More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0546 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0546  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 291 aa  583  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0104  hypothetical protein  39.43 
 
 		 280 aa  199  3e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0511133  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0190  small-conductance mechanosensitive channel  46.48 
 
 		 263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1691  small-conductance mechanosensitive channel  41.15 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  32.71 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0432  small-conductance mechanosensitive channel  33.46 
 
 		 298 aa  145  8.000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000493882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  36.84 
 
 		 299 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  35.21 
 
 		 285 aa  142  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1410  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  34.18 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  34.18 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  34.18 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  34.18 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  34.18 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  34.18 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  32.32 
 
 		 288 aa  136  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  32.5 
 
 		 294 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  33.47 
 
 		 293 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  32.21 
 
 		 278 aa  132  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  35.27 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  35.27 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  31.93 
 
 		 299 aa  125  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  29.91 
 
 		 372 aa  122  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  34.51 
 
 		 282 aa  119  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0039  hypothetical protein  31.66 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  30.9 
 
 		 370 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  34.07 
 
 		 289 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0571  MscS Mechanosensitive ion channel  37.21 
 
 		 260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000639441  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0409  hypothetical protein  31.35 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0214224  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0420  hypothetical protein  31.35 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.387203  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  32.16 
 
 		 283 aa  109  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  34.76 
 
 		 773 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2511  MscS mechanosensitive ion channel  28.74 
 
 		 282 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.399769  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  31.23 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1627  MscS mechanosensitive ion channel  32.18 
 
 		 881 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  31.61 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2401  MscS Mechanosensitive ion channel  31.02 
 
 		 718 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0124939 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  32.75 
 
 		 550 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0082  MscS mechanosensitive ion channel  30.07 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0423997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2666  MscS Mechanosensitive ion channel  29.9 
 
 		 911 aa  103  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232424  normal  0.397707 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  33.66 
 
 		 753 aa  102  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3068  hypothetical protein  30 
 
 		 756 aa  102  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.36924 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  31.6 
 
 		 344 aa  102  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0940  MscS Mechanosensitive ion channel  31.98 
 
 		 293 aa  102  9e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.285938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  28.82 
 
 		 693 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  30.33 
 
 		 787 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  35.47 
 
 		 528 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  29.3 
 
 		 336 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2980  mechanosensitive ion channel family protein  34.43 
 
 		 286 aa  99.8  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  35.47 
 
 		 528 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  30.37 
 
 		 325 aa  99.8  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  31.86 
 
 		 879 aa  99  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 876 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  30.14 
 
 		 327 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  29.9 
 
 		 767 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  32.63 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  33.73 
 
 		 822 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4634  MscS Mechanosensitive ion channel  28.88 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0333987  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  33.73 
 
 		 822 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  31.94 
 
 		 335 aa  97.4  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  33.73 
 
 		 822 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3797  MscS mechanosensitive ion channel  34.34 
 
 		 871 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198076  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  29.35 
 
 		 350 aa  97.4  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3687  MscS mechanosensitive ion channel  33.95 
 
 		 784 aa  97.4  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276928  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  30.14 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  30.14 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  30.58 
 
 		 719 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  31 
 
 		 335 aa  97.1  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  27.99 
 
 		 718 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2658  mechanosensitive ion channel family protein  33.16 
 
 		 286 aa  96.7  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0115442  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3278  MscS mechanosensitive ion channel  34.34 
 
 		 864 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2432  MscS Mechanosensitive ion channel  31.69 
 
 		 307 aa  96.3  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00547938  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1398  MscS Mechanosensitive ion channel  29.07 
 
 		 266 aa  96.3  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1514  MscS mechanosensitive ion channel  27.97 
 
 		 836 aa  96.3  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.767095  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5133  MscS Mechanosensitive ion channel  29.38 
 
 		 658 aa  95.9  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538778  normal  0.147558 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  27.85 
 
 		 356 aa  95.9  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0181  MscS mechanosensitive ion channel  34.18 
 
 		 707 aa  95.5  9e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  29.15 
 
 		 442 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1728  hypothetical protein  27.99 
 
 		 717 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784062  normal  0.0313644 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1631  MscS mechanosensitive ion channel  32.11 
 
 		 414 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4049  MscS Mechanosensitive ion channel  28.72 
 
 		 650 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3991  MscS mechanosensitive ion channel  27.99 
 
 		 715 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0693455  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5420  MscS Mechanosensitive ion channel  35 
 
 		 889 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1320  MscS mechanosensitive ion channel  27.61 
 
 		 717 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4680  MscS mechanosensitive ion channel  39.69 
 
 		 837 aa  93.2  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  26.49 
 
 		 568 aa  93.6  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3795  MscS mechanosensitive ion channel  30.37 
 
 		 313 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.840492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  30.16 
 
 		 337 aa  92.8  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  30.72 
 
 		 454 aa  92.4  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  32.68 
 
 		 762 aa  92.8  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  33.11 
 
 		 771 aa  92.4  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  31.95 
 
 		 821 aa  92.4  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1580  MscS mechanosensitive ion channel  28.86 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  27.73 
 
 		 321 aa  92  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  35.42 
 
 		 599 aa  92  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  29.76 
 
 		 792 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  38.73 
 
 		 394 aa  91.7  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1609  MscS mechanosensitive ion channel  27.98 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4456  MscS mechanosensitive ion channel  37.2 
 
 		 550 aa  91.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1634  MscS mechanosensitive ion channel  27.98 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>