More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0544 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1895  small-conductance mechanosensitive ion channel  98.98 
 
 		 787 aa  1524    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 787 aa  1539    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  77.88 
 
 		 792 aa  1001    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2998  putative mechanosensitive ion channel  42.76 
 
 		 826 aa  496  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0349  MscS Mechanosensitive ion channel  40.64 
 
 		 759 aa  469  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0181  MscS mechanosensitive ion channel  38.34 
 
 		 707 aa  431  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1457  MscS mechanosensitive ion channel  37.75 
 
 		 768 aa  427  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3104  MscS mechanosensitive ion channel  37.4 
 
 		 790 aa  418  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0901  MscS Mechanosensitive ion channel  51.26 
 
 		 766 aa  398  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2784  MscS mechanosensitive ion channel  50.89 
 
 		 801 aa  385  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  34.97 
 
 		 753 aa  384  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1476  hypothetical protein  31.88 
 
 		 737 aa  320  7e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3072  MscS mechanosensitive ion channel  45.81 
 
 		 773 aa  291  4e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.718015  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0956  hypothetical protein  30.5 
 
 		 741 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0640759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0831  hypothetical protein  30.5 
 
 		 741 aa  283  8.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0229209  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00775  predicted mechanosensitive channel  30.5 
 
 		 741 aa  281  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2834  MscS Mechanosensitive ion channel  30.5 
 
 		 741 aa  281  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.269757  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2835  hypothetical protein  30.5 
 
 		 741 aa  281  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.49236  normal  0.59414 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00792  hypothetical protein  30.5 
 
 		 741 aa  281  3e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0876  hypothetical protein  30.37 
 
 		 741 aa  281  4e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000367014  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0863  hypothetical protein  30.37 
 
 		 741 aa  280  6e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00697122  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0975  hypothetical protein  30.03 
 
 		 740 aa  280  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0891  hypothetical protein  29.95 
 
 		 740 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0922  hypothetical protein  29.99 
 
 		 740 aa  278  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.493132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0863  hypothetical protein  29.99 
 
 		 740 aa  278  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0954  hypothetical protein  29.81 
 
 		 740 aa  277  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  42.94 
 
 		 505 aa  258  3e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1295  hypothetical protein  38.79 
 
 		 737 aa  243  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.159266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  47.19 
 
 		 321 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1487  MscS mechanosensitive ion channel  37.37 
 
 		 796 aa  206  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  34.28 
 
 		 719 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  32.76 
 
 		 718 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  38.32 
 
 		 787 aa  197  8.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1320  MscS mechanosensitive ion channel  34.22 
 
 		 717 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2666  MscS Mechanosensitive ion channel  34.79 
 
 		 911 aa  196  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232424  normal  0.397707 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  34.8 
 
 		 876 aa  194  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1728  hypothetical protein  33.96 
 
 		 717 aa  193  8e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784062  normal  0.0313644 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3991  MscS mechanosensitive ion channel  33.96 
 
 		 715 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0693455  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  39.63 
 
 		 568 aa  192  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0186  MscS Mechanosensitive ion channel  49.33 
 
 		 304 aa  192  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  35.08 
 
 		 762 aa  191  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  40.21 
 
 		 767 aa  191  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1514  MscS mechanosensitive ion channel  36.98 
 
 		 836 aa  188  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.767095  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3278  MscS mechanosensitive ion channel  33.51 
 
 		 864 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3797  MscS mechanosensitive ion channel  33.51 
 
 		 871 aa  187  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198076  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  38.55 
 
 		 879 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1181  hypothetical protein  31.46 
 
 		 884 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.40697 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  33.82 
 
 		 822 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  33.82 
 
 		 822 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  33.82 
 
 		 822 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  33.84 
 
 		 735 aa  181  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5420  MscS Mechanosensitive ion channel  35.8 
 
 		 889 aa  180  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4477  MscS mechanosensitive ion channel  38.61 
 
 		 772 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3871  MscS mechanosensitive ion channel  35.12 
 
 		 674 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5033  MscS mechanosensitive ion channel  32 
 
 		 701 aa  178  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149124 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  36.46 
 
 		 735 aa  179  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0676  mechanosensitive ion channel family protein  38.61 
 
 		 767 aa  178  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5311  MscS mechanosensitive ion channel  32.85 
 
 		 858 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021896 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4680  MscS mechanosensitive ion channel  40.54 
 
 		 837 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  39.15 
 
 		 771 aa  174  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3068  hypothetical protein  39.62 
 
 		 756 aa  171  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.36924 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  33.23 
 
 		 821 aa  170  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  31.78 
 
 		 773 aa  169  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1224  MscS Mechanosensitive ion channel  33.66 
 
 		 838 aa  168  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3001  MscS Mechanosensitive ion channel  38.05 
 
 		 755 aa  167  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.996341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3348  MscS Mechanosensitive ion channel  38.05 
 
 		 757 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.703913 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2062  MscS mechanosensitive ion channel  41.44 
 
 		 747 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_002936  DET1579  mechanosensitive ion channel family protein  31.78 
 
 		 455 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.397271  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  36.73 
 
 		 294 aa  160  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1627  MscS mechanosensitive ion channel  26.23 
 
 		 881 aa  160  8e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1456  mechanosensitive ion channel protein  35.06 
 
 		 455 aa  160  9e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000389307  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1324  MscS mechanosensitive ion channel  36.28 
 
 		 458 aa  158  4e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00452452  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  32.73 
 
 		 288 aa  158  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  35.77 
 
 		 335 aa  155  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  35.27 
 
 		 693 aa  154  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1790  MscS Mechanosensitive ion channel  33.45 
 
 		 716 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.192721 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1971  MscS Mechanosensitive ion channel  32.77 
 
 		 716 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170847  normal  0.348628 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  38.03 
 
 		 342 aa  151  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  35.44 
 
 		 299 aa  151  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2401  MscS Mechanosensitive ion channel  34.88 
 
 		 718 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0124939 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  35.91 
 
 		 550 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  36.25 
 
 		 299 aa  147  9e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  38.03 
 
 		 308 aa  147  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  37.44 
 
 		 350 aa  145  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  37.39 
 
 		 289 aa  144  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5772  MscS mechanosensitive ion channel  32.78 
 
 		 705 aa  144  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429261  normal  0.122613 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  37.17 
 
 		 394 aa  143  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 336 aa  143  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1398  MscS Mechanosensitive ion channel  36.09 
 
 		 266 aa  142  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  37.67 
 
 		 335 aa  141  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  34.72 
 
 		 344 aa  140  7.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  33.06 
 
 		 538 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  34.63 
 
 		 528 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  34.63 
 
 		 528 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  35.91 
 
 		 327 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  35.91 
 
 		 327 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  35.91 
 
 		 327 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  35.19 
 
 		 599 aa  137  8e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4584  MscS mechanosensitive ion channel  32.76 
 
 		 697 aa  137  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.99351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3687  MscS mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 		 784 aa  134  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276928  normal  0.239632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>