More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1378 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 342 aa  687    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  49.2 
 
 		 454 aa  291  9e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  50.64 
 
 		 356 aa  290  3e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  46.79 
 
 		 442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  46.53 
 
 		 335 aa  263  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  45.22 
 
 		 336 aa  256  5e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  44.09 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  50.19 
 
 		 325 aa  253  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  47.64 
 
 		 342 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  45.36 
 
 		 337 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4634  MscS Mechanosensitive ion channel  42.02 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0333987  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3795  MscS mechanosensitive ion channel  44.64 
 
 		 313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.840492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  44.83 
 
 		 327 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  44.48 
 
 		 327 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  44.48 
 
 		 327 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3536  MscS mechanosensitive ion channel  41.14 
 
 		 388 aa  225  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3911  MscS mechanosensitive ion channel  41.47 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0940  MscS Mechanosensitive ion channel  42.96 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.285938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2744  MscS mechanosensitive ion channel  41.27 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535922  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  43.31 
 
 		 321 aa  215  7e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2432  MscS Mechanosensitive ion channel  43.11 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00547938  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1824  MscS Mechanosensitive ion channel  39.87 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000045049  normal  0.0757476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7342  MscS Mechanosensitive ion channel  41.33 
 
 		 342 aa  209  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546474 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  48.21 
 
 		 288 aa  206  7e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  47.12 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  42.92 
 
 		 550 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  37.67 
 
 		 528 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  37.67 
 
 		 528 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1363  MscS Mechanosensitive ion channel  50.63 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.207761  hitchhiker  0.0000810048 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  43.75 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  41.78 
 
 		 394 aa  190  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  41.99 
 
 		 568 aa  190  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  37.18 
 
 		 505 aa  188  9e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  39.5 
 
 		 538 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  44.39 
 
 		 370 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  40.51 
 
 		 335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  41.77 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11550  small-conductance mechanosensitive channel  38.46 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  41.85 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  40.45 
 
 		 344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  41.6 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  37.41 
 
 		 285 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  36.89 
 
 		 537 aa  175  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  41.7 
 
 		 289 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  32.06 
 
 		 876 aa  172  9e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  32.7 
 
 		 767 aa  172  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  38.39 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  38.39 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  38.39 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  38.39 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  38.39 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  38.39 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  37.11 
 
 		 285 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  37.55 
 
 		 753 aa  170  4e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  37.95 
 
 		 293 aa  170  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  38.03 
 
 		 787 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0181  MscS mechanosensitive ion channel  38.53 
 
 		 707 aa  170  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  38.39 
 
 		 293 aa  169  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  42.79 
 
 		 372 aa  169  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1895  small-conductance mechanosensitive ion channel  38.03 
 
 		 787 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  38.39 
 
 		 293 aa  169  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0349  MscS Mechanosensitive ion channel  37.55 
 
 		 759 aa  168  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  38.2 
 
 		 879 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0901  MscS Mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 766 aa  166  5e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  38.77 
 
 		 792 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  35.34 
 
 		 599 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  38.66 
 
 		 549 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  38.43 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3072  MscS mechanosensitive ion channel  36.63 
 
 		 773 aa  164  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.718015  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  37.09 
 
 		 308 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0128  MscS mechanosensitive ion channel  42.57 
 
 		 275 aa  162  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1579  mechanosensitive ion channel family protein  39.64 
 
 		 455 aa  160  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.397271  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1456  mechanosensitive ion channel protein  38.02 
 
 		 455 aa  161  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000389307  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1181  hypothetical protein  37.92 
 
 		 884 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.40697 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1324  MscS mechanosensitive ion channel  38.3 
 
 		 458 aa  161  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00452452  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1100  MscS Mechanosensitive ion channel  40.28 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0753115  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5311  MscS mechanosensitive ion channel  37.69 
 
 		 858 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021896 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  33 
 
 		 787 aa  160  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  39.72 
 
 		 278 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5420  MscS Mechanosensitive ion channel  37.71 
 
 		 889 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0186  MscS Mechanosensitive ion channel  43.22 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  36.13 
 
 		 822 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  36.71 
 
 		 273 aa  157  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  36.13 
 
 		 822 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  36.13 
 
 		 822 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09010  small-conductance mechanosensitive channel  42.79 
 
 		 298 aa  155  6e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0427247  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2784  MscS mechanosensitive ion channel  37.23 
 
 		 801 aa  155  7e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2998  putative mechanosensitive ion channel  39.74 
 
 		 826 aa  155  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4901  MscS Mechanosensitive ion channel  34.98 
 
 		 301 aa  153  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2666  MscS Mechanosensitive ion channel  35.65 
 
 		 911 aa  152  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232424  normal  0.397707 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  35.93 
 
 		 773 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  34.29 
 
 		 735 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1971  MscS Mechanosensitive ion channel  32.11 
 
 		 716 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170847  normal  0.348628 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  35.75 
 
 		 821 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  34.29 
 
 		 735 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  39.17 
 
 		 693 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  39.6 
 
 		 309 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2401  MscS Mechanosensitive ion channel  36.23 
 
 		 718 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0124939 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4680  MscS mechanosensitive ion channel  36.99 
 
 		 837 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4450  MscS mechanosensitive ion channel  36.8 
 
 		 334 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>