More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5133 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5133  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 658 aa  1304    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538778  normal  0.147558 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4049  MscS Mechanosensitive ion channel  57.36 
 
 		 650 aa  587  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  44.88 
 
 		 693 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4584  MscS mechanosensitive ion channel  42.59 
 
 		 697 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.99351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5772  MscS mechanosensitive ion channel  55.29 
 
 		 705 aa  360  5e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429261  normal  0.122613 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3228  MscS Mechanosensitive ion channel  38.57 
 
 		 704 aa  352  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3523  MscS Mechanosensitive ion channel  37.8 
 
 		 703 aa  348  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0609886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2401  MscS Mechanosensitive ion channel  36.17 
 
 		 718 aa  330  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0124939 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1971  MscS Mechanosensitive ion channel  35.86 
 
 		 716 aa  313  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170847  normal  0.348628 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1790  MscS Mechanosensitive ion channel  45.13 
 
 		 716 aa  313  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.192721 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3687  MscS mechanosensitive ion channel  47.23 
 
 		 784 aa  213  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276928  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6137  hypothetical protein  46.26 
 
 		 725 aa  206  8e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.119326  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  40.88 
 
 		 773 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1627  MscS mechanosensitive ion channel  41.88 
 
 		 881 aa  187  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2973  MscS Mechanosensitive ion channel  39.92 
 
 		 652 aa  177  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  37.3 
 
 		 787 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  34.51 
 
 		 767 aa  163  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5033  MscS mechanosensitive ion channel  33.7 
 
 		 701 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  34.51 
 
 		 876 aa  162  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  32.95 
 
 		 879 aa  159  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  37.99 
 
 		 822 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  37.99 
 
 		 822 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  37.99 
 
 		 822 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3871  MscS mechanosensitive ion channel  33.45 
 
 		 674 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2784  MscS mechanosensitive ion channel  37.41 
 
 		 801 aa  156  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4477  MscS mechanosensitive ion channel  37.22 
 
 		 772 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3797  MscS mechanosensitive ion channel  35.8 
 
 		 871 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198076  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3278  MscS mechanosensitive ion channel  38.05 
 
 		 864 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0676  mechanosensitive ion channel family protein  36.77 
 
 		 767 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2062  MscS mechanosensitive ion channel  38.64 
 
 		 747 aa  154  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  38.86 
 
 		 821 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4680  MscS mechanosensitive ion channel  40.69 
 
 		 837 aa  153  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  32.04 
 
 		 505 aa  152  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  36.44 
 
 		 735 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  32.97 
 
 		 762 aa  151  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0901  MscS Mechanosensitive ion channel  33.94 
 
 		 766 aa  151  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  35.71 
 
 		 718 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5311  MscS mechanosensitive ion channel  32.47 
 
 		 858 aa  151  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021896 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3072  MscS mechanosensitive ion channel  37.55 
 
 		 773 aa  150  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.718015  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  34.18 
 
 		 719 aa  150  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  35.56 
 
 		 735 aa  150  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0181  MscS mechanosensitive ion channel  34.19 
 
 		 707 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1514  MscS mechanosensitive ion channel  35.23 
 
 		 836 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.767095  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  36.02 
 
 		 771 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1181  hypothetical protein  36.8 
 
 		 884 aa  148  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.40697 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5420  MscS Mechanosensitive ion channel  32.44 
 
 		 889 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  35.62 
 
 		 321 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3104  MscS mechanosensitive ion channel  35.56 
 
 		 790 aa  146  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  32.5 
 
 		 753 aa  146  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0349  MscS Mechanosensitive ion channel  37.44 
 
 		 759 aa  145  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1728  hypothetical protein  37.06 
 
 		 717 aa  144  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784062  normal  0.0313644 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3991  MscS mechanosensitive ion channel  37.06 
 
 		 715 aa  144  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0693455  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2666  MscS Mechanosensitive ion channel  37.13 
 
 		 911 aa  144  8e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232424  normal  0.397707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1320  MscS mechanosensitive ion channel  37.06 
 
 		 717 aa  143  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1457  MscS mechanosensitive ion channel  32.12 
 
 		 768 aa  143  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1224  MscS Mechanosensitive ion channel  34.76 
 
 		 838 aa  139  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  35.39 
 
 		 308 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3068  hypothetical protein  32.97 
 
 		 756 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.36924 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1476  hypothetical protein  35.94 
 
 		 737 aa  132  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1895  small-conductance mechanosensitive ion channel  32.74 
 
 		 787 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  32.74 
 
 		 787 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  33.03 
 
 		 792 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2998  putative mechanosensitive ion channel  33.7 
 
 		 826 aa  131  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  34.09 
 
 		 442 aa  128  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 550 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0186  MscS Mechanosensitive ion channel  32.3 
 
 		 304 aa  127  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1631  MscS mechanosensitive ion channel  30.58 
 
 		 414 aa  127  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  36.46 
 
 		 356 aa  127  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  32.69 
 
 		 337 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3348  MscS Mechanosensitive ion channel  31.94 
 
 		 757 aa  126  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.703913 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  31.35 
 
 		 342 aa  124  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  30.51 
 
 		 335 aa  124  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  31.22 
 
 		 528 aa  124  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  33.48 
 
 		 299 aa  124  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  31.22 
 
 		 528 aa  124  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3001  MscS Mechanosensitive ion channel  31.56 
 
 		 755 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.996341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  35.42 
 
 		 454 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5186  MscS Mechanosensitive ion channel  32 
 
 		 600 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000148025 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1487  MscS mechanosensitive ion channel  35.94 
 
 		 796 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1226  MscS Mechanosensitive ion channel  31.22 
 
 		 569 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  34.98 
 
 		 372 aa  121  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1197  MscS Mechanosensitive ion channel  31.22 
 
 		 569 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  33.48 
 
 		 288 aa  121  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  31.62 
 
 		 294 aa  120  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  36.27 
 
 		 342 aa  120  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  35.48 
 
 		 337 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11550  small-conductance mechanosensitive channel  29.81 
 
 		 316 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  33.83 
 
 		 336 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0940  MscS Mechanosensitive ion channel  30.45 
 
 		 293 aa  116  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.285938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  34.01 
 
 		 344 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00775  predicted mechanosensitive channel  34.62 
 
 		 741 aa  115  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2834  MscS Mechanosensitive ion channel  34.62 
 
 		 741 aa  115  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.269757  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00792  hypothetical protein  34.62 
 
 		 741 aa  115  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  33.68 
 
 		 350 aa  115  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0831  hypothetical protein  34.62 
 
 		 741 aa  115  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0229209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2835  hypothetical protein  34.62 
 
 		 741 aa  115  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.49236  normal  0.59414 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0876  hypothetical protein  34.62 
 
 		 741 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000367014  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0956  hypothetical protein  34.62 
 
 		 741 aa  115  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0640759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  30.46 
 
 		 538 aa  114  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  30.28 
 
 		 568 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>