More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4456 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4456  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 550 aa  1084    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1631  MscS mechanosensitive ion channel  43.52 
 
 		 414 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 549 aa  195  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  31.71 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  33.62 
 
 		 294 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  32.64 
 
 		 299 aa  131  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  33.9 
 
 		 299 aa  130  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  35.19 
 
 		 370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  35.05 
 
 		 282 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2511  MscS mechanosensitive ion channel  32.8 
 
 		 282 aa  128  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.399769  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  31.2 
 
 		 719 aa  126  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  32.41 
 
 		 718 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  34.69 
 
 		 278 aa  126  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  32.3 
 
 		 288 aa  125  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1320  MscS mechanosensitive ion channel  32.87 
 
 		 717 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1728  hypothetical protein  32.41 
 
 		 717 aa  123  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784062  normal  0.0313644 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 285 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3991  MscS mechanosensitive ion channel  32.41 
 
 		 715 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0693455  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  32.03 
 
 		 283 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  33.8 
 
 		 289 aa  120  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1971  MscS Mechanosensitive ion channel  29.39 
 
 		 716 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170847  normal  0.348628 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  31.46 
 
 		 293 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  29.39 
 
 		 787 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  31.46 
 
 		 293 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  31.46 
 
 		 293 aa  118  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  31.46 
 
 		 293 aa  118  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  31.46 
 
 		 293 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  31.46 
 
 		 293 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  31.46 
 
 		 293 aa  117  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  30.43 
 
 		 336 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  26.05 
 
 		 693 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  28.51 
 
 		 879 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  31.46 
 
 		 293 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  31.46 
 
 		 293 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1790  MscS Mechanosensitive ion channel  29.22 
 
 		 716 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.192721 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  29.58 
 
 		 735 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  29.58 
 
 		 735 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2062  MscS mechanosensitive ion channel  31.9 
 
 		 747 aa  114  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0039  hypothetical protein  31.25 
 
 		 291 aa  114  6e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  27.66 
 
 		 767 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  28.09 
 
 		 876 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0082  MscS mechanosensitive ion channel  30.47 
 
 		 303 aa  112  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0423997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  31.46 
 
 		 285 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0190  small-conductance mechanosensitive channel  33.33 
 
 		 263 aa  111  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  31.47 
 
 		 528 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  29.82 
 
 		 325 aa  111  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  31.47 
 
 		 528 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0571  MscS Mechanosensitive ion channel  34.87 
 
 		 260 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000639441  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1457  MscS mechanosensitive ion channel  30.32 
 
 		 768 aa  110  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  30.18 
 
 		 321 aa  108  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  28.19 
 
 		 356 aa  108  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11550  small-conductance mechanosensitive channel  28.64 
 
 		 316 aa  107  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0420  hypothetical protein  32.38 
 
 		 293 aa  107  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.387203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0409  hypothetical protein  32.38 
 
 		 293 aa  107  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0214224  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  32.31 
 
 		 537 aa  107  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3687  MscS mechanosensitive ion channel  29.3 
 
 		 784 aa  106  9e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276928  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  31.13 
 
 		 335 aa  104  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  28.44 
 
 		 550 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6137  hypothetical protein  24.07 
 
 		 725 aa  103  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.119326  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1398  MscS Mechanosensitive ion channel  30.11 
 
 		 266 aa  102  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  30.84 
 
 		 308 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  29.63 
 
 		 342 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1579  mechanosensitive ion channel family protein  26.92 
 
 		 455 aa  102  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.397271  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0104  hypothetical protein  31.78 
 
 		 280 aa  101  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0511133  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  30.05 
 
 		 762 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5186  MscS Mechanosensitive ion channel  24.78 
 
 		 600 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000148025 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1627  MscS mechanosensitive ion channel  29.69 
 
 		 881 aa  100  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  28.94 
 
 		 538 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2401  MscS Mechanosensitive ion channel  26.98 
 
 		 718 aa  99.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0124939 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1456  mechanosensitive ion channel protein  29.49 
 
 		 455 aa  98.2  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000389307  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  28.37 
 
 		 771 aa  98.6  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3072  MscS mechanosensitive ion channel  26.64 
 
 		 773 aa  97.8  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.718015  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5133  MscS Mechanosensitive ion channel  25.36 
 
 		 658 aa  97.4  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538778  normal  0.147558 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1324  MscS mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 458 aa  97.1  8e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00452452  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1197  MscS Mechanosensitive ion channel  28.23 
 
 		 569 aa  96.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  25.82 
 
 		 773 aa  96.7  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0901  MscS Mechanosensitive ion channel  26.91 
 
 		 766 aa  96.7  9e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5772  MscS mechanosensitive ion channel  26.46 
 
 		 705 aa  96.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429261  normal  0.122613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  26.73 
 
 		 337 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0181  MscS mechanosensitive ion channel  22.53 
 
 		 707 aa  96.3  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2980  mechanosensitive ion channel family protein  34.53 
 
 		 286 aa  96.3  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1226  MscS Mechanosensitive ion channel  28.23 
 
 		 569 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2658  mechanosensitive ion channel family protein  35.14 
 
 		 286 aa  95.9  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0115442  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 335 aa  95.5  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3068  hypothetical protein  27.24 
 
 		 756 aa  95.1  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.36924 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  28.14 
 
 		 394 aa  94.7  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4584  MscS mechanosensitive ion channel  25.53 
 
 		 697 aa  94.4  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.99351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4634  MscS Mechanosensitive ion channel  28.32 
 
 		 334 aa  94.7  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0333987  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  25.23 
 
 		 442 aa  94.4  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2666  MscS Mechanosensitive ion channel  24.02 
 
 		 911 aa  94.4  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232424  normal  0.397707 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4049  MscS Mechanosensitive ion channel  25.23 
 
 		 650 aa  94  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  30.89 
 
 		 342 aa  93.6  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3523  MscS Mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 703 aa  92.8  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0609886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  26.76 
 
 		 753 aa  91.7  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0349  MscS Mechanosensitive ion channel  26.46 
 
 		 759 aa  92  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3228  MscS Mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 704 aa  91.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0546  MscS mechanosensitive ion channel  37.2 
 
 		 291 aa  91.3  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  28.24 
 
 		 792 aa  91.3  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5033  MscS mechanosensitive ion channel  31.61 
 
 		 701 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  26.03 
 
 		 454 aa  90.5  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>