More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3024 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 309 aa  620  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1580  MscS mechanosensitive ion channel  60.06 
 
 		 319 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1609  MscS mechanosensitive ion channel  60.06 
 
 		 319 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1634  MscS mechanosensitive ion channel  60.06 
 
 		 319 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4450  MscS mechanosensitive ion channel  64.31 
 
 		 334 aa  335  5.999999999999999e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1912  MscS mechanosensitive ion channel  64.63 
 
 		 325 aa  331  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.476783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13121  transmembrane protein  62.26 
 
 		 308 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.609452 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6682  MscS mechanosensitive ion channel  58.24 
 
 		 293 aa  306  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4901  MscS Mechanosensitive ion channel  60.98 
 
 		 301 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3455  MscS Mechanosensitive ion channel  53.76 
 
 		 320 aa  297  1e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0128  MscS mechanosensitive ion channel  56.7 
 
 		 275 aa  281  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  41.89 
 
 		 335 aa  169  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  35.87 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  40.5 
 
 		 442 aa  149  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  39.5 
 
 		 454 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  34.02 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  40.96 
 
 		 342 aa  146  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  43.09 
 
 		 337 aa  145  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  34.68 
 
 		 550 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  33.84 
 
 		 394 aa  140  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7342  MscS Mechanosensitive ion channel  38.57 
 
 		 342 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546474 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  38.38 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  39.6 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4634  MscS Mechanosensitive ion channel  36.16 
 
 		 334 aa  135  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0333987  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  38.1 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  34.8 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  39.25 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3795  MscS mechanosensitive ion channel  35.33 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.840492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  36.5 
 
 		 370 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  36.32 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  37 
 
 		 344 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3911  MscS mechanosensitive ion channel  34.4 
 
 		 367 aa  129  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  34.38 
 
 		 599 aa  128  9.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3536  MscS mechanosensitive ion channel  32.48 
 
 		 388 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  35.07 
 
 		 327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  35.07 
 
 		 327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  35.07 
 
 		 327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  33.33 
 
 		 537 aa  127  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1363  MscS Mechanosensitive ion channel  37.95 
 
 		 366 aa  127  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.207761  hitchhiker  0.0000810048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  33.99 
 
 		 528 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  33.99 
 
 		 528 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  33.51 
 
 		 538 aa  126  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  29.55 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0039  hypothetical protein  29.09 
 
 		 291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  33 
 
 		 372 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2432  MscS Mechanosensitive ion channel  37.57 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00547938  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  28.02 
 
 		 568 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  33.68 
 
 		 350 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  32.11 
 
 		 294 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1100  MscS Mechanosensitive ion channel  35.56 
 
 		 341 aa  116  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0753115  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  31.4 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2744  MscS mechanosensitive ion channel  33.7 
 
 		 315 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535922  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2511  MscS mechanosensitive ion channel  34.55 
 
 		 282 aa  113  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.399769  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  29.66 
 
 		 273 aa  112  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  32.08 
 
 		 718 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2634  MscS Mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.218755 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0409  hypothetical protein  32.11 
 
 		 293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0214224  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  32.65 
 
 		 787 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0420  hypothetical protein  32.11 
 
 		 293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.387203  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  32.3 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1728  hypothetical protein  33.84 
 
 		 717 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784062  normal  0.0313644 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  32.91 
 
 		 735 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1320  MscS mechanosensitive ion channel  33.84 
 
 		 717 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  34.27 
 
 		 735 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3871  MscS mechanosensitive ion channel  36.31 
 
 		 674 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4477  MscS mechanosensitive ion channel  36.68 
 
 		 772 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3991  MscS mechanosensitive ion channel  33.84 
 
 		 715 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0693455  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  31.98 
 
 		 719 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  32.14 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  33.03 
 
 		 879 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5033  MscS mechanosensitive ion channel  35.05 
 
 		 701 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  29.54 
 
 		 549 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0676  mechanosensitive ion channel family protein  30.39 
 
 		 767 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5186  MscS Mechanosensitive ion channel  31.41 
 
 		 600 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000148025 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2401  MscS Mechanosensitive ion channel  31.75 
 
 		 718 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0124939 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  32.68 
 
 		 876 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09010  small-conductance mechanosensitive channel  34.62 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0427247  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1627  MscS mechanosensitive ion channel  29.77 
 
 		 881 aa  106  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1197  MscS Mechanosensitive ion channel  32.37 
 
 		 569 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11550  small-conductance mechanosensitive channel  33.33 
 
 		 316 aa  105  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1226  MscS Mechanosensitive ion channel  32.37 
 
 		 569 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1398  MscS Mechanosensitive ion channel  29.02 
 
 		 266 aa  105  7e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  32.38 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0186  MscS Mechanosensitive ion channel  29.62 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1824  MscS Mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000045049  normal  0.0757476 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0940  MscS Mechanosensitive ion channel  33.65 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.285938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1803  MscS Mechanosensitive ion channel  29.85 
 
 		 595 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  0.895337 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  31.68 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  31.68 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  31.68 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  31.68 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  31.68 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  28.46 
 
 		 767 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  31.68 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  32.67 
 
 		 289 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13451  putative mechanosensitive ion channel, MscS family protein  31.32 
 
 		 656 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0104  hypothetical protein  30.2 
 
 		 280 aa  102  8e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0511133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  31.53 
 
 		 293 aa  102  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>