More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1100 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1100  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 
341 aa  669    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0753115  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  39 
 
 
442 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  38.23 
 
 
454 aa  183  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  39.86 
 
 
325 aa  182  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  38.36 
 
 
335 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  41.47 
 
 
336 aa  175  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  41.16 
 
 
337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  40.36 
 
 
356 aa  173  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  36.95 
 
 
337 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 
327 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 
327 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 
327 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  35.28 
 
 
342 aa  166  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2744  MscS mechanosensitive ion channel  37.25 
 
 
315 aa  161  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535922  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2432  MscS Mechanosensitive ion channel  37.01 
 
 
307 aa  159  5e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00547938  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3795  MscS mechanosensitive ion channel  37.14 
 
 
313 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.840492  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0940  MscS Mechanosensitive ion channel  38.57 
 
 
293 aa  156  5.0000000000000005e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.285938  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1363  MscS Mechanosensitive ion channel  40.41 
 
 
366 aa  155  6e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.207761  hitchhiker  0.0000810048 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  41.55 
 
 
336 aa  153  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4634  MscS Mechanosensitive ion channel  34.72 
 
 
334 aa  152  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0333987  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3911  MscS mechanosensitive ion channel  37.32 
 
 
367 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  40.28 
 
 
342 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3536  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 
388 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1824  MscS Mechanosensitive ion channel  41.26 
 
 
330 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000045049  normal  0.0757476 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2634  MscS Mechanosensitive ion channel  37.78 
 
 
293 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218755 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4450  MscS mechanosensitive ion channel  36.48 
 
 
334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1912  MscS mechanosensitive ion channel  36.48 
 
 
325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.476783  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7342  MscS Mechanosensitive ion channel  35.45 
 
 
342 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546474 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1580  MscS mechanosensitive ion channel  35.93 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1609  MscS mechanosensitive ion channel  35.93 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1634  MscS mechanosensitive ion channel  35.93 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112948  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13121  transmembrane protein  40.76 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.609452 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2413  MscS mechanosensitive ion channel  48.41 
 
 
221 aa  126  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0138474  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2167  MscS Mechanosensitive ion channel  36.55 
 
 
228 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000258413 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09010  small-conductance mechanosensitive channel  37.8 
 
 
298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0427247  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0082  MscS mechanosensitive ion channel  33.19 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0423997  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0128  MscS mechanosensitive ion channel  31.65 
 
 
275 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  35.56 
 
 
309 aa  116  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  31.22 
 
 
528 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  31.22 
 
 
528 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1226  MscS Mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 
569 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1197  MscS Mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 
569 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3455  MscS Mechanosensitive ion channel  39.13 
 
 
320 aa  108  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  33.66 
 
 
308 aa  108  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  32.38 
 
 
394 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  31.16 
 
 
278 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  29.25 
 
 
550 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  32.24 
 
 
370 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  32.08 
 
 
537 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  33.04 
 
 
293 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  32.68 
 
 
273 aa  103  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6682  MscS mechanosensitive ion channel  34.82 
 
 
293 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  31.2 
 
 
288 aa  103  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  33 
 
 
282 aa  103  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11550  small-conductance mechanosensitive channel  32.2 
 
 
316 aa  102  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  34.12 
 
 
538 aa  102  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  32.71 
 
 
299 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1456  mechanosensitive ion channel protein  38.92 
 
 
455 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000389307  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1579  mechanosensitive ion channel family protein  39.16 
 
 
455 aa  101  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.397271  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  32.72 
 
 
283 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1324  MscS mechanosensitive ion channel  38.92 
 
 
458 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00452452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  32.14 
 
 
293 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  32.14 
 
 
293 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  32.14 
 
 
293 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  32.14 
 
 
293 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 
335 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  32.14 
 
 
293 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  32.14 
 
 
293 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  33.82 
 
 
293 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  33.82 
 
 
293 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  30.54 
 
 
321 aa  99.4  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  31.31 
 
 
299 aa  99.4  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  30.97 
 
 
599 aa  99.4  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0676  mechanosensitive ion channel family protein  33.95 
 
 
767 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0540  MscS Mechanosensitive ion channel  27.74 
 
 
582 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  31.1 
 
 
344 aa  98.2  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  31.86 
 
 
549 aa  97.4  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4477  MscS mechanosensitive ion channel  31.78 
 
 
772 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2511  MscS mechanosensitive ion channel  33 
 
 
282 aa  96.7  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.399769  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1631  MscS mechanosensitive ion channel  28.83 
 
 
414 aa  96.3  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  31.7 
 
 
285 aa  96.3  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  29.2 
 
 
718 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  30.6 
 
 
879 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  31.62 
 
 
285 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1803  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 
595 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  0.895337 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5033  MscS mechanosensitive ion channel  30.84 
 
 
701 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.149124 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4901  MscS Mechanosensitive ion channel  37.21 
 
 
301 aa  93.6  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  29.91 
 
 
294 aa  93.2  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3871  MscS mechanosensitive ion channel  30.84 
 
 
674 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1728  hypothetical protein  29.2 
 
 
717 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784062  normal  0.0313644 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0901  MscS Mechanosensitive ion channel  30.19 
 
 
766 aa  92.8  9e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1320  MscS mechanosensitive ion channel  28.76 
 
 
717 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3991  MscS mechanosensitive ion channel  29.2 
 
 
715 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0693455  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  31.9 
 
 
289 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0039  hypothetical protein  29.28 
 
 
291 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  29 
 
 
767 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  29.57 
 
 
735 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  29.19 
 
 
787 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  29.57 
 
 
735 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1895  small-conductance mechanosensitive ion channel  29.19 
 
 
787 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>