More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1579 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1579  mechanosensitive ion channel family protein  100 
 
 		 455 aa  898    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.397271  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1456  mechanosensitive ion channel protein  92.31 
 
 		 455 aa  797    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000389307  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1324  MscS mechanosensitive ion channel  90.16 
 
 		 458 aa  767    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00452452  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  35.38 
 
 		 350 aa  191  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  41.3 
 
 		 550 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  41.22 
 
 		 394 aa  177  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  36.46 
 
 		 538 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  34.84 
 
 		 753 aa  171  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  37.65 
 
 		 356 aa  169  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  41.42 
 
 		 372 aa  168  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  37.22 
 
 		 528 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  37.22 
 
 		 528 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  31.78 
 
 		 787 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  33.21 
 
 		 537 aa  164  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1895  small-conductance mechanosensitive ion channel  31.78 
 
 		 787 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0186  MscS Mechanosensitive ion channel  38.32 
 
 		 304 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  38.39 
 
 		 321 aa  160  5e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  35.97 
 
 		 792 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  33.59 
 
 		 568 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  38.46 
 
 		 335 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  41.03 
 
 		 288 aa  156  8e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  37.73 
 
 		 308 aa  156  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  34.72 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3104  MscS mechanosensitive ion channel  34.28 
 
 		 790 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0181  MscS mechanosensitive ion channel  33.46 
 
 		 707 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  32.53 
 
 		 505 aa  155  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3072  MscS mechanosensitive ion channel  35.48 
 
 		 773 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.718015  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0349  MscS Mechanosensitive ion channel  34.14 
 
 		 759 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2784  MscS mechanosensitive ion channel  30.72 
 
 		 801 aa  151  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  38.53 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  40.34 
 
 		 289 aa  151  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0901  MscS Mechanosensitive ion channel  29.52 
 
 		 766 aa  151  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  38.36 
 
 		 325 aa  150  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  38.39 
 
 		 299 aa  150  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  32.75 
 
 		 454 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  35.59 
 
 		 283 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  35.56 
 
 		 442 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  37.79 
 
 		 370 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  36.41 
 
 		 337 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  36.04 
 
 		 335 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  39.64 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2998  putative mechanosensitive ion channel  36.33 
 
 		 826 aa  143  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  35.35 
 
 		 342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  32.06 
 
 		 599 aa  140  4.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4634  MscS Mechanosensitive ion channel  33.22 
 
 		 334 aa  139  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0333987  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0940  MscS Mechanosensitive ion channel  35.61 
 
 		 293 aa  138  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.285938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2980  mechanosensitive ion channel family protein  40.19 
 
 		 286 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2511  MscS mechanosensitive ion channel  37.21 
 
 		 282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.399769  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 336 aa  137  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5186  MscS Mechanosensitive ion channel  35.47 
 
 		 600 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000148025 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  35.16 
 
 		 278 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  33.77 
 
 		 327 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  33.77 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  33.77 
 
 		 327 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3795  MscS mechanosensitive ion channel  34.56 
 
 		 313 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.840492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 294 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  35.16 
 
 		 285 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2658  mechanosensitive ion channel family protein  41.67 
 
 		 286 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0115442  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0540  MscS Mechanosensitive ion channel  32.6 
 
 		 582 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  33.81 
 
 		 285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  33.94 
 
 		 293 aa  131  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  33.57 
 
 		 293 aa  131  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  33.94 
 
 		 293 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  39.58 
 
 		 337 aa  131  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  35.16 
 
 		 293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  35.16 
 
 		 293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  35.16 
 
 		 293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  35.16 
 
 		 293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11550  small-conductance mechanosensitive channel  30.9 
 
 		 316 aa  130  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  36.51 
 
 		 293 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  36.51 
 
 		 293 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  30.17 
 
 		 299 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  34.02 
 
 		 773 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5033  MscS mechanosensitive ion channel  27.43 
 
 		 701 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149124 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  31.17 
 
 		 771 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7342  MscS Mechanosensitive ion channel  33.18 
 
 		 342 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546474 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2432  MscS Mechanosensitive ion channel  32.53 
 
 		 307 aa  126  8.000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00547938  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3911  MscS mechanosensitive ion channel  30.66 
 
 		 367 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 547 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2744  MscS mechanosensitive ion channel  35.11 
 
 		 315 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535922  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13451  putative mechanosensitive ion channel, MscS family protein  32.13 
 
 		 656 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0082  MscS mechanosensitive ion channel  31.97 
 
 		 303 aa  124  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0423997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  29.69 
 
 		 735 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  28.9 
 
 		 876 aa  124  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1803  MscS Mechanosensitive ion channel  31.37 
 
 		 595 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  0.895337 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2634  MscS Mechanosensitive ion channel  34.62 
 
 		 293 aa  123  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.218755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  29.3 
 
 		 735 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2401  MscS Mechanosensitive ion channel  33.01 
 
 		 718 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0124939 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  29.82 
 
 		 762 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  26.6 
 
 		 719 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  28.63 
 
 		 767 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1487  MscS mechanosensitive ion channel  31.52 
 
 		 796 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1790  MscS Mechanosensitive ion channel  29.36 
 
 		 716 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.192721 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1457  MscS mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 768 aa  120  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1631  MscS mechanosensitive ion channel  32.43 
 
 		 414 aa  119  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  30.18 
 
 		 718 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  28.45 
 
 		 879 aa  119  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  30.99 
 
 		 547 aa  119  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  29.15 
 
 		 821 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 549 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>