More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1833 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 394 aa  779    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  46.51 
 
 		 350 aa  251  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  48.61 
 
 		 344 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  39.36 
 
 		 537 aa  189  8e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  39.6 
 
 		 550 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  40.7 
 
 		 528 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  40.7 
 
 		 528 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  40.85 
 
 		 538 aa  182  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_002936  DET1579  mechanosensitive ion channel family protein  41.22 
 
 		 455 aa  177  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.397271  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  41.78 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1324  MscS mechanosensitive ion channel  42.92 
 
 		 458 aa  176  6e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00452452  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1456  mechanosensitive ion channel protein  42.48 
 
 		 455 aa  176  6e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000389307  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  42.08 
 
 		 335 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  38.11 
 
 		 356 aa  175  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  42.55 
 
 		 599 aa  174  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 442 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  34.69 
 
 		 753 aa  171  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  39.56 
 
 		 454 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0349  MscS Mechanosensitive ion channel  33.43 
 
 		 759 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1803  MscS Mechanosensitive ion channel  32.7 
 
 		 595 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  0.895337 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  39.27 
 
 		 289 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  43.9 
 
 		 372 aa  163  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4634  MscS Mechanosensitive ion channel  38.89 
 
 		 334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0333987  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3072  MscS mechanosensitive ion channel  38.57 
 
 		 773 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.718015  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0901  MscS Mechanosensitive ion channel  35.58 
 
 		 766 aa  162  9e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 		 321 aa  162  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  36.06 
 
 		 308 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  40.99 
 
 		 327 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  40.99 
 
 		 327 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3795  MscS mechanosensitive ion channel  41.15 
 
 		 313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.840492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  40.99 
 
 		 327 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  42.4 
 
 		 285 aa  156  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  33.55 
 
 		 787 aa  156  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  36.94 
 
 		 879 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  32.03 
 
 		 767 aa  154  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  38.25 
 
 		 342 aa  153  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  30.54 
 
 		 822 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  30.54 
 
 		 822 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  30.54 
 
 		 822 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13451  putative mechanosensitive ion channel, MscS family protein  33.46 
 
 		 656 aa  152  8e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  36.49 
 
 		 876 aa  152  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  36.91 
 
 		 735 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0676  mechanosensitive ion channel family protein  38.39 
 
 		 767 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  38.36 
 
 		 568 aa  151  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  36.91 
 
 		 735 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1224  MscS Mechanosensitive ion channel  32.05 
 
 		 838 aa  151  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1457  MscS mechanosensitive ion channel  34.88 
 
 		 768 aa  151  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  43.5 
 
 		 293 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 718 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  43.5 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  43.5 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  43.5 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 719 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0186  MscS Mechanosensitive ion channel  38.24 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  43.5 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  43.5 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  43.05 
 
 		 293 aa  150  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  36.32 
 
 		 505 aa  150  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  43.3 
 
 		 285 aa  150  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1487  MscS mechanosensitive ion channel  38.67 
 
 		 796 aa  149  7e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  36.67 
 
 		 336 aa  149  7e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5186  MscS Mechanosensitive ion channel  33.75 
 
 		 600 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000148025 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  35.66 
 
 		 792 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2784  MscS mechanosensitive ion channel  33.59 
 
 		 801 aa  149  8e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  42.6 
 
 		 293 aa  149  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3911  MscS mechanosensitive ion channel  38.43 
 
 		 367 aa  149  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  42.6 
 
 		 293 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  37.27 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  37.27 
 
 		 288 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4477  MscS mechanosensitive ion channel  37.91 
 
 		 772 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  35.94 
 
 		 325 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3871  MscS mechanosensitive ion channel  33.83 
 
 		 674 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1197  MscS Mechanosensitive ion channel  35.91 
 
 		 569 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1226  MscS Mechanosensitive ion channel  35.91 
 
 		 569 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1514  MscS mechanosensitive ion channel  33.09 
 
 		 836 aa  146  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.767095  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0181  MscS mechanosensitive ion channel  30.89 
 
 		 707 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  33.93 
 
 		 283 aa  145  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  38.71 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2666  MscS Mechanosensitive ion channel  31.88 
 
 		 911 aa  145  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232424  normal  0.397707 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  33.71 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3536  MscS mechanosensitive ion channel  37.04 
 
 		 388 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3104  MscS mechanosensitive ion channel  31.6 
 
 		 790 aa  145  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1895  small-conductance mechanosensitive ion channel  37.17 
 
 		 787 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  38.07 
 
 		 294 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  37.33 
 
 		 299 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  30.83 
 
 		 821 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  34.55 
 
 		 370 aa  144  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  38.81 
 
 		 337 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5033  MscS mechanosensitive ion channel  34.39 
 
 		 701 aa  143  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149124 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  37.17 
 
 		 787 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3797  MscS mechanosensitive ion channel  30.14 
 
 		 871 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198076  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1320  MscS mechanosensitive ion channel  32.01 
 
 		 717 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3278  MscS mechanosensitive ion channel  29.53 
 
 		 864 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1728  hypothetical protein  32.58 
 
 		 717 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784062  normal  0.0313644 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3991  MscS mechanosensitive ion channel  32.58 
 
 		 715 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0693455  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2744  MscS mechanosensitive ion channel  40.09 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535922  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  33.84 
 
 		 309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  33.48 
 
 		 693 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5420  MscS Mechanosensitive ion channel  29.89 
 
 		 889 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  35.14 
 
 		 771 aa  138  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>