More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0190 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0190  small-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 263 aa  530  1e-149  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0104  hypothetical protein  60.76 
 
 		 280 aa  321  8e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0511133  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0546  MscS mechanosensitive ion channel  42.23 
 
 		 291 aa  199  3e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  37.09 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  32.28 
 
 		 294 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 283 aa  149  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1691  small-conductance mechanosensitive channel  35.98 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  34.47 
 
 		 372 aa  144  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 285 aa  141  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2980  mechanosensitive ion channel family protein  36.5 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2658  mechanosensitive ion channel family protein  37.26 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0115442  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  34.12 
 
 		 370 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  30.24 
 
 		 293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  30.24 
 
 		 293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  30.24 
 
 		 293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  30.24 
 
 		 293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  30.36 
 
 		 293 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  30.36 
 
 		 293 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  33.46 
 
 		 344 aa  138  8.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  32.22 
 
 		 288 aa  137  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  30.36 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  31.93 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  34.63 
 
 		 528 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  34.63 
 
 		 528 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  30.12 
 
 		 285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  38.46 
 
 		 282 aa  135  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  32.65 
 
 		 308 aa  135  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  32.56 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  32.56 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  28.32 
 
 		 356 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  29.14 
 
 		 337 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  38.83 
 
 		 550 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1410  hypothetical protein  35.61 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  32.08 
 
 		 336 aa  125  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0082  MscS mechanosensitive ion channel  31.88 
 
 		 303 aa  123  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0423997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  30.23 
 
 		 350 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2511  MscS mechanosensitive ion channel  29.44 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.399769  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0571  MscS Mechanosensitive ion channel  32.24 
 
 		 260 aa  122  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000639441  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  33.02 
 
 		 325 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4634  MscS Mechanosensitive ion channel  31.1 
 
 		 334 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0333987  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  30.92 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  33.48 
 
 		 537 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  32.39 
 
 		 336 aa  119  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  31.13 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  30.84 
 
 		 342 aa  119  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  29.24 
 
 		 327 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  29.24 
 
 		 327 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  29.24 
 
 		 327 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  36.7 
 
 		 538 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2432  MscS Mechanosensitive ion channel  32.71 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00547938  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0432  small-conductance mechanosensitive channel  32.7 
 
 		 298 aa  115  8.999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000493882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2666  MscS Mechanosensitive ion channel  32.46 
 
 		 911 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232424  normal  0.397707 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1627  MscS mechanosensitive ion channel  31.89 
 
 		 881 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  33.18 
 
 		 599 aa  113  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  33.51 
 
 		 335 aa  112  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4456  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 550 aa  112  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3068  hypothetical protein  32.41 
 
 		 756 aa  112  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.36924 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  28.91 
 
 		 442 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  32 
 
 		 335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0039  hypothetical protein  26.62 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3795  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.840492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  28.8 
 
 		 549 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0940  MscS Mechanosensitive ion channel  32.31 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.285938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  30.1 
 
 		 337 aa  109  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  31.63 
 
 		 767 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  31.63 
 
 		 879 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  34.51 
 
 		 762 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  32.97 
 
 		 876 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  29.23 
 
 		 735 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  31.67 
 
 		 718 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1514  MscS mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 		 836 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.767095  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2401  MscS Mechanosensitive ion channel  30.88 
 
 		 718 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0124939 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3911  MscS mechanosensitive ion channel  27.99 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  30.25 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  28.3 
 
 		 454 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  28.85 
 
 		 735 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  30.19 
 
 		 773 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0420  hypothetical protein  30.22 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.387203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0409  hypothetical protein  30.22 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0214224  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1803  MscS Mechanosensitive ion channel  36.26 
 
 		 595 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  0.895337 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1631  MscS mechanosensitive ion channel  28.76 
 
 		 414 aa  106  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1728  hypothetical protein  32.13 
 
 		 717 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784062  normal  0.0313644 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  29.88 
 
 		 394 aa  105  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  33.88 
 
 		 771 aa  105  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1320  MscS mechanosensitive ion channel  32.58 
 
 		 717 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3991  MscS mechanosensitive ion channel  31.67 
 
 		 715 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0693455  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  30.26 
 
 		 342 aa  105  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1580  MscS mechanosensitive ion channel  28.11 
 
 		 319 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1609  MscS mechanosensitive ion channel  28.11 
 
 		 319 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1634  MscS mechanosensitive ion channel  28.11 
 
 		 319 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0901  MscS Mechanosensitive ion channel  29.25 
 
 		 766 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  33.03 
 
 		 753 aa  103  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  29.22 
 
 		 505 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  34.38 
 
 		 821 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3536  MscS mechanosensitive ion channel  29.25 
 
 		 388 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1457  MscS mechanosensitive ion channel  29.26 
 
 		 768 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0128  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 275 aa  102  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  31.41 
 
 		 822 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>