More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1412 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 550 aa  1102    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  51.12 
 
 		 528 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  51.12 
 
 		 528 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  51.72 
 
 		 538 aa  497  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  49.09 
 
 		 537 aa  476  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5186  MscS Mechanosensitive ion channel  30.84 
 
 		 600 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000148025 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  33.45 
 
 		 599 aa  248  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1803  MscS Mechanosensitive ion channel  33.21 
 
 		 595 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  0.895337 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  48.88 
 
 		 350 aa  228  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0540  MscS Mechanosensitive ion channel  31.87 
 
 		 582 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1226  MscS Mechanosensitive ion channel  31.92 
 
 		 569 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1197  MscS Mechanosensitive ion channel  31.56 
 
 		 569 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2274  MscS mechanosensitive ion channel  31.31 
 
 		 586 aa  213  7e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  44.49 
 
 		 344 aa  207  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13451  putative mechanosensitive ion channel, MscS family protein  37.27 
 
 		 656 aa  206  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  37.07 
 
 		 356 aa  194  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  35.41 
 
 		 505 aa  190  7e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  39.6 
 
 		 394 aa  188  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1324  MscS mechanosensitive ion channel  42.08 
 
 		 458 aa  186  9e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00452452  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1579  mechanosensitive ion channel family protein  41.3 
 
 		 455 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.397271  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1456  mechanosensitive ion channel protein  41.56 
 
 		 455 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000389307  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  37.82 
 
 		 454 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  36.16 
 
 		 283 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3072  MscS mechanosensitive ion channel  40.87 
 
 		 773 aa  182  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.718015  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  35.23 
 
 		 442 aa  182  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  39.73 
 
 		 321 aa  181  4e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  39.65 
 
 		 568 aa  179  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  37.72 
 
 		 787 aa  179  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 335 aa  179  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  42.92 
 
 		 342 aa  178  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  37.18 
 
 		 718 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  36.86 
 
 		 762 aa  174  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  37.55 
 
 		 767 aa  174  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  36.4 
 
 		 719 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  37.78 
 
 		 876 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  35.9 
 
 		 771 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  36.64 
 
 		 879 aa  170  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  36.12 
 
 		 735 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  35.68 
 
 		 735 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  36.53 
 
 		 288 aa  168  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0186  MscS Mechanosensitive ion channel  44.55 
 
 		 304 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 327 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 327 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 327 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  37.67 
 
 		 336 aa  164  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  34.96 
 
 		 342 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1728  hypothetical protein  37.18 
 
 		 717 aa  163  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784062  normal  0.0313644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  38.36 
 
 		 337 aa  163  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1320  MscS mechanosensitive ion channel  37.18 
 
 		 717 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  38.64 
 
 		 336 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3991  MscS mechanosensitive ion channel  36.75 
 
 		 715 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0693455  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  28.53 
 
 		 753 aa  162  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4634  MscS Mechanosensitive ion channel  37.39 
 
 		 334 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0333987  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  38.74 
 
 		 299 aa  160  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  36.82 
 
 		 325 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  34.44 
 
 		 289 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  34.62 
 
 		 299 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4477  MscS mechanosensitive ion channel  33.88 
 
 		 772 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  37.61 
 
 		 693 aa  158  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  31.15 
 
 		 294 aa  157  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  32.43 
 
 		 278 aa  156  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2401  MscS Mechanosensitive ion channel  34.12 
 
 		 718 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0124939 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  39.6 
 
 		 372 aa  156  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  39.17 
 
 		 370 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3795  MscS mechanosensitive ion channel  37.61 
 
 		 313 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.840492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  35.37 
 
 		 308 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0676  mechanosensitive ion channel family protein  33.47 
 
 		 767 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3068  hypothetical protein  35.62 
 
 		 756 aa  154  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.36924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5033  MscS mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 701 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149124 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  35 
 
 		 792 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  37.22 
 
 		 549 aa  152  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7342  MscS Mechanosensitive ion channel  34.7 
 
 		 342 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546474 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0901  MscS Mechanosensitive ion channel  35.45 
 
 		 766 aa  151  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3911  MscS mechanosensitive ion channel  36.28 
 
 		 367 aa  150  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3871  MscS mechanosensitive ion channel  34.7 
 
 		 674 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3536  MscS mechanosensitive ion channel  35.93 
 
 		 388 aa  150  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  35.91 
 
 		 787 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1895  small-conductance mechanosensitive ion channel  35.91 
 
 		 787 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0940  MscS Mechanosensitive ion channel  31.67 
 
 		 293 aa  147  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.285938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1398  MscS Mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 266 aa  146  9e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  33.94 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  33.65 
 
 		 337 aa  146  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3348  MscS Mechanosensitive ion channel  38.79 
 
 		 757 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.703913 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0349  MscS Mechanosensitive ion channel  35.38 
 
 		 759 aa  144  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2511  MscS mechanosensitive ion channel  31.56 
 
 		 282 aa  144  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.399769  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2744  MscS mechanosensitive ion channel  36.94 
 
 		 315 aa  143  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535922  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3001  MscS Mechanosensitive ion channel  38.32 
 
 		 755 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.996341  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  34.68 
 
 		 309 aa  142  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  29.89 
 
 		 285 aa  141  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  32.6 
 
 		 773 aa  141  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2062  MscS mechanosensitive ion channel  34.16 
 
 		 747 aa  141  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1971  MscS Mechanosensitive ion channel  31.29 
 
 		 716 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170847  normal  0.348628 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2784  MscS mechanosensitive ion channel  34.39 
 
 		 801 aa  141  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3278  MscS mechanosensitive ion channel  32.09 
 
 		 864 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3797  MscS mechanosensitive ion channel  32.09 
 
 		 871 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198076  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  31.28 
 
 		 821 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4680  MscS mechanosensitive ion channel  30.4 
 
 		 837 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  30.84 
 
 		 822 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  30.84 
 
 		 822 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2980  mechanosensitive ion channel family protein  31.48 
 
 		 286 aa  139  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>