More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0409 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0409  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  575  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0214224  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0420  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  575  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.387203  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0039  hypothetical protein  81.44 
 
 		 291 aa  484  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2421  hypothetical protein  49.66 
 
 		 295 aa  259  5.0000000000000005e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0349242  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  40.41 
 
 		 299 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  40.56 
 
 		 294 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  37.28 
 
 		 285 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  37.11 
 
 		 293 aa  202  7e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  36.77 
 
 		 293 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  36.77 
 
 		 293 aa  201  8e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  36.77 
 
 		 293 aa  201  9e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  36.77 
 
 		 293 aa  201  9e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  36.77 
 
 		 293 aa  201  9e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  36.77 
 
 		 293 aa  201  9e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  38.01 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  37.8 
 
 		 293 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  37.46 
 
 		 293 aa  195  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  36.59 
 
 		 288 aa  186  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  35.13 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  38.8 
 
 		 299 aa  168  9e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  35.54 
 
 		 282 aa  159  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  35.95 
 
 		 372 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  36.08 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0571  MscS Mechanosensitive ion channel  36.95 
 
 		 260 aa  157  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000639441  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  37.29 
 
 		 370 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  35.43 
 
 		 278 aa  142  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  32.91 
 
 		 335 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0104  hypothetical protein  33.73 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0511133  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2511  MscS mechanosensitive ion channel  33.59 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.399769  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0082  MscS mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 303 aa  133  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0423997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1631  MscS mechanosensitive ion channel  30.94 
 
 		 414 aa  132  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  28.01 
 
 		 549 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6682  MscS mechanosensitive ion channel  28.62 
 
 		 293 aa  125  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  32.33 
 
 		 792 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4901  MscS Mechanosensitive ion channel  30.66 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  31.53 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  29.28 
 
 		 735 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  28.9 
 
 		 735 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  30.68 
 
 		 787 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1895  small-conductance mechanosensitive ion channel  30.68 
 
 		 787 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1609  MscS mechanosensitive ion channel  29.96 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1580  MscS mechanosensitive ion channel  29.96 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1634  MscS mechanosensitive ion channel  29.96 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0546  MscS mechanosensitive ion channel  32.16 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  27.37 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  29.15 
 
 		 336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  30.37 
 
 		 505 aa  119  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  29.82 
 
 		 879 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11550  small-conductance mechanosensitive channel  32.22 
 
 		 316 aa  119  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  26.82 
 
 		 568 aa  119  9e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0901  MscS Mechanosensitive ion channel  31.01 
 
 		 766 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1971  MscS Mechanosensitive ion channel  28.23 
 
 		 716 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170847  normal  0.348628 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3455  MscS Mechanosensitive ion channel  29.21 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  29.26 
 
 		 787 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  27.21 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  27.21 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  27.21 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 356 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4477  MscS mechanosensitive ion channel  28.86 
 
 		 772 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  27.6 
 
 		 335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5033  MscS mechanosensitive ion channel  27.24 
 
 		 701 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149124 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4456  MscS mechanosensitive ion channel  32.29 
 
 		 550 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1790  MscS Mechanosensitive ion channel  27.89 
 
 		 716 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.192721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0128  MscS mechanosensitive ion channel  28.96 
 
 		 275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 		 309 aa  116  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  29.37 
 
 		 693 aa  116  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  28.2 
 
 		 822 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  28.2 
 
 		 822 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  28.2 
 
 		 822 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  33.64 
 
 		 342 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  29.55 
 
 		 342 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  27.67 
 
 		 599 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  26.18 
 
 		 767 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  26.55 
 
 		 876 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  28.85 
 
 		 718 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0676  mechanosensitive ion channel family protein  27.89 
 
 		 767 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  26.54 
 
 		 550 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  27.84 
 
 		 719 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3104  MscS mechanosensitive ion channel  31.7 
 
 		 790 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  27.3 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  29.01 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  28.16 
 
 		 537 aa  114  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1476  hypothetical protein  31.16 
 
 		 737 aa  113  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0349  MscS Mechanosensitive ion channel  31.34 
 
 		 759 aa  113  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4450  MscS mechanosensitive ion channel  30.74 
 
 		 334 aa  112  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 		 773 aa  112  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2432  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 307 aa  112  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00547938  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  33.48 
 
 		 344 aa  112  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1457  MscS mechanosensitive ion channel  27.61 
 
 		 768 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1728  hypothetical protein  27.82 
 
 		 717 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784062  normal  0.0313644 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0186  MscS Mechanosensitive ion channel  28.63 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1320  MscS mechanosensitive ion channel  28.2 
 
 		 717 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1912  MscS mechanosensitive ion channel  30.64 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.476783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3991  MscS mechanosensitive ion channel  27.82 
 
 		 715 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0693455  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  28.38 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0181  MscS mechanosensitive ion channel  29.71 
 
 		 707 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2062  MscS mechanosensitive ion channel  29.74 
 
 		 747 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2401  MscS Mechanosensitive ion channel  33 
 
 		 718 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0124939 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  30.42 
 
 		 753 aa  109  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0190  small-conductance mechanosensitive channel  32.63 
 
 		 263 aa  109  6e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>