More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2511 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2511  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 282 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.399769  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  53.99 
 
 		 278 aa  298  7e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  43.44 
 
 		 283 aa  216  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  44.09 
 
 		 289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2980  mechanosensitive ion channel family protein  41.06 
 
 		 286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  44.26 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0571  MscS Mechanosensitive ion channel  40.74 
 
 		 260 aa  192  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000639441  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2658  mechanosensitive ion channel family protein  40.64 
 
 		 286 aa  187  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0115442  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  42.99 
 
 		 370 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  42.31 
 
 		 372 aa  186  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  38.87 
 
 		 288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  39.34 
 
 		 282 aa  177  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  39.11 
 
 		 299 aa  175  7e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  36.3 
 
 		 294 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  35.48 
 
 		 285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  35.08 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  35.08 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  35.08 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  35.08 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  35.08 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  35.08 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  35.08 
 
 		 293 aa  161  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  35.08 
 
 		 285 aa  159  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0082  MscS mechanosensitive ion channel  35.54 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0423997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  36.65 
 
 		 308 aa  155  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  37.67 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  37.67 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  37.79 
 
 		 325 aa  152  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1398  MscS Mechanosensitive ion channel  34.88 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  32.78 
 
 		 550 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  38.79 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0039  hypothetical protein  32.62 
 
 		 291 aa  146  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  38.18 
 
 		 356 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_002936  DET1579  mechanosensitive ion channel family protein  34.33 
 
 		 455 aa  144  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.397271  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  36.29 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1324  MscS mechanosensitive ion channel  37.21 
 
 		 458 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00452452  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1456  mechanosensitive ion channel protein  37.21 
 
 		 455 aa  143  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000389307  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  35.59 
 
 		 528 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  35.59 
 
 		 528 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 549 aa  141  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  34.84 
 
 		 454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  35.1 
 
 		 337 aa  139  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1631  MscS mechanosensitive ion channel  35.69 
 
 		 414 aa  139  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 344 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  37.44 
 
 		 350 aa  136  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  34.43 
 
 		 442 aa  136  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  32.12 
 
 		 537 aa  136  5e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  37.34 
 
 		 342 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0409  hypothetical protein  31.73 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0214224  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0420  hypothetical protein  31.73 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.387203  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  34.27 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4456  MscS mechanosensitive ion channel  33.2 
 
 		 550 aa  133  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  36.05 
 
 		 335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4634  MscS Mechanosensitive ion channel  30.14 
 
 		 334 aa  132  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0333987  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  34.88 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  34.88 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0940  MscS Mechanosensitive ion channel  38.35 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.285938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  34.88 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  31.31 
 
 		 342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  30.38 
 
 		 337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  32.12 
 
 		 538 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1363  MscS Mechanosensitive ion channel  38.46 
 
 		 366 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.207761  hitchhiker  0.0000810048 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0104  hypothetical protein  32.75 
 
 		 280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0511133  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  37.31 
 
 		 568 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 283 aa  129  6e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3911  MscS mechanosensitive ion channel  38.31 
 
 		 367 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0128  MscS mechanosensitive ion channel  34.98 
 
 		 275 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1912  MscS mechanosensitive ion channel  33.19 
 
 		 325 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.476783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3795  MscS mechanosensitive ion channel  35 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.840492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  34.2 
 
 		 599 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  33.58 
 
 		 394 aa  127  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3536  MscS mechanosensitive ion channel  33.84 
 
 		 388 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  34.98 
 
 		 336 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4450  MscS mechanosensitive ion channel  33.64 
 
 		 334 aa  125  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0190  small-conductance mechanosensitive channel  32.86 
 
 		 263 aa  125  7e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11550  small-conductance mechanosensitive channel  32.08 
 
 		 316 aa  125  9e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3455  MscS Mechanosensitive ion channel  36.78 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6682  MscS mechanosensitive ion channel  31.62 
 
 		 293 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  38.46 
 
 		 787 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1895  small-conductance mechanosensitive ion channel  38.46 
 
 		 787 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  37.2 
 
 		 792 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1580  MscS mechanosensitive ion channel  31.2 
 
 		 319 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1609  MscS mechanosensitive ion channel  31.2 
 
 		 319 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1634  MscS mechanosensitive ion channel  31.2 
 
 		 319 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2432  MscS Mechanosensitive ion channel  33.62 
 
 		 307 aa  122  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00547938  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2744  MscS mechanosensitive ion channel  35.56 
 
 		 315 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535922  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09010  small-conductance mechanosensitive channel  36.79 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0427247  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  28.42 
 
 		 753 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13121  transmembrane protein  34.81 
 
 		 308 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.609452 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1824  MscS Mechanosensitive ion channel  33.81 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000045049  normal  0.0757476 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  34.55 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  33.16 
 
 		 762 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0901  MscS Mechanosensitive ion channel  33.82 
 
 		 766 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1457  MscS mechanosensitive ion channel  33.77 
 
 		 768 aa  116  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  33.16 
 
 		 771 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3871  MscS mechanosensitive ion channel  31.48 
 
 		 674 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  32.17 
 
 		 273 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1803  MscS Mechanosensitive ion channel  31.07 
 
 		 595 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  0.895337 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0349  MscS Mechanosensitive ion channel  32.74 
 
 		 759 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2634  MscS Mechanosensitive ion channel  35.83 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.218755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>