More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2167 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2167  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 228 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000258413 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2413  MscS mechanosensitive ion channel  76.32 
 
 		 221 aa  340  8e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0138474  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  57.86 
 
 		 325 aa  163  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  47.21 
 
 		 337 aa  158  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  46.35 
 
 		 336 aa  156  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  59.35 
 
 		 336 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  43.81 
 
 		 327 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  44.27 
 
 		 327 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  44.27 
 
 		 327 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  47.37 
 
 		 342 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4634  MscS Mechanosensitive ion channel  44.79 
 
 		 334 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0333987  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  40.93 
 
 		 335 aa  149  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  55.28 
 
 		 442 aa  148  5e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  54.47 
 
 		 454 aa  148  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0940  MscS Mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 293 aa  148  8e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.285938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3536  MscS mechanosensitive ion channel  54.84 
 
 		 388 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3911  MscS mechanosensitive ion channel  54.84 
 
 		 367 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1824  MscS Mechanosensitive ion channel  52.31 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000045049  normal  0.0757476 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  47.5 
 
 		 356 aa  145  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2432  MscS Mechanosensitive ion channel  44.51 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00547938  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7342  MscS Mechanosensitive ion channel  44.68 
 
 		 342 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3795  MscS mechanosensitive ion channel  54.41 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.840492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2744  MscS mechanosensitive ion channel  54.55 
 
 		 315 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535922  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  51.72 
 
 		 337 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  54.1 
 
 		 342 aa  131  7.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1100  MscS Mechanosensitive ion channel  36.55 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0753115  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1363  MscS Mechanosensitive ion channel  50.86 
 
 		 366 aa  121  7e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.207761  hitchhiker  0.0000810048 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09010  small-conductance mechanosensitive channel  52.1 
 
 		 298 aa  116  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0427247  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2634  MscS Mechanosensitive ion channel  38.17 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.218755 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  42.52 
 
 		 321 aa  112  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11550  small-conductance mechanosensitive channel  40.15 
 
 		 316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  47.9 
 
 		 568 aa  105  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0082  MscS mechanosensitive ion channel  37.91 
 
 		 303 aa  105  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0423997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  35.09 
 
 		 288 aa  105  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  40.83 
 
 		 370 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  44.53 
 
 		 771 aa  101  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  39.75 
 
 		 299 aa  101  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  45.38 
 
 		 762 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  34.34 
 
 		 549 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  42.28 
 
 		 344 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1579  mechanosensitive ion channel family protein  36.67 
 
 		 455 aa  99.4  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.397271  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1456  mechanosensitive ion channel protein  42.52 
 
 		 455 aa  99.4  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000389307  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2666  MscS Mechanosensitive ion channel  29.89 
 
 		 911 aa  99.4  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232424  normal  0.397707 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1324  MscS mechanosensitive ion channel  42.52 
 
 		 458 aa  99  5e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00452452  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  37.84 
 
 		 293 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  37.84 
 
 		 293 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  37.84 
 
 		 293 aa  98.2  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  41.04 
 
 		 372 aa  98.2  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 550 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  37.16 
 
 		 293 aa  95.9  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  37.16 
 
 		 293 aa  95.9  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  37.16 
 
 		 293 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4477  MscS mechanosensitive ion channel  42.86 
 
 		 772 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  37.16 
 
 		 293 aa  95.9  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  37.16 
 
 		 293 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  37.16 
 
 		 293 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2062  MscS mechanosensitive ion channel  34.36 
 
 		 747 aa  95.5  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0676  mechanosensitive ion channel family protein  42.86 
 
 		 767 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  34.5 
 
 		 528 aa  94.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  34.5 
 
 		 528 aa  94.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  37.82 
 
 		 282 aa  94.7  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  40.94 
 
 		 394 aa  94.4  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  33.72 
 
 		 299 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  38.4 
 
 		 335 aa  92.4  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  40.68 
 
 		 285 aa  92  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5033  MscS mechanosensitive ion channel  42.02 
 
 		 701 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149124 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  37.29 
 
 		 294 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5772  MscS mechanosensitive ion channel  34.71 
 
 		 705 aa  90.9  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429261  normal  0.122613 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  39.83 
 
 		 285 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  34.19 
 
 		 350 aa  90.9  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3871  MscS mechanosensitive ion channel  42.02 
 
 		 674 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  32.94 
 
 		 289 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1197  MscS Mechanosensitive ion channel  36.03 
 
 		 569 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1457  MscS mechanosensitive ion channel  36.11 
 
 		 768 aa  90.1  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1226  MscS Mechanosensitive ion channel  36.03 
 
 		 569 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  34.72 
 
 		 273 aa  89.7  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  38.98 
 
 		 787 aa  89.4  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  37.6 
 
 		 693 aa  89  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  41.58 
 
 		 792 aa  89.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3376  MscS mechanosensitive ion channel  33.56 
 
 		 271 aa  89  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228253  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  31.46 
 
 		 822 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  31.46 
 
 		 822 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  31.46 
 
 		 822 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  44 
 
 		 787 aa  88.6  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1895  small-conductance mechanosensitive ion channel  44 
 
 		 787 aa  88.2  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  37.29 
 
 		 718 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5133  MscS Mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 658 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538778  normal  0.147558 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0181  MscS mechanosensitive ion channel  29 
 
 		 707 aa  87.8  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  37.8 
 
 		 308 aa  87.8  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  32.52 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0190  small-conductance mechanosensitive channel  36.13 
 
 		 263 aa  87.8  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  37.29 
 
 		 719 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  38.79 
 
 		 283 aa  87.4  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3068  hypothetical protein  40.68 
 
 		 756 aa  86.7  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.36924 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  34.27 
 
 		 767 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5311  MscS mechanosensitive ion channel  39.2 
 
 		 858 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1609  MscS mechanosensitive ion channel  30.41 
 
 		 319 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1580  MscS mechanosensitive ion channel  30.41 
 
 		 319 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1634  MscS mechanosensitive ion channel  30.41 
 
 		 319 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2511  MscS mechanosensitive ion channel  33.13 
 
 		 282 aa  86.3  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.399769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>