More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2062 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2062  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 747 aa  1441    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  49.8 
 
 		 787 aa  630  1e-179  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  41.36 
 
 		 719 aa  530  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1320  MscS mechanosensitive ion channel  40.63 
 
 		 717 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  40.5 
 
 		 718 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  41.15 
 
 		 735 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  41.34 
 
 		 735 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1728  hypothetical protein  40.34 
 
 		 717 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784062  normal  0.0313644 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3991  MscS mechanosensitive ion channel  40.4 
 
 		 715 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0693455  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  39.53 
 
 		 767 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  40.44 
 
 		 876 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  40.06 
 
 		 879 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  36.1 
 
 		 762 aa  365  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5033  MscS mechanosensitive ion channel  35.65 
 
 		 701 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149124 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  35.17 
 
 		 771 aa  355  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3348  MscS Mechanosensitive ion channel  37.45 
 
 		 757 aa  347  6e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.703913 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3001  MscS Mechanosensitive ion channel  37.22 
 
 		 755 aa  344  4e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.996341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4477  MscS mechanosensitive ion channel  33.03 
 
 		 772 aa  336  9e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0676  mechanosensitive ion channel family protein  32.83 
 
 		 767 aa  335  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3871  MscS mechanosensitive ion channel  33.93 
 
 		 674 aa  331  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3068  hypothetical protein  38.36 
 
 		 756 aa  321  3e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.36924 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  36.06 
 
 		 822 aa  207  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  36.06 
 
 		 822 aa  207  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  36.06 
 
 		 822 aa  207  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3278  MscS mechanosensitive ion channel  35.97 
 
 		 864 aa  204  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3797  MscS mechanosensitive ion channel  36.22 
 
 		 871 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198076  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  38.89 
 
 		 821 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5420  MscS Mechanosensitive ion channel  35.28 
 
 		 889 aa  188  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0181  MscS mechanosensitive ion channel  31.24 
 
 		 707 aa  187  5e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5311  MscS mechanosensitive ion channel  36.65 
 
 		 858 aa  185  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021896 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  32.07 
 
 		 753 aa  185  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0901  MscS Mechanosensitive ion channel  27.7 
 
 		 766 aa  184  6e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1181  hypothetical protein  35.63 
 
 		 884 aa  183  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.40697 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1895  small-conductance mechanosensitive ion channel  34.61 
 
 		 787 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0349  MscS Mechanosensitive ion channel  28.65 
 
 		 759 aa  182  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3072  MscS mechanosensitive ion channel  33.09 
 
 		 773 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.718015  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2784  MscS mechanosensitive ion channel  30.74 
 
 		 801 aa  181  5.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  32.17 
 
 		 505 aa  180  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  34.35 
 
 		 787 aa  179  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1514  MscS mechanosensitive ion channel  37.01 
 
 		 836 aa  177  5e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.767095  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3104  MscS mechanosensitive ion channel  30.88 
 
 		 790 aa  176  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4680  MscS mechanosensitive ion channel  43.21 
 
 		 837 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  39.91 
 
 		 321 aa  174  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  38.75 
 
 		 792 aa  174  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2666  MscS Mechanosensitive ion channel  35.94 
 
 		 911 aa  173  9e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232424  normal  0.397707 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1457  MscS mechanosensitive ion channel  32.4 
 
 		 768 aa  167  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5133  MscS Mechanosensitive ion channel  38.24 
 
 		 658 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538778  normal  0.147558 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1224  MscS Mechanosensitive ion channel  31.18 
 
 		 838 aa  161  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2998  putative mechanosensitive ion channel  30.83 
 
 		 826 aa  160  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1971  MscS Mechanosensitive ion channel  33.45 
 
 		 716 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170847  normal  0.348628 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1487  MscS mechanosensitive ion channel  37.72 
 
 		 796 aa  152  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  31.87 
 
 		 568 aa  152  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  34.68 
 
 		 273 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5772  MscS mechanosensitive ion channel  35.32 
 
 		 705 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429261  normal  0.122613 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1790  MscS Mechanosensitive ion channel  32.58 
 
 		 716 aa  148  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.192721 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  34.38 
 
 		 693 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  32.7 
 
 		 394 aa  146  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4049  MscS Mechanosensitive ion channel  35.45 
 
 		 650 aa  147  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4584  MscS mechanosensitive ion channel  34.94 
 
 		 697 aa  144  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.99351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  35.55 
 
 		 288 aa  144  8e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  33.2 
 
 		 550 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1627  MscS mechanosensitive ion channel  29.45 
 
 		 881 aa  140  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  38.79 
 
 		 342 aa  140  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  34.72 
 
 		 528 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  34.72 
 
 		 528 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3687  MscS mechanosensitive ion channel  35.09 
 
 		 784 aa  139  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276928  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  29.47 
 
 		 773 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6137  hypothetical protein  29.01 
 
 		 725 aa  138  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.119326  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2401  MscS Mechanosensitive ion channel  33.02 
 
 		 718 aa  138  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0124939 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1363  MscS Mechanosensitive ion channel  34.78 
 
 		 366 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.207761  hitchhiker  0.0000810048 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  30.23 
 
 		 289 aa  134  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  34.24 
 
 		 342 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  37.9 
 
 		 350 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0186  MscS Mechanosensitive ion channel  31.8 
 
 		 304 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3228  MscS Mechanosensitive ion channel  32.1 
 
 		 704 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  32.42 
 
 		 537 aa  129  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  28.98 
 
 		 549 aa  127  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  31.36 
 
 		 538 aa  127  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  30.94 
 
 		 299 aa  127  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  36.15 
 
 		 344 aa  127  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1226  MscS Mechanosensitive ion channel  35.02 
 
 		 569 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  30.96 
 
 		 356 aa  127  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3523  MscS Mechanosensitive ion channel  31.53 
 
 		 703 aa  126  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0609886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  31.18 
 
 		 294 aa  126  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1197  MscS Mechanosensitive ion channel  35.02 
 
 		 569 aa  126  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  32.34 
 
 		 442 aa  126  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  34.8 
 
 		 327 aa  126  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  34.8 
 
 		 327 aa  126  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  32.86 
 
 		 336 aa  125  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  30.48 
 
 		 308 aa  125  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  31.98 
 
 		 283 aa  125  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  33.49 
 
 		 370 aa  125  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1476  hypothetical protein  29.31 
 
 		 737 aa  124  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  35.71 
 
 		 327 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1398  MscS Mechanosensitive ion channel  36.18 
 
 		 266 aa  124  6e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0940  MscS Mechanosensitive ion channel  33.21 
 
 		 293 aa  124  6e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.285938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  35.21 
 
 		 337 aa  124  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  30.47 
 
 		 325 aa  123  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  36.09 
 
 		 336 aa  123  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  34.26 
 
 		 454 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>