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  34.55 
 
 		 762 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  38.18 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2167  MscS Mechanosensitive ion channel  47.5 
 
 		 228 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000258413 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2401  MscS Mechanosensitive ion channel  33 
 
 		 718 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0124939 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5186  MscS Mechanosensitive ion channel  31.42 
 
 		 600 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000148025 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  33.48 
 
 		 753 aa  140  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1514  MscS mechanosensitive ion channel  35.59 
 
 		 836 aa  140  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.767095  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13451  putative mechanosensitive ion channel, MscS family protein  31.97 
 
 		 656 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2666  MscS Mechanosensitive ion channel  36.82 
 
 		 911 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232424  normal  0.397707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>