More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5033 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0676  mechanosensitive ion channel family protein  73.72 
 
 		 767 aa  980    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3871  MscS mechanosensitive ion channel  70.78 
 
 		 674 aa  924    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4477  MscS mechanosensitive ion channel  73.14 
 
 		 772 aa  986    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5033  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 701 aa  1401    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  38.1 
 
 		 876 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  37.29 
 
 		 767 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  36.78 
 
 		 879 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  36.42 
 
 		 718 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  36.44 
 
 		 719 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1728  hypothetical protein  36.55 
 
 		 717 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784062  normal  0.0313644 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1320  MscS mechanosensitive ion channel  36.71 
 
 		 717 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3991  MscS mechanosensitive ion channel  36.55 
 
 		 715 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0693455  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  37.15 
 
 		 787 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  37 
 
 		 735 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  36.83 
 
 		 735 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  37.01 
 
 		 762 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  36.91 
 
 		 771 aa  364  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3001  MscS Mechanosensitive ion channel  37.15 
 
 		 755 aa  349  8e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.996341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3348  MscS Mechanosensitive ion channel  36.69 
 
 		 757 aa  343  4e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.703913 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2062  MscS mechanosensitive ion channel  35.79 
 
 		 747 aa  333  5e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3068  hypothetical protein  37.09 
 
 		 756 aa  306  7e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.36924 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1181  hypothetical protein  31.22 
 
 		 884 aa  223  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.40697 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5420  MscS Mechanosensitive ion channel  31.22 
 
 		 889 aa  221  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  30.56 
 
 		 822 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  30.56 
 
 		 822 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  30.56 
 
 		 822 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0901  MscS Mechanosensitive ion channel  32.6 
 
 		 766 aa  209  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3797  MscS mechanosensitive ion channel  30.73 
 
 		 871 aa  204  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198076  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3278  MscS mechanosensitive ion channel  31.05 
 
 		 864 aa  204  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1514  MscS mechanosensitive ion channel  28.49 
 
 		 836 aa  200  7.999999999999999e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.767095  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5311  MscS mechanosensitive ion channel  29.43 
 
 		 858 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021896 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  30.32 
 
 		 821 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3072  MscS mechanosensitive ion channel  31.48 
 
 		 773 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.718015  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2784  MscS mechanosensitive ion channel  31.42 
 
 		 801 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0181  MscS mechanosensitive ion channel  32.48 
 
 		 707 aa  195  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4680  MscS mechanosensitive ion channel  31.32 
 
 		 837 aa  194  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1224  MscS Mechanosensitive ion channel  30.12 
 
 		 838 aa  184  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  30.6 
 
 		 753 aa  183  8.000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1487  MscS mechanosensitive ion channel  32.78 
 
 		 796 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0349  MscS Mechanosensitive ion channel  30.84 
 
 		 759 aa  181  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2666  MscS Mechanosensitive ion channel  31.27 
 
 		 911 aa  180  9e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232424  normal  0.397707 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  34.34 
 
 		 505 aa  179  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  32 
 
 		 787 aa  178  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1895  small-conductance mechanosensitive ion channel  32 
 
 		 787 aa  177  5e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2998  putative mechanosensitive ion channel  30.56 
 
 		 826 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1457  MscS mechanosensitive ion channel  30.87 
 
 		 768 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3104  MscS mechanosensitive ion channel  32.63 
 
 		 790 aa  170  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  34.19 
 
 		 792 aa  170  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1790  MscS Mechanosensitive ion channel  34.53 
 
 		 716 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.192721 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  38.4 
 
 		 321 aa  164  6e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1971  MscS Mechanosensitive ion channel  34.53 
 
 		 716 aa  163  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170847  normal  0.348628 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  29.2 
 
 		 773 aa  163  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  36.82 
 
 		 693 aa  161  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5133  MscS Mechanosensitive ion channel  36.52 
 
 		 658 aa  159  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538778  normal  0.147558 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3687  MscS mechanosensitive ion channel  34.77 
 
 		 784 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276928  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2401  MscS Mechanosensitive ion channel  35.07 
 
 		 718 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0124939 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 550 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6137  hypothetical protein  34.09 
 
 		 725 aa  150  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.119326  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4049  MscS Mechanosensitive ion channel  35.39 
 
 		 650 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1627  MscS mechanosensitive ion channel  32.03 
 
 		 881 aa  146  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5772  MscS mechanosensitive ion channel  35.14 
 
 		 705 aa  144  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429261  normal  0.122613 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4584  MscS mechanosensitive ion channel  32.3 
 
 		 697 aa  144  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.99351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  34.39 
 
 		 394 aa  144  8e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1476  hypothetical protein  29.45 
 
 		 737 aa  141  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  29.79 
 
 		 568 aa  140  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  32.93 
 
 		 273 aa  140  8.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  34.68 
 
 		 350 aa  140  8.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  37.07 
 
 		 308 aa  137  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0186  MscS Mechanosensitive ion channel  36.27 
 
 		 304 aa  137  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  32.29 
 
 		 528 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  32.29 
 
 		 528 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  34.56 
 
 		 294 aa  133  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  33.8 
 
 		 344 aa  132  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  32.29 
 
 		 299 aa  131  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  36.97 
 
 		 336 aa  131  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  36.54 
 
 		 335 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1579  mechanosensitive ion channel family protein  27.43 
 
 		 455 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.397271  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2973  MscS Mechanosensitive ion channel  29.89 
 
 		 652 aa  128  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  34.89 
 
 		 356 aa  127  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  34.98 
 
 		 454 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  34.6 
 
 		 285 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1456  mechanosensitive ion channel protein  30.28 
 
 		 455 aa  125  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000389307  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4634  MscS Mechanosensitive ion channel  38.57 
 
 		 334 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0333987  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  29.54 
 
 		 289 aa  124  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  31.9 
 
 		 442 aa  124  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  29.36 
 
 		 537 aa  124  8e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2432  MscS Mechanosensitive ion channel  35.98 
 
 		 307 aa  124  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00547938  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  33.65 
 
 		 342 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 325 aa  123  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  31.42 
 
 		 288 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3911  MscS mechanosensitive ion channel  33.49 
 
 		 367 aa  123  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  32.11 
 
 		 549 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  30.49 
 
 		 538 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1363  MscS Mechanosensitive ion channel  35.61 
 
 		 366 aa  122  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.207761  hitchhiker  0.0000810048 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  32.11 
 
 		 372 aa  122  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3536  MscS mechanosensitive ion channel  33.97 
 
 		 388 aa  121  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0082  MscS mechanosensitive ion channel  34.12 
 
 		 303 aa  121  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0423997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  35.29 
 
 		 293 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  35.29 
 
 		 293 aa  120  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  35.29 
 
 		 293 aa  120  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>